Results for 1lmb3


1lmb3       : PLTQEQLEDARRLKAIYEKKKNELGLSQESVADKMGMGQSGVGALFNGINALNAYNAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS : A41879
A41879      : SRNTNPLSARLTLAKNVKKMRGELGLSQESLADLVGIKRTYIGSIERAERNISIDNIERIANALNVSISILMMEHENESPRSK.... : LIF_RAT

            : 6---------16--------26--------36--------46--------56--------66--------76--------86----- :
OrigSeq     : PLTQEQLEDARRLKAIYEKKKNELGLSQESVADKMGMGQSGVGALFNGINALNAYNAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS :OrigSeq
cons        : -----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH-- :cons
dsc         : -----HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH--- :dsc
mul         : ------HHHHHHHHHHHHHHH-HH---HHHHHH-----------------------HHHHHHHHH-E-------HHH-HH------- :mul
nnssp       : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd         : -----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred        : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH--- :pred
zpred       : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :zpred

access      : EEEEEEBEEEEEBEEBBEE-EEEBEBEEEBBBEBBEBEEBBBBBBBEBBEBBBB-BBBBBBEBBEBBBBBBBBEBBEEBEEBEEBBE : access

PHD Rel     : 999825589999999999974115973889999952332123789999875247899999999633113444266532378654239 : PHD Rel
Pred Rel    : 008777990000000099096666900798997677709985555665777666669999999845550000998909996777000 : Predator Rel

dssp        : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH---HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---HHH--HHHHHHHHHHH---- :dssp
define      : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH-- :define
stride      : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH---HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHH--HHHHHHHHHHHH--- :stride

Q3 values for 1lmb3  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	75.86	81.61	79.31
dsc	73.56	79.31	77.01
pred	75.86	72.41	79.31
mul	67.82	59.77	64.37
nnssp	82.76	74.71	81.61
zpred	71.26	65.52	66.67
cons	77.01	78.16	80.46