Results for 1lki-1-AS


1lki-1-AS    : NATCAIRHPCHGNLMNQIKNQLAQLNGSANALFISYYTAQGEPFPNNVEKLCAPNMTDFPSFHGNGTEKTKLVELYRMVAYLSASLTNITRDQKVLNPTAVSLQVKLNATIDVMRGLLSNVLCRLCNKYRVGHVDVPPVPDHSDKEAFQRKKLGCQLLGTYKQVISVVVQAF : S23068
S23068       : NATCNTHHPCPSNLMSQIRSQLAQLNGTANALFILYYTAQGEPFPNNLDKLCGPNVTDFPPFQPNGTEKVRLVELYRIVAYLGTALGNITRDQKTLNPTAHSLHSKLNATADTLRGLLSNVLCRLCSKYHVAHVDVAYGPDTSGKDVFQKKKLGCQLLGKYKQVMAVLAQAF : LIF_RAT
LIF_RAT      : NATCAIRHPCHGNLMNQIKSQLAQLNGSANALFISYYTAQGEPFPNNVDKLCAPNMTDFPPFHANGTEKTKLVELYRMVTYLGASLTNITWDQKNLNPTAVSLQIKLNATTDVMRGLLSSVLCRLCNKYHVGHVDVPCVPDNSSKEAFQRKKLGCQLLGTYKQVISVLAQAF : ELYS_HALKA

             : 9---------19--------29--------39--------49--------59--------69--------79--------89--------99--------109-------119-------129-------139-------149-------159-------169-------17 :
OrigSeq      : NATCAIRHPCHGNLMNQIKNQLAQLNGSANALFISYYTAQGEPFPNNVEKLCAPNMTDFPSFHGNGTEKTKLVELYRMVAYLSASLTNITRDQKVLNPTAVSLQVKLNATIDVMRGLLSNVLCRLCNKYRVGHVDVPPVPDHSDKEAFQRKKLGCQLLGTYKQVISVVVQAF :OrigSeq
cons         : -------------HHHHHHHHHHHHH----HEEEEE--------------------------------EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EHHEEE----HHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE---------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH- :cons
dsc          : -------------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHH---------HHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH------HHEE----HHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH--- :dsc
mul          : -------------HHHHH--HHHH------EEEEEEE------------HHEE---------------HH-HHHHHHHHE-EHH---EE------------EEEE--------------EEEEEH----------EEE-------HHH------EEEE---EEEEEEEHH-- :mul
nnssp        : -------------HHHHHHHHHHHH------EEEEE---------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-------EE----------HHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH :nnssp
phd          : --EE-------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHEEEEEEEE------------------------------EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE---------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH- :phd
pred         : -------------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH--------------------------------HHHHHHHHHHHHH--------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred        : HH-----------EHHEEEEEEEE-----HEEEEEEE--------------EEE---EEE-------HHHHHHHHHEEEEEEE---EEEEE--------HHHHHEHHEHHEEEEEE---EEEEEE----EEEEEEEEE-----HHHHHHH----EEEE--EEEEEEEEHHHH :zpred


access       : EBEBBBEBEBEEEBBEEBEBEBBEBEEEBBBBBBBBBBBEEEEBEE-BEEBBBEEBEEBBEB-EEEEEEBEBBEBBEBBBBBBBBBEEBEEE-EEBEEEBBBBBBEBEBEBEBBEBBBBEBBBEBBBE-BBBBBEBBEBEEEEEEEBBEEEEBBBEBBEE-EEBBBBBBEBE : access

PHD Rel      : 9644146788322489999999998431221554577537537887111135755689998899986123325899999999999776222113479764154533246279999999999998642126776536789899816899996637533436889999999868 : PHD Rel
Pred Rel     : 0088890979900768999999907699967887895699099990086668090900899999999050709999900088866685566776689770807576566889755658880787557666657800900000007599999865577565085870006000 : Predator Rel


dssp         : -EEHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dssp
define       : -------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH-----EEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :define
stride       : -EE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :stride


Q3 values for 1lki-1-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	68.02	61.05	71.51
dsc	79.65	73.26	78.49
pred	72.09	65.70	73.26
mul	41.86	39.53	44.77
nnssp	66.86	59.30	69.19
zpred	33.72	35.47	36.63
cons	71.51	65.12	73.84