Results for 1csmb-1-AUTO.1


1csmb-1-AUTO.1    : MDFTKPETVLNLQNIRDELVRMEDSIIFKFIERSHFATCPSVYEANHPGLEIPNFKGSFLDWALSNLEIAHSRIRRFESPDETPFFPDKIQKSFLPSINYPQILAPYAPEVNYNDKIKKVYIEKIIPLISKRDGDDKNNFGSVATRDIECLQSLSRRIHFGKFVAEAKFQSDIPLYTKLIKSKDVEGIMKNITNSAVEEKILERLTKKAEVYGVDPTERRIIPEYLVKIYKEIVIPITKEVEVEYLLRRLEE : CHMU_ARATH
CHMU_ARATH        : PQPSKPRSSLTLEGIRNSLIRQEDSIIFGLLERAKYCYNADTYDP..TAFDMDGFNGSLVEYMVKGTEKLHAKVGRFKSPDEHPFFPDDLPEPMLPPLQYPKVLHFAADSININKKIWNMYFRDLVPRLVKK.GDD.GNYGSTAVCDAICLQCLSKRIHYGKFVAEAKFQASPEAYESAIKAQDKDRLMDMLTFPTVEDAIKKRVEMKTRTYGVGMEEKKISPILVGDLYGDWIMPLTKEVQVEYLLRRLD. : ICIC_HORVU

                  : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91--------101-------111-------121-------131-------141-------151-------161-------171-------181-------191-------201-------211-------225-------235-------245-------25 :
OrigSeq           : MDFTKPETVLNLQNIRDELVRMEDSIIFKFIERSHFATCPSVYEANHPGLEIPNFKGSFLDWALSNLEIAHSRIRRFESPDETPFFPDKIQKSFLPSINYPQILAPYAPEVNYNDKIKKVYIEKIIPLISKRDGDDKNNFGSVATRDIECLQSLSRRIHFGKFVAEAKFQSDIPLYTKLIKSKDVEGIMKNITNSAVEEKILERLTKKAEVYGVDPTERRIIPEYLVKIYKEIVIPITKEVEVEYLLRRLEE :OrigSeq
cons              : ---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHE-------------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHE-------------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH----HHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-HEEE----------HHHHHH----EEE---HHHHHHHHHHHHHH :cons
dsc               : --------EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------------HHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEE----HHHH--HHHHHH---EEE----HHHHHHHHHHHHHH :dsc
mul               : -----------------HHHH--HHHHHHHHHH-------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HH----------------HHHHHH-H------HHHHHHHHHHHE-----------------HHHHHHHHH---H---HHHHHHHH----HHHHHHHHH--HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-----------------EEH-----EE----HHHHHHHHHHH-- :mul
nnssp             : ---------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH------------------------HHHHHHHH-HHHHHHHHHH--------------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHH---HHHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHH---EE---HHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd               : ------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH---E-------------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHEE-------------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH----HHHHHHHH---HHHHHHH-----HHHHHHHHHH--EEEEEE---------HHHH-----EEE-HHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred              : ---------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----------------------EEEEHHHHHHHHHHHHHH---------------------------------------HHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH---HHHHHHHH--HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--- :pred
zpred             : --------EEEEE-HHHEHHHHHHHHHHHHHHH----------------EEE------HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HH------EE----EEEEEEEEHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHEEEE-----------EEEEHHHHHHHHHEEE---HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHEEE---HHHHHHEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred


access            : EEEEEEEBBBEBEEBEEEBBEBEBBBBBBBBEEBEBBBBBEB-EBE-EBBEBEEBEBBBBEBBBEBBEEBBBEBEEBEEEEEBE-BEEEBEEEBBEBBE-BEBBBBBBEEBEBEEEBBEBBBEEBBEEBBEEEEEEEEEBBBBBBBEBBBBEBBBE-BBBBEBBBEBEBEBEBEBBEEBBEBEEEEBBBEBBBBEBBEEBBEEEBEEEBEBBBBE-EEEEBBBEBBBEBBEEBBBEBBEEBBBEBBBEEBEE : access

PHD Rel           : 999998765555367789986354889999965431536455677885565457662478999876899985414313899988988867666899788752122145335454478999888652231215998768899642356789999876662214777764223826999999536868889723574179999999722146764264343431133221112313321145769999998469 : PHD Rel
Pred Rel          : 009999888808877709980680669888988055679907778099908888999650577866778669877560900000090999008889999885675709997687765688888867556678999999988866655788888688866965889995575967878865567778095655777808999999999888568799975505686688655660656768889996677000 : Predator Rel


dssp              : -----HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHH----HHH--------HHHHHHHHHHHHHHH--HHH-----------------------------HHH---HHHHHHHHHH--HHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH---HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH-HHH- :dssp
define            : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEE---EEEE---EEEEEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :define
stride            : -----HHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--E--HHHH-E-E--E-------EHHHHHHHHHHHHHHHH---------------------------------HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH--E-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :stride


Q3 values for 1csmb-1-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	76.19	69.84	75.79
dsc	73.81	69.84	72.22
pred	78.57	74.60	79.37
mul	70.24	59.13	67.86
nnssp	79.76	72.62	78.57
zpred	63.49	57.54	63.10
cons	78.17	73.81	78.57