Results for 1ignb-2-GJB


1ignb-2-GJB    : FSADEDYTLAIAVKKQFYRDLFQIDPDTGRSLIRTQSRRGPIAREFFKHFAEEHAAHTENAWRDRFRKFLLAYGIDDYISYYEAEEPMKNLT : S34197
S34197         : FTSEEDYNLAVAVKKQFYRDAFQRDPDTGASLIAEDDRRGPLSREFFKLFALEVPTHSENAWRDRFRKFILPYGIDSYISYYEKPESIKNMT : RAP1_YEAST
RAP1_YEAST     : ............VKKQFYRDLFQIDPDTGRSLITDEDRRGPIAREFFKHFAEEHAAHTENAWRDRFRKFLLAYGIDDYISYYEAPEPMKNLT : S42552

               : 449-------459-------469-------479-------520-------530-------540-------550-------560-------57 :
OrigSeq        : FSADEDYTLAIAVKKQFYRDLFQIDPDTGRSLIRTQSRRGPIAREFFKHFAEEHAAHTENAWRDRFRKFLLAYGIDDYISYYEAEEPMKNLT :OrigSeq
cons           : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HEEEEHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH---------- :cons
dsc            : -----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------- :dsc
mul            : ---HH--HHHHHHHH-------EE-------EEE-----HHHHHHHHHHHHHHH----HHH----HHHHHHH-----EEE------H-HHH- :mul
nnssp          : ------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHH-----HHHHH :nnssp
phd            : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE---------- :phd
pred           : ------HHHHHHHHHHHHHHH---------EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH-----HHHHHH--------- :pred
zpred          : -------HHHHHHHHEEEEEEEEE------EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEE--EEEEEEE-HHHHHHHHHH :zpred

access : EEEEEE-BBBBBBEEEBBEEBBEBEEEEB-BBBBEEEEE-EBBEEBBE-BBEEBBEEBEEBB-EEB-EBBBB-BBEBBBBB-EBEEEBEEBE : access PHD Rel : 99847656899999999999996386676333451568784159999999998513367989999999998815332113311511110399 : PHD Rel Pred Rel : 00700008098009077875857899099966877779096668609999999898998887999909998878897057798770009000 : Predator Rel

dssp : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-E------E--------------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHH-HHHH-HHHHHHHHHH-------- :dssp define : EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------- :define stride : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-E------E--------------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH------- :stride
Q3 values for 1ignb-2-GJB View SS in Rasmol dssp define stride phd 71.74 71.74 71.74 dsc 63.04 61.96 63.04 pred 71.74 71.74 71.74 mul 54.35 52.17 54.35 nnssp 64.13 65.22 64.13 zpred 47.83 46.74 48.91 cons 70.65 70.65 70.65