Results for 1dik-1-AS.1


1dik-1-AS.1    : AKWVYKFEEGNASMRNLLGGKGCNLAEMTILGMPIPQGFTVTTEACTEYYNSGKQITQEIQDQIFEAITWLEELNGKKFGDTEDPLLVSVRSAARASMPGMMDTILNLGLNDVAVEGFAKKTGNPRFAYDSYRRFIQMYSDVVMEVPKSHFEKIIDAMKEEKGVHFDTDLTADDLKELAEKFKAVYKEAMNGEEFPQEPKDQLMGAVKAVFRSWDNPRAIVYRRMNDIPGDWGTAVNVQTM : S56650
S56650         : KKRVFTFGEGNRDMKSLLGGKGANLAEMSSIGLSVPPGLTISTEACEEYQQNGKSLPPGSWDEISEGLDWVQKEMSASLGDPSKPLLLSVRSGAAISMPGMMDTVLNLGLNDEVVAGLAGKSGA.RFAYDSYRRFLDMFGNVVMGIPHSLFDEKLEQMKAEKGIHLDTDLTAADLKDLVEKYKNVYVEAK.GEKFPTDPKKQLELAVNAVFDSWDSPRANKYRSINQITGLKGTAVNIQSM : PODK_MAIZE
PODK_MAIZE     : KKRVFHFGEGNKTMKELLGGKGANLAEMASIGLSVPPGFTVSTEACQQYQDAGCALPAGLWAEIVDGLQWVEEYMGATLGDPQRPLLLSVRSGAAVSMPGMMDTVLNLGLNDEVAAGLAAKSGE.RFAYDSFRRFLDMFGNVVMDIPRSLFEEKLEHMKESKGLKNDTDLTASDLKELVGQYKEVYLSAK.GEPFPSDPKKQLELAVLAVFNSWESPRAKKYRSINQITGLRGTAVNVQCM : EHU02529
EHU02529       : MQRVYAFE..DGTNKKLLGGKGAGLCTMTKIGLPVPQGFVITTEMCKQFIANGNKMPEGLMEEVKKNMQLVEKKSGKVFGGEENPLLVSVRSGAAMSMPGMMDTILNLGLNDKTVVALAKLTNNERFAYDSYRRFVSLFGKIALNVDDEVYDKTLENKKVEKGVKLDTELDANDMKELAQVFIKKTEEFT.KQPFPVDPYAQLEFAICAVFRSWMGKRAVDYRREFKITPADGTAVSVVSM : PODK_GIADU
PODK_GIADU     : TRRVYFFGANSELCRKVLGGKGISLAAMIKLGMPVPLGFTITCQTCVEYQKTAS.WPKGLKEEVASNLKLLEEKMGKTFGDNTNPLLVSVRSGAAVSMPGMMDTILNLGLNDESVKGLAAVTGNARFAYDSYRRFMQMFGDVCLGIDHDKFEHALDAVKTRYGRKTDPELTADELEEVCEAYRKICVAAT.GKTFPQCPHEQLELAINAVFKSWTNPRAQAYRTLNKLD.NMGTAVNVQSM : S55478
S55478         : IKRVFTFGEGNKGMKSLLGGKGANLAEMASIGLSVPPGLTISTEACQEYQEHGKQLSAGLWEEILEGLRVIEKDMGSYLGDPSKPLLLSVRSGAAISMPGMMDTVLNLGLNDDVVAGLAAKSGE.RFAYDSYRRFLDMFGNVVMGISHSSFEEKLEKLKQAKGVKLDTELTASDLKEVVEQYKNVYLEVK.GEKFPADPERQLQLAIQAVFDSWDSPRAIKYRNINQITGLKGTAVNIQCM : PPSA_PYRFU
PPSA_PYRFU     : ..MAYRFIELSKNDVPLVGGKGANLGEMTNAGIPVPPGFCVTAEAYKYFVENVKVEPRPLQDWIMDIISKTDVDDSKMLQENTEAIRTLIKSLDMEIKQAYKELSQRFGQ.EEVYVAVRSSATAEDLPEASFAGQQETYLDVLADDVIDKVKRCWASLWTARATFYRAKQGFDHSKVYLSAVVQKMVNSEKGVMFTANPVTRNEIMINASWGLGEGAVTPDEYIVEKGTWKEKVIAKKEVM : F64367
F64367         : KGDSMKFIELSNKDVDIAGGKGASLGEMWNAGLPVPPAFVVTADAYRHFIK.....ETGLMDKIREILSGLDVNDTDALTNASKKIRKLIEEAEMAIIEAYNKLCEMCGE.DEVTVAVRSSATAEDLPEASFAGQQDTYLNIKAENVVKYVQKCFSSLFTPRAIFYREQQGFDHFKVALAAVVQKLVNAEKGVMFTVNPISYDELVIEAAWGLGEGSVSPDTYIVNKKTLVDKHIARKETM : DAPB_BACSU

               : 2---------12--------22--------32--------42--------52--------62--------72--------82--------92--------102-------112-------122-------132-------142-------152-------162-------172-------182-------192-------202-------212-------222-------232-------2 :
OrigSeq        : AKWVYKFEEGNASMRNLLGGKGCNLAEMTILGMPIPQGFTVTTEACTEYYNSGKQITQEIQDQIFEAITWLEELNGKKFGDTEDPLLVSVRSAARASMPGMMDTILNLGLNDVAVEGFAKKTGNPRFAYDSYRRFIQMYSDVVMEVPKSHFEKIIDAMKEEKGVHFDTDLTADDLKELAEKFKAVYKEAMNGEEFPQEPKDQLMGAVKAVFRSWDNPRAIVYRRMNDIPGDWGTAVNVQTM :OrigSeq
cons           : --EEEEE----HHHHHHH-----HHHHHHH------------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE----------HHHHHHH-----HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHEEEEE--HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH----------E----------EEEEE-- :cons
dsc            : --HHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHHH--------------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHH-----------HHHHHHHH---HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH--------EEE--- :dsc
mul            : --EEEEH-------HHEE------HHHH----------EEEE--HH-H---------HH-HHHHHHHHHHHH-------------HHHEE-----H-H---HHHHHH------HHHHHH-H----HHH------HHHHHHHHHEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHH------------------------EEEEE- :mul
nnssp          : --EEEE-----HHHHHHH------HHHHHH------------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE-----------HHHHHHH-----HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHH-----------------------EEEE-- :nnssp
phd            : -EEEEEEE----HHHHH------HHHHHHH------------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH------------EEEEEE----EE---HHHHHHH-------EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHEEEEE---HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHE---------HHHHHHHHHHHHHHH----------E----------EEEEE-- :phd
pred           : -----------------------HHHHHH---------EEEE-HHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE-------------EEE------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-EEEEE--HHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHH----------EEEE---- :pred
zpred          : --EEEEEH-----HHEEEE-HHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHH-----------HEEEEEHHHHHHHHHHHHHEEHEH---HHHHHHHHH-----EEHHHHH--EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHH----------EEEEE--------HHHHEEE :zpred


access         : EEEBBBBBEBEEEBEEBBEEEBBBBBEBBBBBBEBEEBBEBBBEBBEEB-EEBEEBEEEB-EEBBEBBEBBEEEBEEEBEEEEEEBBBBBEBBBBBBBEBBBEBBBBBE-EEEBBBBBBEEEEEEEBB-EBBEEBBEBBBEBBBEBB-E-BEEBBEEBEEEEBBEBEEEBBBEEBEEBBEEBBEBBBEBEEEEEBEEEEEEEBEBBBBBBBEBBE-EEBBE--BBEEBEEEEEBBBBBEBE : access

PHD Rel        : 9158786146621133325712137898754766999974222789999971554751579999999876343223446899985378962433210311367886657681322556643466532478889999852103541152168999999985314512355453779999999988752122477669992679999999999643588654111111133654522576449 : PHD Rel
Pred Rel       : 0077666799876658569999668880856888999767055556877699987677776978989999978969666999998556655776558999775589566776657757856787855550899988887665667576888999999999769068686666689999999999977877799899900007988999877577807787577876888899876556000 : Predator Rel


dssp           : ---EEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEE--HHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH---EE-----EE-EEEEEEE---------EEEEE-----HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-------HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH--------EEEEEEE- :dssp
define         : ------------------HHHHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE----EEEEEEEEE--------EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH----EEEEEEEEEE :define
stride         : ---EEEHHH----------HHHHHHHHHHHH------EEEE-HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH---EE-----EE-EEEEEEE---------EEEEE----HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH--------EEEEEEE- :stride


Q3 values for 1dik-1-AS.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	70.54	60.58	69.29
dsc	74.27	70.12	72.20
pred	74.69	73.44	76.76
mul	65.56	58.51	65.56
nnssp	74.27	65.15	71.78
zpred	62.24	56.85	63.49
cons	75.93	66.39	73.44