Results for 1fuqb-3-AUTO.1


1fuqb-3-AUTO.1    : NRERINQLLNESLMLVTALNTHIGYDKAAEIAKKAHKEGLTLKAAALALGYLSEAEFDSWVRPEQM : ATU82202
ATU82202          : NRERISKLLHESLMLVTSLNRKIGCDNAAAVAKKAHKEGCTLKEAALNLGVLTAEEFDTLVVPEKM : FUMH_PIG
FUMH_PIG          : NTERINKLMNESLMLVTALNPHIGYDKAAKIAKTAHKNGSTLKATAVELGYLTAEQFDEWVKPRDM : ASPA_SERMA
ASPA_SERMA        : NKEVCEHYVFNSIGIVTYLNPFIGHHNGDIVGKICAETGKSVREVVLERGLLTEAELDDIFSVENL : JC4982
JC4982            : NQGKLSEALARNPILVTALNPIIGYQKAAEIAKQAYREGRPIIDVALENTDLDRARLEVLLDPEKL : FUMH_YEAST
FUMH_YEAST        : NEPRIHELLTKSLMLVTALNPKIGYDAASKVAKNAHKKGITLKESALELGVLTEKEFDEWVVPEHM : FUMC_SULSO
FUMC_SULSO        : NVEKMKRYAESSPSLITIVSPVIGYDKATEIGKKLN.KGMSIREALRELGYSD.NEINKILDLSKL : ASPA_PSEFL
ASPA_PSEFL        : NEARCRELVEHSIGLVTALNPYIGYENATRIARIALESGRGVLELVREEGLLDDAMLDDILRPENM : BCGLTTASP1
BCGLTTASP1        : NEDRLKEYVEKSVGIITAVNPHIGYEAAARVAKEAIATGQSVRELCVKNGVLSQEDLELILDPFEM : ASPA_BACSU
ASPA_BACSU        : NEKRMKQYVEKSAGVITAVNPHLGYEAAARIAREAIMTGQSVRDLCLQHDVLTEEELDIILNPYEM : TTHILVB2
TTHILVB2          : NLERIEEHLNKNPMLATALNKAIGYDKAAEIVKKAIKEKKSLKQAALELGYLTEEEFDRIVVPMRL : S76348
S76348            : NESKVKDFLDTSLMLVTALNPHIGYDNAALVAKTAFAQGITLKQAAVDLGLLTPAQFDAWVVPEQM : FUMC_BRAJA
FUMC_BRAJA        : DEKRISELMQRSLMLVTALAPKIGYDNAAKVAKTAHANGTTLKEEALRLGFVTADEFDRLVQPEKM : FUMH_RHIOR
FUMH_RHIOR        : NEKKISSIMNESLMLVTALNPHIGYDKAAKCAKKAHKEGTTLKEAALSLGYLTSEEFDQWVRPEDM : HIU328203
HIU328203         : NYPRIKQQLENSLMLVTALNTHIGYENAAKIAKTAHKNGTTLREEAINLGLVSAEDFDKWVRPEDM : FUMH_BACSU
FUMH_BACSU        : NKETIQENLSNSLMLVTALNPHIGYENAAKIAKLAHKEGLTLKEAALKLELLTEEQFNEMVKPEDM : S76222

                  : 394-------404-------414-------424-------434-------444-------454--- :
OrigSeq           : NRERINQLLNESLMLVTALNTHIGYDKAAEIAKKAHKEGLTLKAAALALGYLSEAEFDSWVRPEQM :OrigSeq
cons              : --HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH----HHHHHHHHHH--- :cons
dsc               : ---HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH--- :dsc
mul               : --HHHHHHHH--HHHHHHH--------HHHHHHHHH-----HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH---- :mul
nnssp             : -HHHHHHHHHH---EE--------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH-H :nnssp
phd               : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHHH----- :phd
pred              : ---HHHHHHHHHHHEEE-------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH--HHHHHHHHH------ :pred
zpred             : HHHHHHHHHHHHHHEEEEEE--EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred

access            : EEEEBEEBBEEBBBBBBBBBE-BB-EEBBEBBEEBBEEE-EBEEBBBEBBBBBEEEBEEBB-EEEE : access

PHD Rel           : 962599887643555555522244478999999999517556999996164446887664145789 : PHD Rel
Pred Rel          : 007777999677886666877966788999999999669668999998666587777887888000 : Predator Rel

dssp              : -HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHH--HHH- :dssp
define            : EHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH--HHHHHHHHH----- :define
stride            : -HHHHHHHHHH----HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHH--HHH- :stride

Q3 values for 1fuqb-3-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	86.36	75.76	83.33
dsc	69.70	74.24	66.67
pred	69.70	78.79	68.18
mul	71.21	66.67	68.18
nnssp	77.27	81.82	78.79
zpred	65.15	71.21	63.64
cons	80.30	78.79	77.27