Results for 1gnd-2-JAC


1gnd-2-JAC    : VPSTETEALASNLMGMFEKRRFRKFLVFVANFDENDPKTFEGVDPQNTSMRDVYRKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQPCLETINRIKLYSES : ATRABGDI
ATRABGDI      : VPATPMEALKSPLMGIFEKRRAGKFFSYVQEYDEKDPKTHDGMDLRRVTTKDLIAKFGLKEDTIDFIGHAVALHCNDNHLHQPAYDTVMRMKLYAES : PFRABGDI
PFRABGDI      : VPATDMEALVSPLLSLMEKNRCKNFYQYVSEWDANKRNTWDNLDPYKLTMLEIYKHFNLCQLTIDFLGHAVALYLNDDYLKQPAYLTLERIKLYMQS : CELRABGDI
CELRABGDI     : VPADEMEALATSLMGMFEKRRFKKFLVWVQQFDENKEDTWQGLDPHNSTMQQVYEKFGLDENTADFTGHALALYRDDEHKNQPYAPAVEKIRLYSDS : S36746
S36746        : VPVDQKEALASDLMGMFEKRRFRNFLIYVQDFREDDPKTWKDFDPTKANMQGLYDKFGLDKNTQDFTGHALALFRDDEYLNEPAVNTIRRIKLYSDS : VCU62866
VCU62866      : VPANRSEALSSQLMGLFEKRRARNFFLYVQDYEESDPKTHKGLDLKRMTMSELYKQYDLSEDTQDFIGHALGLHRDDAYLTQPALATVLRIKLYHES : GDI1_YEAST
GDI1_YEAST    : VPANEIEAISSPLMGIFEKRRMKKFLEWISSYKEDDLSTHQGLDLDKNTMDEVYYKFGLGNSTKEFIGHAMALWTNDDYLQQPARPSFERILLYCQS : YD4C_SCHPO
YD4C_SCHPO    : VPGNEMEALKSPLMSLFEKRRAKKFLEWVNNYREDDPSTYKDINIDRDSMESVFKKFGLQSGTQDFIGHAMALYLDDAYLKKPARETRERILLYASS : SYE_HAEIN

              : 119-------129-------139-------149-------159-------169-------179-------189-------199-------209---- :
OrigSeq       : VPSTETEALASNLMGMFEKRRFRKFLVFVANFDENDPKTFEGVDPQNTSMRDVYRKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQPCLETINRIKLYSES :OrigSeq
cons          : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEH----------------HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHEHE--------HHHHHHHHHHHE-- :cons
dsc           : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul           : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE------------------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHE---- :mul
nnssp         : --HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHH------------HHHHHH-------------HHHHHHHH-- :nnssp
phd           : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE------------------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHEEE--------HHHHHHHHHEEE-- :phd
pred          : -----HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHEEEE-----------------HHHHHHHHHH-------------EEE-----------HHHHHHHHHH--- :pred
zpred         : E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEE------------------HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHEEEE--- :zpred

access : EEEEEBEBBBEBBBEBBEE-EBEEBBBBBEEBEEEEEEEBEEBEBEEBBBEEBBEEBEBEEEBBEBBBBBBBBB-EEE-BEEEB-EBBE-BEB-BEE : access PHD Rel : 9993566787567757798999654312223136997543478885321689986416555615677544112213214457613566532211329 : PHD Rel Pred Rel : 0099778886660889999999887777755779090999898997777788777757899865666777707769997809997588897767000 : Predator Rel

dssp : ----HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH---------EHHHHHHH----HHHHHHHHHH-------HHHH-E-HHHHHHHHHHHH- :dssp define : EEEHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH :define stride : ----HHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH---------EHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH------HHHH-EHHHHHHHHHHHHHH :stride
Q3 values for 1gnd-2-JAC View SS in Rasmol dssp define stride phd 67.01 70.10 65.98 dsc 71.13 69.07 72.16 pred 62.89 65.98 60.82 mul 62.89 65.98 61.86 nnssp 63.92 70.10 60.82 zpred 57.73 63.92 54.64 cons 69.07 72.16 68.04