Results for 1lis-1-DOMAK


1lis-1-DOMAK    : HYVEPKFLNKAFEVALKVQIIAGFDRGLVKWLRVHGRTLSTVQKKALYFVNRRYMQTHWANYMLWINKKIDALGRTPVVGDYTRLGAEIGRRIDMAYFYDFLKDKNMIPKYLPYMEEINRMRPADVPVKYM : HLTLYSINC
HLTLYSINC       : GYIPRTRLNRAFEVALKVQIIAGFDRKLTSWLGRHGSRLSAIQRKTLYFVNRRYLQTHWSAYMVWINKRIAALGRTATTADYNNLGAEIGRRIPMEVTYSFLVRRNLIPKWRPYMAAIMAKSAADLEVARG : HLTLYSINXA
HLTLYSINXA      : TFIPRKRLPMAHEVALKVEIIAGFNKKLDIWLARHGSRLSPIQKKTLYFVNRRYMQTHWSNYMLWVKRRINSLGRPGTTADYRNLGAEIGRRVPLELTYSFLVRRNLIPQWRQYMADLMARRVADIPVARG : ELYS_HALKA
ELYS_HALKA      : TYVQPKFLNKAFEVALKEEIIVRWDRKLAKWLRVNGGPLSHVQKKALYFVNRRYMQTHWANYMLWINKKTDALGRTPVVGDYRRLGAEIGRRIDMVFFYKFLSGRNMIPKYMPYMEQINRMRAADIPVKYM : HLTASL
HLTASL          : HFVAHKHVSRPFEVALKVQIIAGFDRQLASWLQRHGRRLSAIQKKTLYFVNRRYMQTHWQAYMVWIVKQIEKLGRSPNVGDYSYVGAEIGRRIPLEVTYSFLVRRNLIPQWRQYMANLMAKRVEDIPVR.. : ELYS_HALCO
ELYS_HALCO      : RFIPHKYIRKEFEVALKVEIIAGFDRTLVKWLRVHGGRLSTVQKKALYFVNRRYMQTHWQNYMLWIVRKTDALGRPPVVADYSRLGAEIGRRIDMAYFYNFLNGRNMIPKYLPYMEEINRMRPADVPVANR : HLTLYSINJ
HLTLYSINJ       : HFVQHQYVDKAFEIALKEEIVAGFDRTLVKWLRVHGRGLTPVQKKALYFVNRRYMQTHWQNYMLWIVKKIDALGRTPVVGDYRRLGAEIGRRIDMDYFYNFLKNRNMIPKYMPYMEELNRMPARDIPVKNA : HLTSPLYSAC
HLTSPLYSAC      : ......QLTRQFEVALKVQIIAGFDKKLAAWINRHGRGLSAVQKKTLYFVNRRYMQTYWQNYMLFVDEKIRKLGRAPNVNDYTAIGAEIGRRVPLQIIYPILIKYNILPKWHPYMGKVLSLRVEDIPVDYY : ELYS_HALFU
ELYS_HALFU      : TFVRYHYINKAYEVTMKIQIISGFDRQLTAWLRVHGRRLTNNQKKTLFFVNRRYMQTHWQNYMLWVKRKIKALGRPAAVGDYTRLGAEIGRRVDMVFFYNFLSGRKMIPPYSAYMAKLNALRPADVPVKNH : HLTLYSINB
HLTLYSINB       : HFTAHRRISRRFEAALKVQIILGFDKKLATWLARYGKNLSAIHKKTLYFYNRRHMQTHWQSYMRFTEKDIRKLGRPPNSNDYTRIGAEIGRRIPIELMYSFMVRRNMIPRWRPYMGVLLSKRKEDIPVN.. : HLTLYSIND
HLTLYSIND       : GYPPGTFLSKAKLSALKTQIIAGFDRKLASWLRRHGNRLSAIQKKTLYFVNRRYMQTHWRSYMKFVRNQMKLLGRAETTADYNRVGAAIGKRIPLEITYSFLVRRNLIPKWKPYMARLMARRPGDIPTSRG : HLTLYSINXX
HLTLYSINXX      : GFVPHRRLARQFEVALKVQIIAGFDRKLSGWLTRHGSRLSPIQRKTLYFVNRRYMQTLWQNYFRFVARRIGKLGRAPNVNDYNAVGAEIGRRVPLEVTYSFLVRRNLIPTWRQYMANLLARRVEDIPVR.. : HLTLYSINF
HLTLYSINF       : YFIRHQYLAKPFEVALKVQIVAGFDRKLTAWLRRHGSHVSAIKRKTLYFVNRRYMQTHWQAYMVWIVRKIKALGRPPTVADYTALGAEIGRRIPLEVTYSFLVRRNLIPSWRPYMARLMAKRPADIPIR.. : SCMFABP

                : 4---------14--------24--------34--------44--------54--------64--------74--------84--------94--------104-------114-------124-------1 :
OrigSeq         : HYVEPKFLNKAFEVALKVQIIAGFDRGLVKWLRVHGRTLSTVQKKALYFVNRRYMQTHWANYMLWINKKIDALGRTPVVGDYTRLGAEIGRRIDMAYFYDFLKDKNMIPKYLPYMEEINRMRPADVPVKYM :OrigSeq
cons            : -----HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH-----HHHHHHEEEH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH---------- :cons
dsc             : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH------- :dsc
mul             : -------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH--------H--EEEEEE----HHH--HHHHHHHHHH-HHH--------------H-----EEEEEE-EEE----------HHHHHHHHH--------- :mul
nnssp           : -----HHHHHHHHHHHHHHEE----HHHHHHHHHH-----------EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHH-----HHHHHHHH--------HHHHHHHHHH----------- :nnssp
phd             : -----HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH-----HHHHHEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----EEEEEEEEE------HHHHHHHHHHHHH---------- :phd
pred            : -------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHH--------HHHHHHHHHHH--------- :pred
zpred           : ---------HHHHHHHHHHHEHHHH--HHHHEE-------HHEEEEEEEEE----EE----HEHHHHHH----EE--EEEEEEEEEHHEEEEEEEEEEEEEH----------EHHHHHHHHH--EEEE--- :zpred


access          : E--E-EEBEEEBEBBBEBEBBBEBEEEBBE-BEEEEEEBEEBEEEBB-BBB-E-BEE-BBBBBBBBBEEBEE-EEEEEBEEBE-BBBEBBEEBEBEBBBBBBBB-EBBEEB-E-BBEBBEE-EEEBE-EEE : access

PHD Rel         : 99653133689999988775313333689999983456416776335531022578989988899998998517987642267889885565014665665405667646799999998642789641789 : PHD Rel
Pred Rel        : 00987786889999909967766777878777777977768877870005677777977708779999988879999988606667878586855555857857779889960888888807998888000 : Predator Rel


dssp            : ---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH--------HHHHHHHH--HHH------ :dssp
define          : EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----EEEEEE :define
stride          : ---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH--HHH------ :stride


Q3 values for 1lis-1-DOMAK  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	68.70	60.31	68.70
dsc	84.73	74.81	87.02
pred	79.39	73.28	80.15
mul	57.25	48.85	57.25
nnssp	70.23	59.54	70.99
zpred	48.85	44.27	47.33
cons	75.57	67.94	76.34