Results for 1add-1-AS


1add-1-AS    : TPAFNKPKVELHVHLDGAIKPETILYFGKKRGIALPADTVEELRNIIGMDKPLSLPGFLAKFDYYMPVIAGCREAIKRIAYEFVEMKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVDPMPWNQTEGDVTPDDVVDLVNQGLQEGEQAFGIKVRSILCCMRHQPSWSLEVLELCKKYNQKTVVAMDLAGDETIEGSSLFPGHVEAYEGAVKNGIHRTVHAGEVGSPEVVREAVDILKTERVGHGYHTIEDEALYNRLLKENMHFEVCPWSSYLTGAWDPKTTHAVVRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKKDMGFTEEEFKRLNINAAKSSFLPEEEKKELLERLYREYQ : S73031
S73031       : .............MLD..IAGQVGYDR.......LPTDVESLETWFRTASHSGSLERYLEPFSHTVAVMQT.PEALHRVAYECVEDLAADSVVYAEVRFAPELHIDEGLS...........FDEVLASVLA.GFADGERANAITVRCLVTAMR.HAAMSREIAELAIRFRDKGVVGFDIAGAEAGHPPTRH...LDAFEYMRSNNARFTIHAGEAFGLPSIHEAIAFCGADRLGHGVRIVDDIIRLGPLASKRIPLELCPSSNLQTGAVASITEHPFDLLAWARFRVTVNTDNRLMSDTSMSLEMHRLVEAFGYGWGDLERFTINAMKSAFIPFDQRLAIIDEVIKPRF : ADD_ECOLI
ADD_ECOLI    : MIDTTLPLTDIHRHLDGNIRPQTILELGRQYNISLPQSLETLIPHVQVIANEPDLVSFLTKLDWGVKVLAS.LDACRRVAFENIEDAARHGLHYVELRFSPGYMAMAHQLP..........VAGVVEAVID.GVREGCRTFGVQAKLIGIMSRFEAACQQELEAFLAHRDQ..ITALDLAGDELGFPGSLF...LSHFNRARDAGWHITVHAGEAAGPESIWQAIRELGAERIGHGVKAIEDRALMDFLAEQQIGIESCLTSNIQTSTVAELAAHPLKTFLEHGIRASINTDDPGVQGVDIIHEYTVAAPAAGLSREQIRQAQINGLEMAFLSAEEKRALREKVAAK.. : CELC06G32
CELC06G32    : HERLNFPKVELHLHLDGAVRFDTLIDLSQQKGIPLAAKTVEELKKVLVTHEPANLSKVLEAFEIFLPVIRGDLAAIERVAYELCEDQHNNGVVYFEGRYSPHLLLCNDYP.........EVTAAHVVAAVKKGFDRGEKQFGIKARSILCCIRLDKKFPQLILDLATDLKQLGVVAIDVAGSAHGADEQYEPEVVAAFQEAHKRGIHRTVHAGESGGPKEVIKAIEDMYAERIGHGYRVMRDEEMYLEHFVKNVHLEACPYSSVMTGAVPLDWKHPIARWAKDDVNFSVSRDDPTCFDNSMLSELTLVHKQIGLDVHQLWKAQLNAARSCFLPEDEKAELVKRVEAGEP : ADD_STRVG
ADD_STRVG    : RDLTLLPKAHLHLHFTGSMRPSTLLELADKYGVRLPALTAGEPPKLRATDERG.WFRFQRLYDAARSCLRE.PDDIRRLVREAAEEDVRDGSGWLEIQVDPTSYAPLLGG...........MIPAVEIILD.AVDAASRETGLGMRVLIAANRKHPLDARTLARLAVRYADRGIVGFGLSNDERRGMARDF...DRAFAIAREGGLLAAPHGGELTGPSSVRDCLDDLHASRIGHGVRAAEDPRLLKRLADRQITCEVCPASNVALGVYERPEDVPLRTLFEAGVPMALGADDPLLFGSRLAAQYEIARRHHAFTDTELAELARQSVRGSAAPDDVQAKLLAGIDHWLT : ADA_YEAST
ADA_YEAST    : EFLQELPKCEHHLHLEGTLEPDLLFPLAKRNDIILPGFPKSVEELNEKYKKFRDLQDFLDYYYIGTNVLIS.EQDFFDLAWAYFKKVHKQGLVHAEVFYDPQSHTSRGIS............IETVTKGFQRACDKAFSEFGITSKLIMCLLRIEPEECLKTIEEATPFIKDGISALGLDSAEKPFPPHLF...VECYGKAASLNLKLTAHAGEEGPAQFVSDALDLLQVTRIDHGINSQYDEELLDRLSRDQTMLTICPLSNVKLQVVQSVSELPLQKFLDRDVPFSLNSDDPAYFGGYILDVYTQVSKDFPHWDHETWRIAKNAIKGSWCDDKRKNGLLSRVDEVVT : 

             : 4---------14--------24--------34--------44--------54--------64--------74--------84--------94--------104-------114-------124-------134-------144-------154-------164-------174-------184-------194-------204-------214-------224-------234-------244-------254-------264-------274-------284-------294-------304-------314-------324-------334-------344------ :
OrigSeq      : TPAFNKPKVELHVHLDGAIKPETILYFGKKRGIALPADTVEELRNIIGMDKPLSLPGFLAKFDYYMPVIAGCREAIKRIAYEFVEMKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVDPMPWNQTEGDVTPDDVVDLVNQGLQEGEQAFGIKVRSILCCMRHQPSWSLEVLELCKKYNQKTVVAMDLAGDETIEGSSLFPGHVEAYEGAVKNGIHRTVHAGEVGSPEVVREAVDILKTERVGHGYHTIEDEALYNRLLKENMHFEVCPWSSYLTGAWDPKTTHAVVRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKKDMGFTEEEFKRLNINAAKSSFLPEEEKKELLERLYREYQ :OrigSeq
cons         : ---------EEEEE--------HEHHHHHH---------HHHHHHEEE------HHHHHHH----EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-----EE-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHH----EEEEE--------------HHHHHHHHHHH---EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH---EEEE------------------HHHHH-----EEE-------------HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---- :cons
dsc          : ----------EEEE--------HHHHHHHH------HHHHHHHHHEEE------HHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----EEE-------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHH----EEEEE----------------HHHHHHHHH--EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH---EEE-----------------HHHHHH---------------------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH---- :dsc
mul          : -------HHHHHHHHH---H--HHHHH------------HHHHHHHHH------HHHHHHH--HHHEEHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE------------------------HHHHHHHHHH-H-HHHHHHH----EEH-HHHH----HHHHHHHHHHHH----EEEE-----------------HHHHHHH-----EEEE----------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH-HEEE---------EE-------HHHHHH--------------HHH-HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-------H---HHHHHHHHHH--- :mul
nnssp        : ----------EEE--------HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-----EE---HHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE-------------HHHHHHHHHHHH----EEEE-------HHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHH----EEE------------------HHHHHH----EEE-----------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH- :nnssp
phd          : --------EEEEEE---------E---------EE----------EEE------HHHHH-----EEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE----EEE--------------HHHHHHHHHHH------------EEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-------------HHHHHHHHHHH---EEEE--------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----EEEEE------EE---------HHHHH----EEEE-------------HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---- :phd
pred         : ---------EEEEE--------EEEE------------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHH--EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEEE---------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---EEEEEE--------------HHHHHHHHHHH---EEEE---------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHEEE-------------------HHHHH-----------------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred        : --------HHHHHHH-----EEEEEH-------EEE---HHHHHHHHHH------HHHEEH---HEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE------EE-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHH--HHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEHHHH-------------HHHHHHHHHHHHEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH----EEEHHHHHHHHHHHHHEEEEEE---EEEEEEE----HHHHHHHHH---EEEE---EEEEEEEE-HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH--- :zpred


access       : EE-EE-EEBEBBB-BEEEBEBEBBBEBBEE-BBEBEEE-EE--EEBEBBEEE-EB-EBBEBBEBBBBBBBEB-EBBEEBB-EBBEE-BEEBBBBBEB-B-EEBBBE-E--E-E-EEEEEEBBBEBBBBBBEEBBEEB-EEBBBEBEBBBBBBE-EEE-BEEBBEBBBE-EEEBBBBBEBBEEEEE-EEE--EEBBEBBEEB-EEBBEBBBEBEEEEEEEBBBEBBEEB-BE-BEEBBEBBEEEEBBEEBBEEEBBBEBB--BEBBBBBBEEBEE-BBEEBBEEEBEBBBEEEEE-BBEB-BBBEB-BBBE-BE-E-EEB-EBB-EBBEBBBBEEEEEEEBBEEB-EE-E : access

PHD Rel      : 8886888517887415665430010223456612135320111201214667426776312211145422467899999998998874589458998526831353258887677887632354544555311131100245224777653124533689999999984588268876167445888778842799999986268546742455899636899999997764177532245578999863235047761554332111333366515654245611465689862255432124455533127666799999998765358864799999997522699 : PHD Rel
Pred Rel     : 0088897655585558968896676687766850798865868888765799896568788566566666678889999999999987769589886679900556568999999997887886678777866787686588657677088888676668999999886776679885677798889988760088788887699666557888999966888998888555679877557878899998767756878999776657778888767577577876087890998766766657887788696668998999878758867778899999997777000 : Predator Rel


dssp         : -------EEEEEEEHHH---HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH-------HHHH--HHHH-HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEEE--HHH--------HHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEEEE------HHHHHHHHHH-E---EEEEEEE-------HHH-HHHHHHHHHHHHH--EEEEEE-----HHHHHHHHH-----EEEE-HHHHH-HHHHHHHHH---EEEE-HHHHHH----------HHHHHHH---EEEE--E-HHHH---HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-- :dssp
define       : -----EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE--HHHHHHHHHH--EEEEHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEHHHHHH---------EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHH--EEEE-EEEEE--------HHHHHHHHHHHHHHEEEEEE------HHHHHHHHHHH---EEEEE------HHHHHHHHHHHEEEEE-HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH--------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH :define
stride       : -------EEE--EEHHH---HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEE-HHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-----------HHHHHHHHHHHHH--EEEEEE-----HHHHHHHHHH----EEEE---HHH-HHHHHHHHHH--EEEE-HHHHHHH---------HHHHHHHH---EEE--E--------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH- :stride


Q3 values for 1add-1-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	69.34	58.17	71.92
dsc	73.64	60.74	74.50
pred	69.34	62.18	71.92
mul	68.77	62.46	71.92
nnssp	78.80	66.76	81.66
zpred	64.76	60.17	67.05
cons	77.08	63.61	80.23