Results for 1gcb-2-AS


1gcb-2-AS    : DSTPVTNQKSSGRCWLFAATNQLRLNVLSELNLKEFELSQAYLFFYDKLEKANYFLDQIVSSADQDIDSRLVQYLLAAPTEDGGQYSMFLNLVKKYGLIPKDLYGDLPYSTTASRKWNSLLTTKLREFAETLRTALKERSADDSIIVTLREQMQREIFRLMSLFMDIPPVQPNEQFTWEYVDKDKKIHTIKSTPLEFASKYAKL : BLMH_RABIT
BLMH_RABIT   : EGKPVTNQKSSGRCWIFSCLNVMRLPFMKKLNIEEFEFSQSYVFFWDKVERCYFFLNAFVDTAQKKEPGRLVQYLLMNPTNDGGQWDMLVNIIEKYGVVPKKCFPES.HTTEASRRMNDILNHKMREFCIRLRNMV.HSGATKAEISATEDTMMEEIFRVVCICLGNPPET....FTWEYRDKDKNYQKIGPTPLEFYRQHVKP : LBAPEPC
LBAPEPC      : G..KPANQKQSGRCWMFSALNTMRHPLQKKFKLQDFELSQNYTNFWDKFEKSNWFFENVIATADKDLGDRKVSFLFATPQQDGGQWDMLCGIIEKYGIVPKSVYPET.ANATNSSALNDTLNTVLRKDGLELRRLV.NAGKSEDEVQARKEEMLNDVFRVLAISTCVPPKK....FNFEYRDDDHNYHIDKDTPKEFFDKYVG. : AB001322
AB001322     : EGKPVTNQKNSGRCWIFSCLNAMRLPFMKKYNIEEFEFSQSYLFFWDKVERCYYFLNAFVETAQKKEPGRLVQFLLTNPTNDGGQWDMLVNIVEKYGVVPKKYFPES.HTTEATRRMNEILNHKMREYCLRLRNMV.ATGTNKEELCAAMDTMIEEVFRIVSTCLGNPPET....FCWEFRDKEKNYHKFGPTPVQFYNEHVKP : LHU77050
LHU77050     : D..NVTNQKHSGRCWLFATLNVLRHEFGKKYKAKDFTFSQAYNFFWDKIERANMFYNRILDSADMPLDSRQVKTDLDFAGTDGGQFQMAAALVEKYGVVPSYAMPET.FNTNDTTGFATALGDKLKKDALVLRKLK.QEGKD.DEIKKTREKFLSEVYQMTAIAVGEPPKK....FDLEYRDDDKKYHLEKDTPLEFLHKYLGG : LDPEPGW2
LDPEPGW2     : D..NVTNQKQSGRCWLFSTLNVLRHDFGAKHKAKNFTLSQSYNFFWDKLERANLFYEKVIETADKPLDDREVRSYFDFAGHDGGQWHMAISLVKKYGVVPSYVMPES.FNTSATNGLASALADKERKDALALRRLA.QAGDQ.EGLEKARKTFLNEIYRMVAIAVGEPPKT....FDLEYRDDDKNYHLEKNTPVSFFNKYFD. : LDPEPGW1
LDPEPGW1     : D..NVTNQQQSGRCWLFSTLNVVRHNFGKANKAKNFTFSQSYNFFWDKIERANYFYDRIIATADRPLTDRTVRGYFDWCQTDGGQWHMAASLIAKYGVVPRYAMPES.FNSNHSQALDMVLADKERKDALTLRRLA.QADDQ.EKLEAARTDFLSQIYRIMATALGEPPKT....FDLEFRDDDKNYHLDKGTPVQFYKKYCA. : S52865
S52865       : G..SVTNQKQSGRCWMFSALNTMRHSIQKEFKLKGFELSQSYTFFWDKFEKSNFFFENVIGSADKPLGDRKVSFLFATPQSDGGQWDMLCGLIEKYGIVPKKVYPET.ANSENSRALNDTLNTMLRKGGLELRALV.NEGKSTEEVEAHKAELLDAIFRMLATSLGLPPKS....FNFEYTDDDGNYHIDKDTPQDFFKKYVG. : S48143
S48143       : D..EVSNQKASGRCWMFAALNTFRHKLISDFKLESFELSQAHTFFWDKYEKSNWFLEQIIATADQEIGSRKVKFLLDTPQQDGGQWDMVVSLFEKYGVVPKSVYPES.VASSNSRELNQYLNKLLRQDAQILRDLI.ASGADQAAVQAKKEEFLQEIFNYLAMTLGLPPRQ....FDFAYRDKDDNYRSEKGTPRAFFEKYVG. : PEPC_LACLC
PEPC_LACLC   : D..PVTNQKQSGRCWMFAALNTFRHKFINEFKTEDFEFSQAYTFFWDKYEKSNWFMEQIIGDVAMDD..RRLKFLLQTPQQDGGQWDMMVAIFDKYGIVPKAVYPES.QASSSSRELNQYLNKLLRQDAEILRYTI.EQDGD...VQAVKEELLQEVFNFLAVTLGLPPQN....FEFAFRNKDNEYKKFVGTPKEFYNEYVG. : FER_ARCLA

             : 60--------70--------80--------90--------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260- :
OrigSeq      : DSTPVTNQKSSGRCWLFAATNQLRLNVLSELNLKEFELSQAYLFFYDKLEKANYFLDQIVSSADQDIDSRLVQYLLAAPTEDGGQYSMFLNLVKKYGLIPKDLYGDLPYSTTASRKWNSLLTTKLREFAETLRTALKERSADDSIIVTLREQMQREIFRLMSLFMDIPPVQPNEQFTWEYVDKDKKIHTIKSTPLEFASKYAKL :OrigSeq
cons         : -------------EEEHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHEEEE--------HHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEE--------------HHHHHHH--- :cons
dsc          : -------------EEEHHHHHHHHHHHHHH------HH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHEEE---------HHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE-----------HHHHH--------------HHHHHH---- :dsc
mul          : --------------EEEH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHH-----HHHHHHHHH--------E-EEE-----------HHHHHHHH--EEE----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-H-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHE------------EHHHH--------------HHHHH----- :mul
nnssp        : -------------EEEEHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH--------HHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEE----------------HHHHHHHH-- :nnssp
phd          : ---------------EHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEE------HHHHHHHHHHHHH--EEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------EEEE-------------HHHHHHH--- :phd
pred         : -------------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH---------HHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEE-------EEE-------------- :pred
zpred        : ------------EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----HEEEEEEE--------EEEEEHHHHEEEEEEEEEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE------------HHHHHHHHH---------HHHH------ :zpred


access       : EEEEBEEEEEEEEBBBBBBBEBB-BEBBEEBEBEEBEBBEBBBBBBEEBEEB--BBEBBBEBBEEE-EEEEBEBBBE-BEEEEEEB-BBBBBBEEBBBBBEEB-EEBEEEBEBBEEBBEBBBEEB-EEBBBBEEBBEEEEEEEEEBEEBEEEBBEEBBEBBBBBBE-EEEEEEEEBBBEB-EEEEE-EEEEE-E-EBBEE-BEE : access

PHD Rel      : 999877767667212146888876563222345333111478889999999999999999997157563104667432668753688999999981541211367899877413589999999999999999999993267358999999999999999986543688899996542477447765555589836765422389 : PHD Rel
Pred Rel     : 008888889999868658888880767758856566785667877767788088888888876979777887777779999999707779999860007808888999797777778889888988988999999996799766999999999999999997856900090009066806790077650799876557777000 : Predator Rel


dssp         : ------E--E---HHHHHHHHHHHHHHHHH-------E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH---EHHH-----HHHHE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEEE-----EEEEEE-HHHHHHH---- :dssp
define       : EE-EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH-EEEE--HHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEEEE----EEEEEEEEEHHHHHHH---- :define
stride       : ------E--E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH---EHHH-----HHH-EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEEEE---EEEEEEE-HHHHHHHH--- :stride


Q3 values for 1gcb-2-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	79.90	74.51	79.41
dsc	76.96	73.04	75.49
pred	80.39	79.90	78.92
mul	66.18	61.76	64.71
nnssp	83.33	80.39	83.82
zpred	61.27	58.82	60.78
cons	82.84	79.41	82.35