Results for 1ecl-4-AS


1ecl-4-AS    : PGAPFITSTLQQAASTRLGFGVKKTMMMAQRLYEAGYITYMRTDSTNLSQDAVNMVRGYISDNFGKKYLPESPNQYAHEAIRPSDVNVMAESLKDMEADAQKLYQLIWRQFVACQMT : MTY15C105
MTY15C105    : PYPPFMTSTLQQEASRKLRFSAERTMSIAQRLYENGYITYMRTDSTTLSESAINAARTQARQLYGDEYVAPAPAQEAHEAIRPAGETFATPDAVRRELDDFRLYELIWQRTVASQMA : HSU434311
HSU434311    : P.QALDTVELEKLASRKLRINAKETMRIAEKLYTQGYISYPRTETNIFPLNLTVLVEQQTPDPRWGAFAQILESDQAHPPIHPT...KYTNNLQGDEQR...LYEFIVRHFLACCSQ : SSHTOPR2
SSHTOPR2     : PLPPFTTDTLLIEANMKYKLPANLVMKIAQDLFEAGLITYHRTDSTHISSVGIEIAKEYLQKQGLIKD..FVPEEGAHEAIRPTELIQEIEENPYKYSIHFLIYDLIFRRFMASQMS : PFU66557
PFU66557     : PLPPYTTDAMLQDASRFLGFSPTHTMQLAQDLFELGLTTYHRTDSIHVSNTGIEIAKEYITQEIGEEY..FAPEEGAHEAIRPTRLIQLIRDGIITLPRHFKLYDLIFRRFMASQMK : TOPG_SULAC
TOPG_SULAC   : PLPPYTTDTLLSDSNNFFGLSAPETMRIAQDLFELGLITYHRTDSNRISNTGISVAENYLKDVLGDKYTNFKPDGGAHEGIRPTQLRLLIEEGELELAKHFKVYDIIFRRFISSQII : S73898
S73898       : PNSAYTTASLQKDAINKLGWSSKKVTLIAQHLYEGVSISYPRTDSTRLSAQFQQSCKEYILNHYGEKYLSNRIIQDAHEAIHPTDINITPEMVKNAIKKEFLLYRLIWIRTVASLMA : TOP1_MYCGE
TOP1_MYCGE   : PNPVYTTASLQKDAINKLGWSSKKVTMVAQRLYEGISVSYPRTDSIRISNQFQSECEKYIEKEFGSHYLADKNIQDAHEGIHPTYITITPNDLKNGVKREFLLYRLIWIRTVASLMA : S74903
S74903       : PSPPFTTSTLQQEANRKLGISARDTMRVAQKLYEEGYITYMRTDSVHLSDQAVTAARNCVQQMYGKEYLSPQPAQEAHEAIRPAGTEFRIPNQTGLKDRELALYELIWKRTVACQMA : TOP1_SYNP7
TOP1_SYNP7   : QRPPFTTSTLQQESNRKLRLSARETMRVAQSLYERGFITYMRTDSVHLSQQAIEAARSCVEQMYGKNYLSPQPAQEAHEAIRPAGNTFRLPQETGLSGAEFAVYDLIWKRTIASQMA : TOP1_HAEIN
TOP1_HAEIN   : PRAPFITSTLQQTASTRLGFGVKKTMMLAQRLYEAGYITYMRTDSTNLSQDALNMARTYIENHFGAQYLPEKPAQEAHEAIRPSDIRALPESLEGMEKDAVRLYDLIWCQFLACQMP : TOP1_THEMA
TOP1_THEMA   : PPEPFKTSTLQQEAYSKLGFSVSKTMMIAQQLYEGVETTYMRTDSTRVSDYAKEEARNLITEVFGEEYVGSKRIQDAHEAIRPTNVFMTPEEAGKYLNSQKKLYELIWKRFLASQMK : TOP1_BACSU
TOP1_BACSU   : PALPFTTSTLQQEAARKLNFRAKKTMMIAQQLYEGIDLTYMRTDSTRISNTAVDEAAAFIDQTYGKEFLGGKRAQDAHEAIRPTSVLRKPSELKAVLGRQMRLYKLIWERFVASQMA : TOP1_BACFI
TOP1_BACFI   : P.PLLYLSTLQMDAGNAFGFKPAETLKYAQSLYDKGYLSYPRTQDERITESDARELENNIQFLSGHDTSGLFPEVTDHHALLIT..DKIPKDKDLSEDE.KSIYHLVVKRILAAHYP : AB0014889
AB0014889    : P.ALYDLTELQRDAHKRFGFSAKETLSVLQKLYEQHKLTYPRTDSRFLSSDIVPTLKDRLEVKPYAQYVSIKKKVSDHHAIIPT...EEPLVLSSLSDKERKLYDLIAKRFLAVLMP : B64506
B64506       : PLPPFDLGTLQREAYSYFKISPKETQEIAQKLYENALISYPRTSSQKLPRKYLEDILNIIKPVYGKWAERLKEEDPAHPAIHIV..DIPKEELSEKEKE...IYDLIARRTLAAFWD : GLBY_CHITP

             : 280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------368-------378-------388-------398---- :
OrigSeq      : PGAPFITSTLQQAASTRLGFGVKKTMMMAQRLYEAGYITYMRTDSTNLSQDAVNMVRGYISDNFGKKYLPESPNQYAHEAIRPSDVNVMAESLKDMEADAQKLYQLIWRQFVACQMT :OrigSeq
cons         : -------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHH------E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :cons
dsc          : ------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul          : ---------HHH-H--HH-----HHHHHHHHHHHH-EEEE------------HHHHHHHHHHH---H---------HHHH---------H--H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- :mul
nnssp        : -------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEE---------HHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd          : -------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHH------E----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred         : -------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEE--------HHHHHHHHHHHHHH---------------------------HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred        : -----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE----------HHHHHHHH------------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :zpred


access       : EEEEBBBBEBEEEBBEEBEBEBEEBBEBBEEBBEBBBBB-B-EEEEEBBEEBBEBBEEBBEE-BBEE-BEEEEEEEB-EBB-EBEB-BBBEEBEEEEEEEBEBBEBBBE-BBBBEBE : access

PHD Rel      : 999988627988989851434079999999999717188742555542136899999999974152111556531343324456521234544432125668999999999986159 : PHD Rel
Pred Rel     : 000997658889998788676768899999998866607607998776777788998888776777567899977787760899976665678766666889999999997777000 : Predator Rel


dssp         : ----E-HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---E-----------HHHHHHHHHHHHHH--HHH------------E-E------HHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dssp
define       : EE---HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEE--EEEE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE :define
stride       : ------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--E-----------HHHHHHHHHHHHHHH-HHH--------------E------HHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :stride


Q3 values for 1ecl-4-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	80.34	71.79	81.20
dsc	74.36	63.25	75.21
pred	84.62	68.38	83.76
mul	72.65	62.39	75.21
nnssp	78.63	70.09	80.34
zpred	67.52	60.68	67.52
cons	77.78	68.38	80.34