Results for 1aorb-3-AS


1aorb-3-AS    : VAGGGLPKYGTAVLVNIINENGLYPVKNFQTGVYPYAYEQSGEAMAAKYLVRNKPCYACPIGCGRVNRLPTVGETEGPEYESVWALGANLGINDLASIIEANHMCDELGLDTISTGGTLATAMELYEKGHIKDEELGDAPPFRWGNTEVLHYYIEKIAKREGFGDKLAEGSYRLAESYGHPELSM : TLFORPKPF2
TLFORPKPF2    : GRAAGRPRQGTMAAVEWTNENSALPTRNFSDGSFEFARSIDGYTMEGMKVKQ.RGCPYCNMPCGNVVLDAEGQESE.LDYENVALLGSNLGIGKLNEVSVLNRIADEMGLDTISLGVAISYVMEAKEKGIIKDD...DAPEF..GDFKKAKQLALDIAYRRGLGNLAAEGVKVMSEKLGAKDFAM : TLFORPKPF2

              : 233-------243-------253-------263-------273-------283-------293-------303-------313-------323-------333-------343-------353-------363-------373-------383-------393-------403-------413-- :
OrigSeq       : VAGGGLPKYGTAVLVNIINENGLYPVKNFQTGVYPYAYEQSGEAMAAKYLVRNKPCYACPIGCGRVNRLPTVGETEGPEYESVWALGANLGINDLASIIEANHMCDELGLDTISTGGTLATAMELYEKGHIKDEELGDAPPFRWGNTEVLHYYIEKIAKREGFGDKLAEGSYRLAESYGHPELSM :OrigSeq
cons          : ----------EEEEEEEE-----------------------HHHHHHHHHHH---------------------------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-------- :cons
dsc           : -------HHHHHHHHHHHH--------HH-----HHHHHHHHHHHHHHHH----------------------------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH-----HH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------- :dsc
mul           : -----------EEEHH---------------------------HHHHHHH---------------EEE------------HHHHHH-----------HHHHHHHH-HH----E-----EHHHHHHH-HHHHH-----------------HHHHHHHHH---------------HH------HHHH :mul
nnssp         : ------------EEEE---------------------------HHHHHHHH------------------------------HHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH------EE :nnssp
phd           : ----------EEEEEEEE-----------------------HHHHHHHHHHH------E-------E------------HHHHHHHH---------EEEEHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-------- :phd
pred          : ------------EEEEEE-------------------HHHHHHHHHHHHHHH------------------------------------------HHHHHHH----------EEE---HHHHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-------- :pred
zpred         : E-------EEEEEEEEEH-------EEEE------EEH--HHHHHHHHHH--------EEE--EEEEEE---------HHHHHHHHH---EE--EEHHHHHHHHHHHHHHHEEEE---EHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred


access        : EEEEE-EEEBBBBBBEBBEEEBB-BBEEBEEBBBEBB-EBEEEBBEBBEB-EEEEBBBBBBEBB-BBBBBE-EEEEE-E-EBBBBBBBEBBBEEBBEBBBBB-BBEEBBBEBBBBBBBBBBBBEBEEEB-BEEEEBEEBBEB--EEBEBBEEBBBEBBEEEEBEEEBBEBBE-BBEE-E-EEBBE : access

PHD Rel       : 98889877652689873156764753335688311220222346765243456876331488652111367788889521333786124577754213312433421598631112269999999995472235779998566772589999999999986121147541166543137322489 : PHD Rel
Pred Rel      : 00000999766669999600999978688897967555656889899987878890870999987750888988989970655778677888778868757787677697666060788799999899778677689999979999658779999999996909766768877768779999000 : Predator Rel


dssp          : HHH-HHHHH-HHHHHHHHHH-----E----E-----HHHH-HHHHHHH-EEEEE---------EEEEEE---EEEE---HHHHHHH-HHH----HHHHHHHHHHHHHH-E-HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH-----------HHHHHHHHHHH-----HHHH---HHHHHH----HHH-- :dssp
define        : -------------HHHHHHHHH---------EEEEHHHHHHHHHHHHHH--EEEE-------EEEEEEE---------HHHHHHHHH---EEEEHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHH--------HHHHHH-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH------ :define
stride        : ----HHHHH-HHHHHHHHHHH----E----E-----HHHH-HHHHHHHHEEEEE---------EEEEEE---EEEE---HHHHHHH-HHH----HHHHHHHHHHHHHH-E-HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHH-----------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHH--HHHHHHH---HHH-- :stride


Q3 values for 1aorb-3-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	60.00	63.24	64.32
dsc	62.70	71.35	68.11
pred	57.30	58.38	58.38
mul	58.38	54.05	58.38
nnssp	61.62	62.70	63.78
zpred	54.59	63.78	58.38
cons	62.70	65.95	67.03