Results for 1colb-1-DOMAK


1colb-1-DOMAK    : AKDERELLEKTSELIAGMGDKIGEHLGDKYKAIAKDIADNIKNFQGKTIRSFDDAMASLNKITANPAMKINKADRDALVNAWKHVDAQDMANKLGNLSKAFKVADVVMKVEKVREKSIEGYETGNWGPLMLEVESWVLSGIASSVALGIFSATLGAYALSLGVPAIAVGIAGILLAAVVGALIDDKFADALNNEIIR : I41024
I41024           : AKDALEQVKDSVDTMVGFYQYITEQYGEKYSRIAQDLAEKAK...GSKFNSVDEALAAFEKYKNVLDKKFSKVDRDDIFNALESITYDEWAKHLEKISRALKVTGYLSFGYDVWDGTLKGLKTGDWKPLFVTLEKSAVDFGVAKIVALMFSFIVGAPLGFWGIAIITGIVS.........SYIGDDELNKLNELLG. : SYNCOLCTAP
SYNCOLCTAP       : AQNNLLQIKDAVDATVSFYQTLTEKYGEKYSKMAQELADKSK...GKKIGNVNEALAAFEKYKDVLNKKFSKADRDAIFNALASVKYDDWAKHLDQFAKYLKITGHVSFGYDVVSDILKIKDTGDWKPLFLTLEKKAADAGVSYVVALLFSLLAGTTLGIWGIAIVTGIQL.........MNLAKGKEESLDSDLYA : ECU15626
ECU15626         : KQDELRATKDAINFTTEFLKSVSEKYGAKAEQLAREMAGQAK...GKKIRNVEEALKTYEKYRADINKKINAKDRAAIAAALESVKLSDISSNLNRFSRGLGYAGKFTSLADWITEFGKAVRTENWRPLFVKTEAIIAGNAATALVALVFSILTGSALGIIGYGLLMAVTG.........ALIDESLVEKANKFWG. : A47676
A47676           : EYQNAEAIKDGVSLAAGINKDIAEKIGAKYAKLAKDLEAGIQ...GKYIRNVQDAEKTYEQLTKGLNKKLKAQDKAAIVAWLKMIDAEQYARNARVLGKVFTGVDWAIKGADLVNAAIEGFSTGNWKAFRNQLEALGLSIGASAIAAFFAPTLVSSTVGIFAFAYLFGWAT.........SYIDAERAGELEKWVAD : CEAN_ECOLI
CEAN_ECOLI       : EKNEKEALLKASELVSGMGDKLGEYLGVKYKNVAKEVANDIKNFHGRNIRSYNEAMASLNKVLANPKMKVNKSDKDAIVNAWKQVNAKDMANKIGNLGKAFKVADLAIKVEKIREKSIEGYNTGNWGPLLLEVESWIIGGVVAGVAISLFGAVLSFLPISG.LAVTALGVIGIMTISYLSSFIDANRVSNINNIISS : CEAB_ECOLI
CEAB_ECOLI       : ENDEKTVLTKTSEVIISVGDKVGEYLGDKYKALSREIAENINNFQGKTIRSYDDAMSSINKLMANPSLKINATDKEAIVNAWKAFNAEDMGNKFAALGKTFKAADYAIKANNIREKSIEGYQTGNWGPLMLEVESWVISGMASAVALSLFSLTLGSALIAFGLSATVVGFVGVVIAGAIGAFIDDKFVDELNHKII. : CEIB_ECOLI
CEIB_ECOLI       : KRDEINMVKDAIKLTSDFYRTIYDEFGKQASELAKELASVSQ...GKQIKSVDDALNAFDKFRNNLNKKYNIQDRMAISKALEAINQVHMAENFKLFSKAFGFTGKVIERYDVAVELQKAVKTDNWRPFFVKLESLAAGRAASAVTAWAFSVMLGTPVGILGFAIIMAAVS.........ALVNDKFIEQVNKLIG. : CHI6_POPTR

                 : 5---------15--------25--------35--------45--------55--------65--------75--------85--------95--------105-------115-------125-------135-------145-------155-------165-------175-------185-------195---- :
OrigSeq          : AKDERELLEKTSELIAGMGDKIGEHLGDKYKAIAKDIADNIKNFQGKTIRSFDDAMASLNKITANPAMKINKADRDALVNAWKHVDAQDMANKLGNLSKAFKVADVVMKVEKVREKSIEGYETGNWGPLMLEVESWVLSGIASSVALGIFSATLGAYALSLGVPAIAVGIAGILLAAVVGALIDDKFADALNNEIIR :OrigSeq
cons             : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EE---EEEEEEH--HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-- :cons
dsc              : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul              : HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHEEEE------EEEEEEEEEEEH---------HHHH--HHHH-HHHH-- :mul
nnssp            : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd              : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH----E---HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEEEEEEE--EEEEEHHHHHH---HHHHHHHHH-- :phd
pred             : ---HHHHHHHHHHHH------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE--HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH--- :pred
zpred            : HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE---------EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE---EEEEEEEEEEEE------------HHHHHHHHHHHHHH-- :zpred


access           : EEEEEEBBEEBBEBBBEBBEEBBEEBEEEBEEBBEEBBEEBEE-EEEEBEEBEEBBEBBEEB-EEBEEEBEEEEEEBBBEBBEBBEBEEBBEEBEEBBEBBEBBE-BBEB-EBBEEBBEB-EEEEB-EBBBEBEBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBEEE-BEEBEEE-EE : access

PHD Rel          : 98379999988877776654778775236899998888751367524311279999998875125330137432799999988622157888889887763212211111137899876146788742344666777655588999999876414321222246778752222553035554231245777777279 : PHD Rel
Pred Rel         : 00777799987885557766688777765099999999976776678855789999998888657676656777888999998858758887778788888585875768888778866668899077778777887567665777677785586655555556606666666678885655677868867777000 : Predator Rel


dssp             : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH--HHH---HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-- :dssp
define           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-- :define
stride           : -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH-HHH---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH- :stride


Q3 values for 1colb-1-DOMAK  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	73.60	71.57	70.56
dsc	80.71	82.23	82.23
pred	75.63	73.10	72.08
mul	65.48	64.47	64.47
nnssp	79.70	79.19	82.23
zpred	62.44	63.96	63.45
cons	79.19	78.68	80.20