Results for 1hjrd-1-AUTO.1


1hjrd-1-AUTO.1    : AIILGIDPGSRVTGYGVIRQVGRQLSYLGSGCIRTKVDDLPSRLKLIYAGVTEIITQFQPDYFAIEQVFMAKNADSALKLGQARGVAIVAAVNQELPVFEYAARQVKQTVVGIGSAEKSQVQHMVRTLLKLPANPQADAADALAIAITHCHVSQNAMQ : MTCY2276
MTCY2276          : MRVMGVDPGLTRCGLSLIEGRGRQLTALDVDVVRTPSDALAQRLLAISDAVEHWLDTHHPEVVAIERVFSQLNVTTVMGTAQAGGVIALAAAKRGVDVHFHTPSEVKAAVTGNGSADKAQVTAMVTKILALQAKPTADAADALALAICHCWRAPTIAR : S76014
S76014            : QRWLGIDPGLAIIGWAILDQPDLSAHLVDYGIIETSKNLTPERLVEIEQDIHVLLEEFSPQAIAMEMPFFSRQIKAAGGVMQALGVINLVIYREKSIQPVFLHQSSWKCHLGNGKANKAEVAAMVQNFFGLEDLPIDDSVDAIAIALAGLNGVRNDIG : PSERUVABC2
PSERUVABC2        : TLILGIDPGSRITGFGVVRETARGCEYVASGCIRTGNGPLHERLHVVFRSVREVIRTHGPTALSIEQVFMARNADSALKLGQARGAAIVAAMEEGLSVAEYTASQVKQAVVGTGGADKQQVQMMVMHLLKLTQKPQIDASDALAIALCHAHTQQSLVP : HIV1ZAM18

                  : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91--------101-------111-------121-------131-------141-------151----- :
OrigSeq           : AIILGIDPGSRVTGYGVIRQVGRQLSYLGSGCIRTKVDDLPSRLKLIYAGVTEIITQFQPDYFAIEQVFMAKNADSALKLGQARGVAIVAAVNQELPVFEYAARQVKQTVVGIGSAEKSQVQHMVRTLLKLPANPQADAADALAIAITHCHVSQNAMQ :OrigSeq
cons              : -EEE-------EE-EEEEE------EEE---EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE-HHHHHEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-------- :cons
dsc               : -EEE----------EEHHH------HH-------------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-------- :dsc
mul               : -EEE----------EEEEE-----EEEEEEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH-----H--------EHHHHHH---H---EH------EEEE------HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---------- :mul
nnssp             : -EEE-------EE------------EEE-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE---------EEEE--------EE------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---------- :nnssp
phd               : -EEEEE----EEEEEEEEEE---EEEEEE-EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHEEEHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE-HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :phd
pred              : --------------EEEEE------------EEEE-----HHHHHHHHHHHHEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-------- :pred
zpred             : EEEEEE---EEEEEEEEEEE---EEEEEEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHHHEEEEHHHHHH--HHHHHHHHHEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH--------E :zpred


access            : E-BBBBEEEBEBBBBBBBEEBEEBBEBBBBBBBEBBEE-BEE-BBBBBEBBEBBBEEB-EEBBBBEBBBBBEEBEBBBEBBEBBBBBBBBBBEEEBEBBBBBBEEBEEBBBBEEEBEEBEBBBBBBBBBEBEEEEEBEBBEBBBBBBBBB-BBEE-BE : access

PHD Rel           : 97999768832245344431343368752205765488433588877888999998217311112313422105899977865323422246427742242223444224213644799999999999996479815799999999998653213699 : PHD Rel
Pred Rel          : 00660999006568665655777855577766668897978809877066587805600870877978787678667787578668667678767655578878687586768997889999909999808899997777709980765669999000 : Predator Rel


dssp              : --EEEEE-----EEEEEEEEE--EEEEEEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEHHHHHHHH-------HHH-HHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHH------ :dssp
define            : EEEEEEEEE--EEEEEEE----EEEEEEE-EEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEE-EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH--- :define
stride            : -EEEEEE----EEEEEEEEEE--EEEEEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH----- :stride


Q3 values for 1hjrd-1-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	79.75	76.58	83.54
dsc	63.29	56.96	63.92
pred	64.56	56.96	65.19
mul	62.03	50.63	63.92
nnssp	61.39	52.53	62.03
zpred	65.82	62.66	68.99
cons	71.52	67.09	73.42