Results for 1gdj


1gdj         : GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA : LGB1_PEA
LGB1_PEA     : .GFTDKQEALVNSSSE.FKQNLPGYSILFYTIVLEKAPAAKGLFSFLKDTAGVE.DSPKLQAHAEQVFGLVRDSAAQLRTKGVVLGNATLG...AIHVQKGVTNPHFVVVKEALLQTIKKASGNNWSEELNTAWEVAYDGLATAIKKAMKTA. : VUU33206
VUU33206     : VAFSDKQEALVNGAYEAFKANIPKYSVVFYTTILEKAPAAKNLFSFLAN..GVDATNPKLTGHAEKLFGLVRDSAAQLRASGGVVADAALG...AVHSQKAVNDAQFVVVKEALVKTLKEAVGDKWSDELGTAVELAYDELAAAIKKAY.... : HBPL_TRETO
HBPL_TRETO   : KVFTEEQEALVVKSWAVMKKNSAELGLKFFLKIFEIAPSAKNLFSYLKDSPIPLEQNPKLKPHAMTVFVMTCESAVQLRKAGVTVRESNLKRLGAIHFKNGVVNEHFET.RFALLETIKEAVPEMWSPEMKNAWGEAYDQLVAAIKSEMKPSS : KSU15288
KSU15288     : DPLSADQAALVKSSWKQVSHN....EADILYAVFKAYPDIQAKFPQFAGKDLEVKDTAAFATHATRIVSFLSEVIALSGEASLGAINNIVSKLGADHNGRGVTKAQFGEFRTALMAYLQAHVS..WGENVAAAWNHALDNTMEIAFKSMEH.. : LGB1_MEDSA
LGB1_MEDSA   : MSFTDKQEALVNSSWEAFKQNLPRYSVFFYTVVLEKAPAAKGLFSFLKNSAEVQ.DSPQLQAHAEKVFGLVRDSAVQLRATGVVLGDATLG...AIHVRKGVVDPHFVVVKEALLKTIKEAAGDKWSEELNTAWEVAYDALATAIKKAMS... : GLBD_CHITH
GLBD_CHITH   : SPLTADEASLVQSSWKAVSHN....EVDILAAVFAAYPDIQAKFPQFAGKDLAIKDTGAFATHATRIVSFLSEVIALSGNASAAAVEGLLNKLGSDHKARGVSAAQFGEFRTALVSYLSNHVS..WGDNVAAAWNKALDNTMAVAVAHL.... : GLBV_CHITP
GLBV_CHITP   : HPLTSDEANLVKSSWNQVKHN....EVDILAAVFKAYPDIQAKFPQFAGKDLDIKTSGQFATHATRIVSFLSELIALSGNEALSAVYGLVKKLGVDHKNRGITQGQFNEFKTALISYLSSHVS..WGDNVAAAWEHALENTYTVAFEVIPA.. : LGB1_LUPLU
LGB1_LUPLU   : GVLTDVQVALVKSSFEEFNANIPKNTHRFFTLVLEIAPGAKDLFSFLKGSSEVPQNNPDLQAHAGKVFKLTYEAAIQLQVNGAVASDATLKSLGSVHVSKGVVDAHFPVVKEAILKTIKEVVGDKWSEELNTAWTIAYDELAIIIKKEMKDAA : SESLBDRLA
SESLBDRLA    : MGFTDKQEALVNTSYEAFKKNLPGHSVLFYSFILEKEPAAKGLFSFLKDSDGVPQNNPSLQAHAEKVFGLVHDAAAQLRATGVVLADASLG...SVHVQKGVTDPHFVVVKEALLKTLKEAAGATWSDEVSIAWEVAYDGLAAAIKKAMS... : GLB1_PARCH
GLB1_PARCH   : GDLTLAQKKIVRKTWHQLMRNKTSFVTDLFIRIFAYDPAAQNKFPQMAGMSASLRSSRQMQAHAIRVSSIMSEY.IEELDSDLPELLATLA...RTHDLNKVGPAHYDLFAKVLMEALQAELGSDFNQKTRDSWAKAFSIVQAVLLVKHG... : S42045
S42045       : MALTEKQEALLKQSWEVLKQNIPAHSLRLFALILEAAPESKYVFSFLKDSNEIPENNPKLKAHAAVIFKTICESATELRQKGAVWDNNTLKRLGSIHLKNKITDPHFEVMKGALLGTIKEAIKENWSDEMGCAWTEAYNQLVATIKAEMKE.. : HMPA_ALCEU
HMPA_ALCEU   : .MLTQKTKDIVKATAPVLAEHGYDIIKCFYQRMFEAHPELKNVFNMAHQ.....EQGQQQQALARAVYAYAEN..IEDPNSLAVLKNIANK.....HASLGVKPEQYPIVGEHLLAAIKEVLGNAATDDIISAWAQAYGNLADVLMGMESELY : BAHG_VITST
BAHG_VITST   : .MLDQQTINIIKATVPVLKEHGVTITTTFYKNLFAKHPEVRPLFDMGRQ.....ESLEQPKALAMTVLAAAQN..IENLPAIPAVKKIAVK.....HCQAGVAAAHYPIVGQELLGAIKEVLGDAATDDILDAWGKAYGVIADVFIQVEADLY : S46502
S46502       : VVFSEEKEALVLKSWAIMKKDSANLGLRFFLKIFEIAPSARQMFPFLRDSDVPLETNPKLKTHAVSVFVMTCEAAAQLRKAGITVRETTLKRLGGTHLKYGVADGHFEVTRFALLETIKEALPDMWGPEMRNAWGEAYDQLVAAIKQEMKPAE : VFLB29MR
VFLB29MR     : MEFTLRQEALVNSSWEAFNQNLPLFSVLFYTFILEKAPIAKNMFSVLKDANEIPLANPSINAHTEMVFEMVRDAAAQLQTTGVVLGDTTLG...VVHTQKRVDGLHFMVVKEALLKTIKEAVGDKWSEELSNAWEIAYDGLAVAIMKEMS... : SESLBDRLB
SESLBDRLB    : GAFTESQEALVTSSYETFKQNASDLSVLFYTFILEKAPGAKNLFSFLKDSDGVPKDNPNLKAHAAKVFELVVDSAVQLRTKGVVIADANLG...PVHVQKGVTDAHFVVVKEALLKTVKEATGAKWSDELSNAWEVAYDELAAAIKKAMG... : HBP_CANLI
HBP_CANLI    : GAFSEKQESLVKSSWEAFKQNVPHHSAVFYTLILEKAPAAQNMFSFLSN..GVDPNNPKLKAHAEKVFKMTVDSAVQLRAKGVVLADPTLG...SVHVQKGVLDPHFLVVKEALLKTFKEAVGDKWNDELGNAWEVAYDELAAAIKKAMGSA. : A20801
A20801       : GAFTEKQEALVNSSFEAFKANLPHHSVVFFNSILEKAPAAKNMFSFLGD..AVDPKNPKLAGHAEKLFGLVRDSAVQLQTKGLVVADATLG...PIHTQKGVTDLQFAVVKEALLKTIKEAVGDKWSEELSNPWEVAYDEIAAAIKKAMAIGS : AAU46754
AAU46754     : AGLSGADIAVIRSTWAKVQGSGTDIGRSIFIKFFELDPAAQNEFPCKGES.LALKTNVLLGQHGAKFMEYITTAVGLDDYAGAHGPLTELG...SRHKTRGTTPANFGKAGEALLAILASVVGGDFTPAAKDAWTKVYNTISSTMQAAL.... : S13421
S13421       : TGITDAEKALVQESWDLLKPDLLGLGRKIFTKVFTKHPDYQILFTRTGDTPLTLDDNPAFGTHIIKVMRAFDHVIQILGKPKLMAYLRSVG...ADHIATNVERRHFQAFSNALIPVMQHDLKAQLRPDAVAAWRKGLDRIIGIIDQGLIGLK : GLB3_LAMSP
GLB3_LAMSP   : YECGPLQRLKVKRQWAEAYGSGEEFGHFIWTHVFKDAPSARDLFKRVRGD...NIHTPAFRAHATRVLGGLDMCIALLDDEGLNTQLAHLA...SQHSSRGVSAAQYDVVEHSVMMGVEHEIG..QNVFDKDAWQACLDVITGGIQGN..... : G3PA_CHOCR

             : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91--------101-------111-------121-------131-------141-------151 :
OrigSeq      : GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA :OrigSeq
cons         : ----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-HHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :cons
dsc          : --HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul          : ---H-HHHHHHH---HHH--------HHHHHHHHHH----HHHEEH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :mul
nnssp        : ----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd          : ----HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEHHHHH--HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred         : ---HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred        : -HHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEHHHHHHHHHHHHHHHEEE-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEHHHH-----EEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :zpred


access       : EEBEEEEEBBBEBBBEBBEEEBEEBBBBBBBBBBEE-EEBEEBBEBBEEEEEBBEE-EEBEE-BBEBBBBBBEBBBEBEEEBBBBBEBBBEEBBB-BBBEEBBEBBBEBBEEBBBEBBEEBBEEEBBEEBBEBBEBBBEEBBBBBEEBBEEEE : access

PHD Rel      : 999579999999999999981442137788899997257898777632566466789456899999999999999999632442333234531423344211114579999999999999974022158999999999999999999964179 : PHD Rel
Pred Rel     : 007777999999856776679998665777777880999988588768999898908768888888777888899888876656757768888665557788789658788999999999886777788777888888779099997777000 : Predator Rel


dssp         : ----HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- :dssp
define       : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :define
stride       : ----HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- :stride


Q3 values for 1gdj  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	87.58	82.35	87.58
dsc	83.66	81.70	83.66
pred	77.78	81.05	77.78
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nnssp	82.35	80.39	82.35
zpred	74.51	69.93	74.51
cons	86.27	83.01	86.27