Results for 1krca-1-AUTO.1


1krca-1-AUTO.1    : MELTPREKDKLLLFTAALVAERRLARGLKLNYPESVALISAFIMEGARDGKSVASLMEEGRHVLTREQVMEGVPEMIPDIQVEATFPDGSKLVTVHNPII : URE1_HELFE
URE1_HELFE        : MKLTPKELDKLMLHYAGRLAEEALARGVKLNYTEAVALISGRVMEKARDGKSVADLMQEGRTWLKKENVMDGVASMIHEVGIEANFPDGTKLVTIHTPVE : URE3_PROMI
URE3_PROMI        : MELTPREKDKLLLFTAGLVAERRLAKGLKLNYPERVALISCAIMEGAREGKTVAQLMSEGRTVLTAEQVMEGVPEMIKDVQVECTFPDGTKLVSIHSPIV : URE3_YEREN
URE3_YEREN        : MQLTPREVEKLMIYTLSDVAFKRKARGLKLNYPEAVSIITETAMEGARDGKSVEDVMKEASKVLTKDDVMDGVADLIPNVQVEAIFTDGSRLVTVHDPIK : UREUREASEA1
UREUREASEA1       : MNLSLREVQKLLITVAADVARRRLARGLKLNYSEAVALITDHVMEGARDGKLVADLMQSAREVLRVDQVMEGVDTMVSIIQVEVTFPDGTKLVSVHDPIY : MTCY35924
MTCY35924         : MRLTPHEQERLLLSYAAELARRRRARGLRLNHPEAIAVIADHILEGARDGRTVAELMASGREVLGRDDVMEGVPEMLAEVQVEATFPDGTKLVTVHQPIA : UREA_CANEN
UREA_CANEN        : MKLSPREVEKLGLHNAGYLAQKRLARGVRLNYTEAVALIASQIMEYARDGKTVAQLMCLGQHLLGRRQVLPAVPHLLNAVQVEATFPDGTKLVTVHDPIS : AB002590
AB002590          : ..MQPRELHKLTLHQLGSLAQKRLCRGVKLNKLEATSLIASQIQEYVRDGHSVADLMSLGKDMLGKRHVQPNVVHLLHEIMIEATFPDGTYLITIHDPIC : URE1_HELMU
URE1_HELMU        : ............LHYAGELAKKRKERGVKLNYVEAVALISMEIMEHAREGKTVADLMSLGRQVLKAEDVMDGVAALVHEVQIEVCFPDGTLLVTVHNPIE : AF0005793
AF0005793         : MELTPREKDKLLIFTAALLAERRRARGLKLNYPETVALITAALMEGARDGKTVAELMSEGTRILGRDEVMEGVPEMISNIQVEVTFPDGTKLITVHNPVV : URE3_RHIME
URE3_RHIME        : MNLTPREKDKLLISMAAMVARRRLERGVKLNHPEAIALITDFVVEGARDGRSVAELMEAGAHVLTRDQVMEGIAEMIHDIQVEATFPDGTKLVTVHEPIR : URE3_BACPA
URE3_BACPA        : MHLNPAEKEKLQIFLASELLLRRKARGLKLNYPEAVAIITSFIMEGARDGKTVAMLMEEGKHVLTRDDVMEGVPEMIDDIQAEATFPDGTKLVTVHNPIS : BSATPC14
BSATPC14          : MKLTPVEQEKLLIFAAGELAKQRKARGVLLNYPEAAAYITCFIMEGARDGKGVAELMEAGRHVLTEKDVMEGVPEMLDSIQVEATFPDGVKLVTVHQPIS : SSU352481
SSU352481         : MQLTMREQKKMMISLAAMIAQRRKDKGIKLNHPEAVALITDYVLEGAREGKTVAQLMDEARNLLTREDVMEGIAEMIPMIQVEATFTDSTKLVTVHDPIQ : URE3_LACFE
URE3_LACFE        : MRLTKREQEKMMISLAGMIAEKRKDRGLKLNQPEAVALITSRLLEGARDGKTVGELMNEGATWLTKDDVMEGIPEMIPMIQVEATFPDGTKLITVTDPIR : CPUREABC
CPUREABC          : MYLTTKEKEKLMISVVAEIARKRQARGLKLNYPEAVAIITDAILEGARDGKLVKDLMSYGRTILKREDVMEGVPEMIEMVQVEATFLDGTKLVTVHNPIQ : S74889
S74889            : MQLSPQEKDKLLIFTASLVAERRKARGLKLNYPEAVAYISAAILEGARDGRTVAELMNYGATLLSRDEVMEGVPEMLPEVQVEATFPDGTKLVTVHEPIR : URE3_HAEIN
URE3_HAEIN        : MHLTSREQEKLMLFLAGELAAKRKARGVKLNYPETIAYIASHLQEAAREGMSVAEVMQYGATLLTVDDVMEGVAEMVHEVQIEATFPDGTKLVTVHNPIR : URE3_BACSB
URE3_BACSB        : MKLTSREMEKLMIVVAADLARRRKERGLKLNYPEAVAMITYEVLEGARDGKTVAQLMQYGATILTKEDVMEGVAEMIPDIQIEATFPDGTKLVTVHDPIR : URE3_STAXY
URE3_STAXY        : MHFTQREQDKLMLVIAADLARRRQQRGLKLNYPEAVAIISFELLEGARDGKTVAELMSYGKQILGEDDVMEGVADMLTEMEIEATFPDGTKLITVHHPIV : TFU66074

                  : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91-------- :
OrigSeq           : MELTPREKDKLLLFTAALVAERRLARGLKLNYPESVALISAFIMEGARDGKSVASLMEEGRHVLTREQVMEGVPEMIPDIQVEATFPDGSKLVTVHNPII :OrigSeq
cons              : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE-----EEEEE----- :cons
dsc               : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE---------EEE----- :dsc
mul               : ---H---HHHHHHHHHHHHHHHH----H-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHEEE-----EEEEE----- :mul
nnssp             : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHEEEE-----EEEEE----- :nnssp
phd               : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHEE-HHHHHHHHHHHHHHEEEEE-----EEEEEE---- :phd
pred              : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH---HHHHHHHH-----HHHHHHHEEEE-----EEEEE----- :pred
zpred             : HH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-E----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE-----EEEEEE---- :zpred


access            : EEBEEEEEEEBBBBBBBEBBEEEEEEBBEBE-EEBBBBBBBBBBEBBEEEEEBBEBBEEBEEBBBEEEBBEBBBEBBBEBBBEBBBEEBBEBBBB-EEBE : access

PHD Rel           : 9999256788899999999999999557248367899999999998425517999999643231023576779999863325686399979988836889 : PHD Rel
Pred Rel          : 0097778999999999999990008696068776777079989777777065777997706777768676688887888865500099998005590000 : Predator Rel


dssp              : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E-HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---HHHE----HHH--EEEEEEEE--EEEEEEEE---- :dssp
define            : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH--------HHHHHH-EEEE------EEEEEEEEE--- :define
stride            : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E-HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH--------E---HHHH--EEEEEEEE--EEEEEEEE---- :stride


Q3 values for 1krca-1-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	78.00	77.00	77.00
dsc	70.00	74.00	67.00
pred	75.00	68.00	70.00
mul	66.00	65.00	63.00
nnssp	79.00	74.00	74.00
zpred	73.00	73.00	70.00
cons	78.00	75.00	75.00