Results for 1bam-1-AS


1bam-1-AS    : MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNGVVPIKELCYTLLEDTYNWYREKPIDVYKEFIENSELKRVGMEFETGNISSAHRSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLTDRVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPKGSDGMSKRSIKKWKDKVENK : T2BA_BACAM
T2BA_BACAM   : MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNGVVPIKELCYTLLEDTYNWYREKPIDVYKEFIENSELKRVGMEFETGNISSAHRSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLTDRVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPKGSDGMSKRSIKKWKDKVENK : AZUR_ALCSP

             : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------94--------104-------114-------124-------134-------144-------154-------164-------174-------184-------194-------204------- :
OrigSeq      : MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNGVVPIKELCYTLLEDTYNWYREKPIDVYKEFIENSELKRVGMEFETGNISSAHRSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLTDRVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPKGSDGMSKRSIKKWKDKVENK :OrigSeq
cons         : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------EEE-------------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-HHHH--HEEEE-----HHHHHHHHHHHHH------EEEEH--HHHHHHHHHHHHH-HHH---HHHH-----EEEEEE--------------------HHHHHHHHHHH--- :cons
dsc          : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------EEE-------------HHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHEEE------HHHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHH-----HHHHHH------------EEEEE--------------------HHHHHHHHH------ :dsc
mul          : ---HHHHHHHHHHHHHH---HHHH--------EE----------------------EEE-HH------H-----------HHH-HHHH----HHHHHH-------H------HHHHH----HHHHHHHHH----EEEEE----HHHHHH-----------EEEE--------------------HHHH-HHHHHHHHH-- :mul
nnssp        : HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH--------------EEEEE-----------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-------EEEE------HHHHHHHHHHHHH------EEEEE--HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----EEEEEE--------------------HHHHHHHHHHHHH- :nnssp
phd          : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEE---------EE-------------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH--HHHH----EEE-----HHHHHHHHHHH--------EEEE---HHHHHHHHHHHH--------EEEE-----EEEEEE--E-----------------HHHHHHHHHHH--- :phd
pred         : --------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH------------EEEEE--------------EEEEEE------------EEEEHHHHHH--HHHHHEEE-------HHHHHHHEEE----EEEHHHHH----HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE---------EEE--------HHHHHHHHHHH--- :pred
zpred        : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEE---------EEE---------EEEEEEEEEEEEH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE---HHHHHHHHHHH----EEEE----------EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred


access       : EEBEEEBBEEEBEEBBEEEEBBEEB-EEBEBBBBBBBBEEBBEEBBBEEEEE-BEBBBBBEEBBBBBBEEBBE-BEEEBBEBBEEBBEEBEBEEBBBEBEBBEBBBBBEBBBEBBBBBEEBEBBBBBBBBBBEBBBBBBBEEBEEBEEBEE-BEBEEE-BBBBBBBBBEB-EEEBEBBEEBEEEBBEEBBEEBEEEBEEE : access

PHD Rel      : 93232333799999972269999999985203441254578851185176667899644346767867886778623616699997431353447507635994437999999993245764133542132799999988773121223101320469516898221113599977422799883457899988754489 : PHD Rel
Pred Rel     : 00666608899009999698990000889555809888899000670879899999067565858878577756088996557788777600898865878898655679660775779766567766076865067835878507500550053899985978888806899900009799907778878997667000 : Predator Rel


dssp         : -EEEEEEE-HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH---E------EEEE------E--HHHHHHHHHHHHHHH--EE-----EEEEEEE--EEEEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE-HHHH--E------HHHHHHHHHHH----EEEEEEE--EEE--------------HHHHHHHHHHHH-- :dssp
define       : -----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE-----EEEEE-----EEEEHHHHHHHHHHHHHH-EEEEE-----EEEE----EEEEEEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE-HHHHHHHH-----HHHHHH-HHHHHH---EEEEEE---EEEEEEEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHH- :define
stride       : -EEEEEEE-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH--E------EEEE--------HHHHHHHHHHHHHHHH--EE-----EEEEEEE--EEEEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-HHHHH--------HHHHHHHHHHH----EEEEEEE--EEE--------------HHHHHHHHHHHH-- :stride


Q3 values for 1bam-1-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	60.00	55.50	60.50
dsc	60.50	53.00	61.00
pred	58.50	53.50	58.50
mul	49.00	39.50	48.50
nnssp	71.50	62.00	71.50
zpred	51.00	51.00	52.00
cons	67.50	59.50	67.50