Results for 1cpcl-1-DOMAK


1cpcl-1-DOMAK    : DGNKRMDVVNRITGNSSTIVANAARSLFAEQPQLIAPGGNAYTSRRMAACLRDMEIILRYVTYAIFAGDASVLDDRCLNGLKETYLALGTPGSSVAVGVQKMKDAALAIAGDTNGITRGDCASLMAEVASYFDKAAAAVA : PHAA_CYAPA
PHAA_CYAPA       : SGERRLRIAQILTDNRERIVREAGQQLFQKRPDIVSPGGNAYGEEM.ATCLRDLDYYLRLVTYGVVAGDATPIEEIGLVGVKEMYNSLGTPVAAVAEGVRSAKSVATGLLSGDD..........AAEAGSYFDYVIAALQ : PHB3_FREDI
PHB3_FREDI       : EGNKRVDVVNRISSNASSIVRNAARSLFAEQPQLIAPGGNAYTSRRAAACVRDLEIILRYVTYAIFAGDASVLDDRALNGLRETYLALGTPGASVAVGIQKLKESSIAIANDPNGITRGDCSSLIAEVSGYFDRAAAAVA : PHCA_CYAPA
PHCA_CYAPA       : RAASALEAARSLTSNSQKLIDGAAAAVYQKFPYTTQTFGPQYASTAKAKCTRDIGYYLRIVTYALVAGGTGPLDEYLVAGLEEMNRAFDLSPSWYVEALKYIKAN..HGLSGQA..........ATEANGYFDYVINALS : RVABSUBPC
RVABSUBPC        : DGNKRLDAVNAINSNASSIVTSAARALFAEQPQLIQPGGNAYTNRRMAACLRDMEIILRYVSYAAIAGDSSVLDDRCLNGLKETYQALGTPGASVAAGVQKMKEAAIAVANDSSNVTVGDCSALMAEIASYFDRAAAAVA : PHA3_FREDI
PHA3_FREDI       : QAGSSLEAAKALSKKASSLAEAAANAVYQKFPYTTTTSGPNYASTQKDKCVRDIGYYLRIVTYGLVVGGTGPIDDYLIGGLAEINRTFELSPSWYIEALKYIKAN..HGLSGDP..........AVEANSYIDYIINALS : PUNCPCBII1
PUNCPCBII1       : DGTKRLDVVNRITASSSSIVTDAARALFEDQPQLIAPGGNAYTNRRIAACMRDMDIILRYVTYAVFSGDASVLEDRCLNGLRETYSALGVPGGSVAVGIDKMKAAAIALANDPNGVTRGDCSALMSELASYFDKAAAAVG : PHAB_AGLNE
PHAB_AGLNE       : TGELRVRAAATIAANAANIIKES.VAKALLYSDITRPGGNMYTTRRFAACIRDLDYYLRLATYGMLAGDPSILDERVLDGLKETYNSLGVPIGATIQAIQAMKEVTSGLLGVD..........AGQEMALYFDYICSGLS : PHEB_AGLNE
PHEB_AGLNE       : EGNKRLDSVNYIASNASCIVSDAVSGMICENPGLIAAGGNCYTNRRMAACLRDGEIILRYVSYALLAGDSSVLEDRCLNGLKETYIALGVPTNSTARAVAIMKAAAVAFVTNTAAAG..DCSALAAEVGTYFDKVESSI. : ASU218532
ASU218532        : SGTARVQAAAAINSNAAALVKQAGSKLFEELPELIRPGGNAYTTRRLAACLRDMDYYLRYATYALVAGNTNVLDERVLQGLRETYNSLGVPIGPTVRGVQILKDLVKEQVAGA.......GIANTTFVEEPFDHITRELS : PHCA_PORPU
PHCA_PORPU       : RAAASLGAARSLTNNAQRLITGAAQSVYTKFPYVTQMPGPTYASSAKAKCARDIGYYLRMVTYCLVVGATGPMDEYLVAGLEEINRSFELSPSWYVEALQYIKGS..HGLSGQI..........GNEANVYLDYAINTLS : PH6B_CHRSP
PH6B_CHRSP       : EGNKRLDAVNAIVSNASCIVSDAVSGMICENPSLISPSGECYTNRRMAACLRDAEIILRYVSYSLLSGDSSVLEDRCLSGLKETYASLGVPAAGNARAVGIMKATVVAFINNTSPSG..DCSALASEAAGYFDKVTSALA : PHEA_POLBO
PHEA_POLBO       : RAAARLEAAEKLGSNHEAVVKEAGDACFSKYGYLKN.PGEAGENQEINKCYRDIDHYMRLINYTLVVGGTGPLDEWGIAGAREVYRTLNLPSAAYIAAFVFTRDRIPRDMSAQA..........GVEFCTALDYLINSLS : PHEB_MASLA
PHEB_MASLA       : DSNKRLDVVNRLTSNASSIVANAYRALVAERPQVFNPGGPCFHHRNQAACIRDLGFILRYVTYSVLAGDTSVMDDRCLNGLRETYQALGTPGDAVASGIKKMKEAALKIANDPNGITKGDCSQLMSELASYFDRAAAAVA : PHEB_SYNY1
PHEB_SYNY1       : SGNRRLDAVNAIASNASCMVSDAVAGMICENTGLIQAGGNCYPNRRMAACLRDAEIILRYVSYALLAGDASVLDDRCLNGLKETYTALGVPLQSTARAVAIMKAQAAAHIQDNPMGTPVRCASLVAESSSYFDRVIAALS : PHB1_SYNPW
PHB1_SYNPW       : EGNKRLDAVNAITSNASCIVSDAVTGMICENTGLIQAGGNCYPNRRMAACLRDGEIILRYISYALLAGDASVLDDRCLNGLKETYIALGVPAQSAARAVAIMKASATAHIGETNMET..DCSALVAEAASYFDRVISAIA : PHRB_SYNPY
PHRB_SYNPY       : GRNKRLDAVSRISNNASTIVASAARELFAQQPALISPGGNAYTSRRMAACLRDMEIILRYVTYSAFTGDASVLEDRCLNGLRETYLALGTPGTSVAAGVNLMKDAALSIVNDRAGISNGDCASLSSEIGTYFDRAAASVA : PHEA_MASLA
PHEA_MASLA       : RARAGLEAARAFANNGKKWAEAAANHVYQKFPYTTQMQGPQYASTPKAKCVRDIDHYLRTISYCCVVGGTGPLDDYVVAGLKEFNSALGLSPSWYIAALEFVRDN..HGLTGDV..........AGEANTYINYAINALS : PHB2_SYNPZ
PHB2_SYNPZ       : DGNKRLDAVNAITSNASCIVSDAVAGICCENTGLTAPNGGVYTNRKMAACLRDGEIVLRYVSYALLAGDASVLQDRCLNGLRETYAALGVPTGSASRAVAIMKAAAGALITNTN.VTTGDCSNIAGEAASYFDMVISAIS : PHA2_SYNPZ
PHA2_SYNPZ       : RAAARLEAAEKLAGNYDQVAQEAVDAVYNQYPNGAT.GRQPRKCATKEKCKRDFVHYLRLINYCLVTGGTGPLDELAINGQKEVYKALSIDAGTYVAGFSHLRSRAPRDMSAQA..........LTAYNQLLDYVINSLG : PHA1_SYNPW
PHA1_SYNPW       : RRAARLEAAEKLAAGLDAVTKEAGDACFNKYPYLKQ.PGEAGENQTVDKCYRDLGHYLRLINYCLVVGGTGPLDEWGIAGAREVYRTLGLPTGPYVEALTYTRDRAPRDMSPQA..........LNEFKSYLDYVINALS : PHCB_SYNP7
PHCB_SYNP7       : EGNKRIDTVNRITGNASSIVANAARALFAEQPSLIAPGGNAYTNRRMAACLRDMEIILRYVTYAVFTGDASILDDRCLNGLRETYLALGVPGASVAEGVRKMKDAAVAIVSDRNGITQGDCSAIISELGSYFDKAAAAVA : PHAA_SYNY4
PHAA_SYNY4       : GGAARLRIAETLTGSRETIVKQAGDRLFQKRPDIVSPGGNAYGEEM.ATCLRDMDYYLRLVTYGVVSGDVTPIEEIGLVGVREMYRSLGTPIEAVAQSVREMKEVASGLMSSDD..........AAEASAYFDFVIGAMS : PUNCPCBII2
PUNCPCBII2       : TATASLDAAKGLGAKASSLAEGAANAVYQKYPYTTQQSGNNFASTPKAKCVRDIGYYVRMITYCLIAGSTGPMDDYLVSGLAEINRSFDLSPSWYVEALKYIKAN..HGLSGDA..........ALEANSYIDYAINALS : PHCA_SYNP2
PHCA_SYNP2       : QGAFALEAAQTLTAKADTLVNGAAQAVYSKFPYTTSTPGNNFAADQKDKCARDIGYYLRMVTYCLVAGGTGPMDEYLIAGVDEINRTFDLSPSWYVEALKHIKAN..HGLTGDA..........ATETNNYIDYAINALS : PHRA_SYNPY
PHRA_SYNPY       : RAKASLEAAKGLTAKADSLVSSATQAVYTKFPYTTQMEGPNYSATSKAKCSRDIGYYLRMITYCLVAGGTGPMDDYLIAGLDEINRTFELSPSWYVEALKHIQSN..HGLSGDA..........ATEANSYINYAINALT : PHA0_FREDI
PHA0_FREDI       : SSQRRLQLVEALTQSRATIVKQAGKDIFQRFPRLVAPGGNAYGENM.ATCLRDMDYYLRLITYSVAAGDTTPIQEIGIVGVRQMYRSLGTPIDAVAESVRAMKNITTSMLSGED..........ASEVGTYFDYLITNLQ : PHAC_SYNP6
PHAC_SYNP6       : TGEQRLRIAQVLSDSEKKIVDQASRKLWQRRPDFIAPGGNAYGQRQQRGCLRDGDWYLRLITYGVLAGDKEPIESIGLLGAREMYNSLGVPLPGMAEAIRTLKEASLALLSSAD..........ATVAAPYFDFLIQGME : PHAC_PORPU
PHAC_PORPU       : TGSNRIRIATIIRDKEKEIIQKASKQIFQLHPEYIAPGGNAAGSRKRSLCLRDYGWYLRLITYGVLAGDKDSIETIGIIGVREMYNSLGVPIIGMLDAIQCLKEASLEMLGQDD..........AKIISPYFDYIIRGMS : PHAC_CYAPA
PHAC_CYAPA       : TGNKRISIINNIAQNEKKIIEQASKQLWQVHPEYISPGGNAYGARQRSLCLRDYGWYLRLVTYGILAGDQRPIEKIGIIGVREMYNSLGVPVIGMVDSITALKNSTLSVLSPED..........SEEVKPYFDYIIQAMA : PHAC_FREDI
PHAC_FREDI       : TGVKRTRIASTLAENEKKIVQEATKQLWQKRPDFISPGGNAYGERQRSLCIRDFGWYLRLITYGVLAGDKEPIEKIGLIGVREMYNSLGVPVPGMVEAIASLKKAALDLLSAED..........AAEASPYFDYIIQAMS : S74735
S74735           : TGAQRIRIAETLAENEKKIVDQAQKQLFKKHPEYRAPGGNAYGQRQYNQCLRDYGWYLRLVTYGVLAGNKEPIETTGLIGVKEMYNSLNVPVPGMVDAVTVLKDAALGLLSAED..........ANETAPYFDYIIQFMS : PMCPEBAGN
PMCPEBAGN        : DANKRIDATLAITQNVSCIAADAISGMVCENTGLTQPGGHCYPTRRMAACLRDGEIILRYVSYALFAGDPSVLDDRCINGLKETYIALGVPLSNAIRAIEIMKIATVAIMTETNGINSGECKDIASEAASYFDRVIDALN : PHEB_PSEA9
PHEB_PSEA9       : SGNRRLDAVNAIASNASCAVSDAIAGIVCENQGLIQAGGNLYPNRRFAACLRDTEIILRYVTYALLAGDSSVLDDRALNGLKETYSALGVPTTSTIRAVQILKAIAVAHIQGTNNETPLRCASIAAEAAGYFDRVIAALS : PHCB_SYNP2
PHCB_SYNP2       : EGTKRSDAVSRMTNNASSIVTNAARQLFADQPQLIAPGGNAYTNRRMAACLRDMEIILRYVTYATFTGDASVLNDRCLNGLRETYVALGVPGASVAAGVRAMGKAAVAIVMDPAGVTSGDCSSLQQEIELYFETAAKAVE : PHCB_CYAPA
PHCB_CYAPA       : EGNKRLDAVQGITASAATIVSSAARSLFAEQPQLIAPGGNAYTNRRVAACLRDLEIVLRYITYATLAGDSSVLDDRCLNGLRETYQALGVPGSSVAVAIQKMKDAAVSVVNDPSGVTVGDCSALASEVASYFDRAAAAVV : S25306
S25306           : SANLRIDIIKFINEQAVLIIKETSAELFEEYIDLLRPGGNAYTTRRYAACIRDLDYYLRYATYSMLADDPSILDERVLNGLKETYNSLGVPIGATIRALSIMKKIVQKQVSQE..........AQNIVSLPFDYMINSLS : PHAF_CYAPA
PHAF_CYAPA       : TASARIESVKIINANVSTIIKTAASALFDEQPELIAPGGNANTTRRYAACLRDIDYYLRYATYAIISADVDVLDERVLDGLKETYNSLGVSIAPTVRAIELLKNTSKELIKAA.......GISAVDFIDEPFDYMGKVLA : S76746
S76746           : SGSARIAAAAMINANSATIVKRAAAQLFEEIPELIRPSGNAYTTRRFSACLRDMDYYLRYASYALIAADNNVLDERVLQGLRETYNSLGVPIGPTVRGIQIMKEMIEAMAEDS.......SLNSTDFIASPFDHMTRELS : PHAF_AGLNE
PHAF_AGLNE       : TALQRLEVVEIIQSQSSKIIKEAAARMYSEQPELLRPGGNSYTTRKYAMCLRDIEYYLRYATYAIIAGNNDILNERVLDGLKDTYNSLNVPIAPTVRSIQIMEEIIHNEISKQD.....LKIIKKSIISEPFDHMIQNLS : PHAF_PORPU
PHAF_PORPU       : SGLDRIKIAEIINNQATNILKEASAQLYEEQPELLRPGGNSYTTRRYAACLRDIEYYLRYTSYALIAGNTNILDQRVLNGLKDTYNSLSVPLAPTVRSIQLLQEIIEEELELQ.......SITRKDIVQEPFQHLINALS : APCE_GALSU
APCE_GALSU       : .ED.SIDISSIDTKNTKFSFSNIFKNLFSNEPAGFKPITIVYGSNKMRKSLRDLDWFLRYLSYAIIIGDPN.ILAVNIKGLREIIENACS.TAATIVALRTMKRTCIKLFSSNP........EAESIVNQYFNVIIQEFE : APCE_PORPU
APCE_PORPU       : AGDQRDKINELSGN.IQGDFGQSFRSLFNAGPPGFKPINVLYGTTRMRKSLRDLDWFLRYLTYAIVSGDPN.ILSVNIRGLRELIDNACS.SAAAIVALREMRRTALAIFEEDI........KGQDLVREYFNVVISEFE : SYOAPCE
SYOAPCE          : TGARAIDIKEAMKLGTRGGFLEGLRSIFSASPVGFKPINIAYGPARMEKSLRDLDWFLRYTTYAIVAGDPN.ILAVNTRGLREIIEAACS.SDATIAALQEMRRAALSYFEKDA........EAKGIVETYFDVLINEFI : S65778

                 : 33--------43--------53--------63--------75--------85--------95--------105-------115-------125-------135-------145-------155-------165------- :
OrigSeq          : DGNKRMDVVNRITGNSSTIVANAARSLFAEQPQLIAPGGNAYTSRRMAACLRDMEIILRYVTYAIFAGDASVLDDRCLNGLKETYLALGTPGSSVAVGVQKMKDAALAIAGDTNGITRGDCASLMAEVASYFDKAAAAVA :OrigSeq
cons             : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :cons
dsc              : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul              : -----HHHHHHH-----HHHHHHHHHHH------------------HHHHH---H-EEEEEEEEEE------H---HHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHH-HHHHHHHH- :mul
nnssp            : -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd              : ----HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH----E------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE------HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred             : ---HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE------------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred            : ---HHHHHHHHHH-----EHHHHHHHHE-------------------HEEEEHHEEEEEEEEEEEEE----EEEEHHHHHHEEEEEEE-----EHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHH :zpred


access           : EEEEEBEBBEEBEEEBEEBBEEBBEEBBEE-EEBBEEEEEB-BEEE-BEBBEEBEBBBEBBBBBBBBEEEE-BEE-BBEEBEEBBEBBEBEBEBBBEBBEBBEEBBBEBBEEEEE-EEEEBBEBBBEBBE-BE-BBEE-E : access

PHD Rel          : 98516889998742427899999999985177621478862268899999887888775532134517976414667641488987536874268999999999888874478877766346788888877889998538 : PHD Rel
Pred Rel         : 00777777087877768877888888788599777809999777878888887788777888766679998755555566788757677998765587889998888775879997779778877999958897777000 : Predator Rel


dssp             : -HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH-HHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH----HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHH--- :dssp
define           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH---HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :define
stride           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :stride


Q3 values for 1cpcl-1-DOMAK  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	82.86	80.71	82.86
dsc	87.14	82.14	85.71
pred	83.57	77.14	80.71
mul	60.71	55.71	59.29
nnssp	84.29	82.14	85.71
zpred	57.14	52.14	55.71
cons	83.57	82.86	85.00