Results for 1cei-1-GJB


1cei-1-GJB    : LKNSISDYTEAEFVQLLKEIEKENVAATDDVLDVLLEHFVKITEHPDGTDLIYYPSDNRDDSPEGIVKEIKEWRAANGKPGFKQG : I40691
I40691        : LKKSIGDYTETEFKKFIEDIIN..CEGDEKKQDDNLEYFINVTEHPSGSDLIYYPEGNNDGSPEGVIKEIKEWRAANGKSGFKQG : IMM2_PSEAE
IMM2_PSEAE    : MKSKISEYTEKEFLEFVKDIYTNNKFPTEESHIQAVLEFKKLTEHPSGSDLLYYPNENREDSPAGVVKEVKEWRASKGLPGFKAG : S30272
S30272        : IKNNLSDYTESEFLEIIEEFFKNKGSELEKRMDKLVKHFEEVTSHPRKSGVIFHPKPG.FETPEGIVKEVKEWRAANGLPGFKAG : IMM2_ECOLI
IMM2_ECOLI    : LKHSISDYTEAEFLEFVKKICRAEGATEEDDNK.LVREFERLTEHPDGSDLIYYPRDDREDSPEGIVKEIKEWRAANGKSGFKQG : IMM9_ECOLI
IMM9_ECOLI    : LKHSISDYTEAEFLQLVTTICNADTSSEEELVK.LVTHFEEMTEHPSGSDLIYYPKEGDDDSPSGIVNTVKQWRAANGKSGFKQG : TX50_DENJA

              : 3---------13--------23--------33--------43--------53--------63--------73--------83--- :
OrigSeq       : LKNSISDYTEAEFVQLLKEIEKENVAATDDVLDVLLEHFVKITEHPDGTDLIYYPSDNRDDSPEGIVKEIKEWRAANGKPGFKQG :OrigSeq
cons          : -------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-------EEEE---------HHHHHHHHHHHHH--------- :cons
dsc           : -------HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---------EEE------------HHHHHHHHHHH--------- :dsc
mul           : ---------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH--------EEE------------HHHHHHHHHHH--------- :mul
nnssp         : ---------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-------EEEE---------HHHHHHHHHHHHH--------- :nnssp
phd           : -------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH------EEEE---------HHHHHHHHHHHHHH-------- :phd
pred          : -------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEE------------HHHHHHHHHH---------- :pred
zpred         : HH-----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEE---------HHHHHHHHHHHHH-----EEE- :zpred

access : EEEEBEE-BEEEBBEBBEEBBEEEEEEEEEEBEEBBE-BEEBBE-EEEBEBBBBBEEEEEE-EEEBBEEBEEB-BBEEEEEBEEE : access PHD Rel : 9777775179999999999995277883145789999889852278998358724789887822689999999999258786699 : PHD Rel Pred Rel : 0077777659099909999886676668668998978885555800007789000999900907008899990980990990000 : Predator Rel

dssp : ----HHH-EHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH------HHHH---------HHHHHHHHHHHHHH------E-- :dssp define : --------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE :define stride : ----HHH--HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH-------- :stride
Q3 values for 1cei-1-GJB View SS in Rasmol dssp define stride phd 82.35 78.82 83.53 dsc 78.82 70.59 77.65 pred 75.29 68.24 74.12 mul 80.00 70.59 80.00 nnssp 84.71 75.29 84.71 zpred 76.47 71.76 72.94 cons 83.53 75.29 82.35