Results for 1fuqb-2-AUTO.1


1fuqb-2-AUTO.1    : SNDVFPTAMHVAALLALRKQLIPQLKTLTQTLNEKSRAFADIVKIGRTHLQDATPLTLGQEISGWVAMLEHNLKHIEYSLPHVAELALGGTAVGTGLNTHPEYARRVADELAVITCAPFVTAPNKFEALATCDALVQAHGALKGLAASLMKIANDVRWLASGPRCGIGEISIPENEPMPGKVNPTQCEALTMLCCQVMGNDVAINMGGASGNFELNVFRPMVIHNFLQSVRLLADGMESFNKHCAVGIEP : FUMH_RHIOR
FUMH_RHIOR        : SNDTFPTAMHVAAVVEIHGRLIPALTTLRDALQAKSAEFEHIIKIGRTHLQDATPLTLGQEFSGYTQQLTYGIARVQGTLERLYNLAQGGTAVGTGLNTRKGFDAKVAEAIASITGLPFKTAPNKFEALAAHDALVEAHGALNTVACSLMKIANDIRYLGSGPRCGLGELSLPENEPMPGKVNPTQCEAMTMVCAQVMGNNTAISVAGSNGQFELNVFKPVMIKNLIQSIRLISDASISFTKNCVVGIEA : ASPA_HAEIN
ASPA_HAEIN        : TNDAYPTGFRIAVYNSILK.LIDKIQYLHDSFDNKAKEFANILKMGRTQLQDAVPMTVGQEFKAFAVLLEEEVRNLKRTAGLLLEVNLGATAIGTGLNTPQGYTELVVKHLAEVTGLACVPAENLIEATSDCGAYVMVHGALKRTAVKLSKVCNDLRLLSSGPRAGLKEINLPELQAMPAKVNPVVPEVVNQVCFKVIGNDTTVTFASEAGQLQLNVMEPVIGQAMFESIDILTNACVNLRDKCVDGITV : ASPA_BACSU
ASPA_BACSU        : QNDVFPTAIHISTLKLLEK.LLKTMEDMHSVFKQKAQEFHSVIKMGRTHLQDAVPIRLGQEFEAYSRVLERDIKRIKQSRQHLYEVNMGATAVGTGLNADPEYIKQVVKHLADISGLPLVGADHLVDATQNTDAYTEVSASLKVCMMNMSKIANDLRLMASGPRAGLAEISLPARQPMPGKVNPVMAELINQIAFQVIGNDNTICLASEAGQLELNVMEPVLVFNLLQSISIMNNGFRSFTDNCLKGIEA : ATU82202
ATU82202          : SNDTFPTVMHIAAATEINSRLIPSLKTLHRTLESKSFEFKDIVKIGRTHTQDATPLTLGQEFGGYATQVKYGLNRVTCTLPRLYQLAQGGTAVGTGLNTKKGFDVKIAAAVAEETNLPFVTAENKFEALAAHDACVETSGSLNTIATSLMKIANDIRFLGSGPRCGLGELVLPENEPMPGKVNPTQCEALTMVCAQVMGNHVAVTVGGSNGHFELNVFKPVTSSALLHSVRLIADASASFEKNCVRGIEA : PAU594581
PAU594581         : SNDIIPSTIHISAALEISERLLPALRHLEQTIQSKAGEVHAYVKTGRTHLMDAMPVRMSQVLGGWAQQVRQAGVHIESVLPALQQLAQGGTAVGTGINAHPRFAERFSQELNDLTGLAFRPGDDFFALIGSQDTAVAASGQLKTLAVTLMKLANDLRWMNSGPLAGLGEIELEALQPMPGKVNPVIPEATAMVAAQVIGNDAAIAVAGQSGNFELNVMLPLVADNLLHSIQLLANVSRLLADKAIASFKV : SCYPL262W
SCYPL262W         : SNDTFPTVMHIAASLQIQNELIPELTNLKNALEAKSKEFDHIVKIGRTHLQDATPLTLGQEFSGYVQQVENGIQRVAHSLKTLSFLAQGGTAVGTGLNTKPGFDVKIAEQISKETGLKFQTAPNKFEALAAHDAIVECSGALNTLACSLFKIAQDIRYLGSGPRCGYHELMLPENEPMPGKVNPTQNEALTQVCVQVMGNNAAITFAGSQGQFELNVFKPVMIANLLNSIRLITDAAYSFRVHCVEGIKA : PCAB_PSEPU
PCAB_PSEPU        : SQDAMDTGLVLQLRDALDL.IEADLGKLADTLSQQALKHADTPMVGRTWLQHATPVTLGMKLAGVLGALTRHRQRLQELGPCWCCSSGGASGSLAALGSKAM...PVAEALAEQLKLSLP..EQPWHTQ..RDRLVEFASVLGLVAGSLGKFGRDVSLLMQTE...AGEVFEPSGKGMPHKRNPVGAAVLIGAATRVPGLVSTLFAAM.PQEHERSLGLWHAEWETLPDICCLVSGALRQAQVIAEGIEV : FUMC_SULSO
FUMC_SULSO        : SNDTVPTAIRIAAVAEVTNRLLPALQQIISSLNKKAEEYKDVIKAGRTHLRDALPVTLGQELSAYADAFQHEHEQVMNILEYVKELPIGGTATGTGLNSHPEFQERVINEINRITGLGFKP.ANRFRAMRLLTDLLLLSGALRNIAVDLYRLGQDIRLMFSGPLTGLNEIDLPTEIAMPGKTNPVTVEATLLISAQVVGLDHANQFASMLGEFELSMGIPLVGYNIVTQVNFISEALEKMSRLVIDGMVA : HIU328203
HIU328203         : SNDTFPTAMHIAAYKKVVEHTIPCVERLQKTFAAKSEAFKNVVKIGRTHLMDATPLTLGQEFSAYAAQLDFGLKALKNTLPHLSQLALGGTAVGTGLNTPKGYDLKVVDYIAKFTALPFVTADNKFEALAAHDAIVETHGALRQLAMSLFKIANDIRLLASGPRSGIGEILIPENEPMPGKVNPTQCEXMTMVCAQVFGNDTTIAFVGSQGHFQLNVFNPVMIANFLQSAQLLGDACVSFDEHCAVGIEP : S76348
S76348            : SNDTFPTAMHIAAVAGLQTKLIPSLQALRDSLNEKAECFAGITKIGRTHLMDAVPLTLGQEFSGYVAQLDQGLTQINYCLPGLLELALGGTAVGTGLNSHPQFAKKVAEEIAQLTGYTFISAPNKFAALAGHEAIAFASGVLKSIAASLMKIANDLRWMGSGPRCGLGELALPANEPMPGKVNPTQCEAMTMVCVQVMGNDATIGFAASQGNFELNVFKPVIIHNFLHSLHLLSDACASFRQHLVVGLQV : FUMH_BACSU
FUMH_BACSU        : SNDTFPTAMHVAAVLAVYEQLVPALDQLRNTLDEKAKAYNDIVKIGRTHLQDATPLTLGQEISGWVHMLDRSKEMILEATDKMRALAIGGTAVGTGINAHPEFGELVSEEITKLTGQTFSSSPNKFHALTSHDEITYAHGALKALAADLMKIANDVRWLASGPRCGIGEIVIPENEPMPGKVNPTQSEALTMIAAQIMGNDATIGFAASQGNFELNVFKPVIIYNFLQSVQLLSDGMNSFHDKCAVGIEP : TTHILVB2
TTHILVB2          : SNDTFPTAMYVATVLALHQHLYPAVEGLIATFEEKARAFDGIVKVGRTHLMDAVPITLGQEVGSWAAQLRNTLAMVKEAEKGLYNLAIGGTAVGTGLNAHPRFGELVARYLAEETGLPFRVAENRFAALAAHDELVHVMGALRTLAGALMKIGNDIRWLASGPYGGIGEIFIPANEPMPGKVNPTQVEALPWVVVRVFGNDQAVAFAGSQGNFQLNVYKPVMVDAALESIKLLGDAVASFDQHLAQGIEP : FUMC_BRAJA
FUMC_BRAJA        : SNDSFPTAMHIAAASRITADLVPALGELLRALRKKEKEFAKIVKIGRTHTQDATPLTLGQEFSGYAAQVERGIARLKVAVKELYPLAQGGTAVGTGLNAKPRFARLFAKHVAGITKLPFTSAANKFEALASNDAYVLAHGAISSVATGLFKIANDIRLLGSGPRSGLGELILPENEPMPGKVNPTQCEAMTMVCCQVFGNHTAITVAGSQGHFELNVYKPVLAYNMLHSIRLMADAARSFTEHCVSGIRA : ASPA_PSEFL
ASPA_PSEFL        : TNDAYPTAIRLGLLLGHDA.LLASLDSLIQAFAAKGAEFSHVLKMGRTQLQDAVPMTLGQEFRAFATTLGEDLARLKTLAELLTEVNLGGTAIGTGINADPRYQALAVQRLATISGQPLVPAADLIEATSDMGAFVLFSGMLKRTAVKLSKICNDLRLLSSGPRTGINEINLPARQPMPGKVNPVIPEAVNQVAFQVIGNDLALTMAAEGGQLQLNVMEPLIAFKIFDSIRLLQRAMDMLREHCIVGITA : JC4101
JC4101            : TNDSYPTGFRLGIYAGLQT.LIAEIDELQVAFRHKGNEFVDIIKMGRTQLQDAVPMSLGEEFRAFAHNLAEEQTVLREAANRLLEVNLGATAIGTGVNTPAGYRHQVVAALSEVTGLELKSARDLIEATSDTGAYVHAHSAIKRAAMKLSKICNDLRLLSSGPRAGLNEINLPPRQAMPAKVNPVIPEVVNQVCFKVFGNDLTVTMAAEAGQLQLNVMEPVIGESLFQSLRILGNAAKTLREKCVVGITA : S76222
S76222            : SSDVLDTALALQLVASLDL.ILEQLEKLIQAIRYQAQQHRYTVMVGRSHGIHAEPITFGFKLAGWLAEVLRNRDRLVRVA.QSIAVGKISGAVGTYANIDPKVEAIACQKLGLEPDTAST......QVIS.RDRHAEYVQQLALLAASLERFAVEIRNLQRTDVLEVEEYFSKG.QKMPHKRNPIRSERLTGMARLVRG.HAVAALENVALWHERDISHSSVERVAFPDCCILTHFMLKETTDLVKNLLV : ACCPCAOP3
ACCPCAOP3         : SQDILDTACILQCRDALAI.VQNQVQQCYETALSQAQTYRHQVMMGRTWLQQALPITLGHKLARWASAFKRDLDRINAIKRVLVAQLGGAVGSLASLQDQGS...IVVEAYAKQLKLGQT..ACTWHGE..RDRIVEIASVLGIITGNVGKMARDWSLMMQTE...IAEVFEPTGRGMPHKRNPVAAASVLAAANRVPALMSSIYQSM.VQEHERSLGAWHAEWLSLPEIFQLTAGALERTLDVLKGMEV : PUR8_CHICK
PUR8_CHICK        : SCYVGDNTDLIVLRDGFNL.LLPKLARVISRLADFAETHADLPTLGFTHYQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLERARDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDHSKVEELDRLVTAKAGF.KRSYMVTGSRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLAN.....LKEIEEPFDQIMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLVLDPLQTASVQWFERTLDDSANRRVCLAEAFLTADIILSTLQNISEGLVV : S51377
S51377            : SCFVTDNADLIFIRDAYDI.IIPKLVNVINRLAKFAMEYKDLPVLGWTHFQPAQLTTLGKRATLWIQELLWDLRNFERARDIGLRGVKGTTGTQASFLALFHGNHDKVEALDERVTELLGF.DKVYPVTGSRKIDIDVLAPLSSFAATAHKMATDIRLLAN.....LKEVEEPFSQIMAYKRNPMRCERVCSLARHLGSLFSDAVQTASVQWFERTLDDSAIRRISLPSAFLTADILLSTLLNISSGLVV : CYSJ_THIRO

                  : 140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------324-------334-------344-------354-------364-------374-------384------- :
OrigSeq           : SNDVFPTAMHVAALLALRKQLIPQLKTLTQTLNEKSRAFADIVKIGRTHLQDATPLTLGQEISGWVAMLEHNLKHIEYSLPHVAELALGGTAVGTGLNTHPEYARRVADELAVITCAPFVTAPNKFEALATCDALVQAHGALKGLAASLMKIANDVRWLASGPRCGIGEISIPENEPMPGKVNPTQCEALTMLCCQVMGNDVAINMGGASGNFELNVFRPMVIHNFLQSVRLLADGMESFNKHCAVGIEP :OrigSeq
cons              : ------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EE----------------HHHHHHHHHHHH----EEEEE-------HH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :cons
dsc               : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHH--HH------------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH----HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :dsc
mul               : -------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------E----------HHHHHHHHHHH------------HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---H-----------H------------------HHHHHHHHHH------EE--------HEHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHH-H-- :mul
nnssp             : ------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------------------HHHHHHHHHHHH----EEEE--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E :nnssp
phd               : ------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEE--------------HHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :phd
pred              : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE---------------------------HHHHHHHHHH------EEEEE-----HHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEE--- :pred
zpred             : -----EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE---EEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH--HEEEE--EEEEEEE-------HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE--------EEEE----------EEEEEHHHHHHHHEEEE----EEEEH----HHHHH----HHHHHHHHHHEHHHHHHHHHHHHHHHEEEE :zpred


access            : EEEEBEBBBBBBBBBBBBBEBBEEBEEBBEEBEEEBEEBEEBBEBB-EBB-EBBBBEBBEEBBBBBBBBEEEBEEBEEBBEEBBEBBEEBEBBBBBBEBEEEBEEEBBEBBBEBBBBEB-EBEEEBEBBBE-EBBBBBBBBBEBBBBBBBEBBEEBEBBBEEEEBBBEEBBBEEEEE-EEE--EBBBEBBBBBBBBBBBB-BBBBBBBEEE-BEB-BB-BBBBBBBBBBBBBBBEBBBEBBEEBBEBBEE : access

PHD Rel           : 9998621467898999999999999999999999965454431113221136565541157899999999999999999989988622663101345667211689999999971663225423578864324888887889999999999887787961588562313434777799999894026899998976314310134413554025522541111577788999788988876554423459 : PHD Rel
Pred Rel          : 0099776877879998899868878889999999998887776656666778076665765588978887778888885768877567898777879987778899999998888786776777877878676777778668889899888876776656999888566600999990999999905888887966658876699656877755555876666558887777776655765656666000 : Predator Rel


dssp              : HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE--EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EE----------------HHHHHHHHHHHHH----EE---HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E--E---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH-EE :dssp
define            : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE-------EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEE-------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE :define
stride            : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE--EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE---------------HHHHHHHHHHHHHH----EE---HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-E-------EE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--E--E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH-EE :stride


Q3 values for 1fuqb-2-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	75.60	75.20	74.80
dsc	75.60	77.20	77.20
pred	73.20	73.60	72.40
mul	70.00	67.60	69.20
nnssp	76.00	76.40	75.20
zpred	70.40	68.80	69.20
cons	75.60	75.60	74.80