Results for 1ktq-1-AUTO.1


1ktq-1-AUTO.1    : ALEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHME : NRL_1TAQ2
NRL_1TAQ2        : ALEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHME : DPO1_THEAQ
DPO1_THEAQ       : ALEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHME : DPO1_THETH
DPO1_THETH       : PLEEAPWPPPEGAFVGFVLSRPEPMWAELKALAACRDGRVHRAADPLAGLKDLKEVRGLLAKDLAVLASREGLDLVPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEDAAHRALLSERLHRNLLKRLEGEEKLLWLYHEVEKPLSRVLAHME : TAU62584
TAU62584         : PLEEAPWPPPEGAFVGFVLSRPEPMWAELKALAACRDGRVHRAADPLAGLKDLKEVRGLLAKDLAVLASREGLDLVPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEDAAHRALLSERLHRNLLKRLQGEEKLLWLYHEVEKPLSRVLAHME : DPO1_THEFL
DPO1_THEFL       : AAEEAPWPPPEGAFLGFSFSRPEPMWAELLALAGAWEGRLHRAQDPLRGLRDLKGVRGILAKDLAVLALREGLDLFPEDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEDAGERALLAERLFQTLKERLKGEERLLWLYEEVEKPLSRVLARME : GLR3_ECOLI

                 : 293-------303-------313-------323-------333-------343-------353-------363-------373-------383-------393-------403-------413-------423-------433-------443 :
OrigSeq          : ALEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHME :OrigSeq
cons             : -------------EEEEEE----HHHHHHHHHHHHH---E-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH-------HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- :cons
dsc              : -------------EEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHH-----------HHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul              : ----------------EE-------HHHHHHHHHHH----HH-----HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHH----------------H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH :mul
nnssp            : -------------EEEEEE----HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHH-------HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd              : ------------EEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHH---E-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH------HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- :phd
pred             : -------------EEEE-------HHHHHHHHHHH----EEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH--- :pred
zpred            : HHH---------EEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHEEEEEE-------EEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred

access : EEEEBEEEEEEEBBBBBBBB-EEEBBBEBBBBBBB-EBEB-EBEEEBEBBEEBEEBEEBBBEEBBBBBBEEBBE-BEEEEEBBBBBBBEEEEE-EEBBBEE-EEEBBEEBBEEBBBBE-BBEEB-EEBEEEEEBBBB-EEBEEEBBEBBBEBE : access PHD Rel : 978999999875378887478879999999999985253111435577899799999999999999999983345768849998766256679836423443762259999999999999999999714469999999997435799887427 : PHD Rel Pred Rel : 000000000070656675587776688899999990896777907768888909908688799894979976680000076660077799999997000656899766690999099999088999999999099009987877687666000 : Predator Rel

dssp : ---EE--------EEEEEE----HHH--EEEEEEEE--EEEE---HHHHH-----E----HHHHHHHHHH------E---HHHHHHHH------HHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH :dssp define : ------------EEEEEEEE-----------------EEEEEEEHHHHHH----EEEE-HHHHHHHHHHHHH-EEEEEEHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :define stride : ---EE--------EEEEEE----HHH--EEEEEEEE--EEEE---HHHHHHH---E----HHHHHHHHHHH-----E---HHHHHHHH------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :stride
Q3 values for 1ktq-1-AUTO.1 View SS in Rasmol dssp define stride phd 73.20 67.97 76.47 dsc 66.01 61.44 67.97 pred 66.01 58.17 67.97 mul 65.36 54.90 64.71 nnssp 75.16 66.67 78.43 zpred 65.36 56.21 67.32 cons 75.16 68.63 78.43