Results for 1lpe-1-DOMAK


1lpe-1-DOMAK    : GQRWELALGRFWDYLRWVQTLSEQVQEELLSSQVTQELRALMDETMKELKAYKSELEEQLTPVAEETRARLSKELQAAQARLGADMEDVCGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVYQAGA : S18199
S18199          : LAKVEKEKQATENKVKNLT.EEMATLDENISKLTKKSLQEAHQQVLDDLQAEEDKVNKAKVKLEQQV.DDLEGSLEQEKK.VRMDLERAKRKLEG...DLKLTQESDLENDKLQMEEKLKKKEFEMSQLNS............. : OCU32574
OCU32574        : IR..AFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMAKEEFEKTKESLAKAEAKEKELEEKMVALMQEK.NDLQLQVQAEAD.SLADAEERCDQLIKTKIQLEAKIKEERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTL : APA4_RAT
APA4_RAT        : EVTSDQVANVMWDYFTQLSNNAKEAVEQLQKTDVTQQLNTLFQDKLGNINTYADDLQNKLVPFAVQLSGHLTKETERVREEIQKELEDLRANMMPHANKVSQMFGDNVQKLQEHLRPYATDLQAQINAQTQDMKRQLTPYIQRM : JT0672
JT0672          : QSPWDRVKDFATVYVDAIKDSGRDYVAQFEASALGKHLKLKLLDNWDSLGSTFTKVREQLGPVTQEFWDNLXKETEALRQEMSKDLEEVKKKVQPYLDDFQNKWQEEMETYRQKMAPLGAEFREGARQKVQELQEKLSPLAEEL : S39083
S39083          : MN...KKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAAALRKADSTAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEI.DDLASNMESVSK.AKASLEKTCRALEDQMSEIKTKEEERMINDVNAQRARLQTESGEYSRQVE..EKD.ALISQLS : OCAPOAIR
OCAPOAIR        : RSSWDKIKDFATVYVDTVKDSGREYVAQFEASAFGKQLNLKLLDNWDSLSSTVSKLQEQLGPVTQEFWDNLEKETEGLREEMNKDLQEVRQKVQPFLDEFQKKWQEEVERYRQKVEPLGAELGESARQKLTELQEKLSPLAEEL : CCU53861
CCU53861        : IR..AFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMQKEEFGHLKEALEKSEARRKELEEKMVSMLQEK.NDLQLQVQAEQD.NLADAEERCDQLIKNKIQLEAKVKEERLEEEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELSL : D85133
D85133          : ...........TPYYREVREMWLKDTEALRAELTKEEVKEKIRPFLDQFAKWTEEVEQRLAPVAQELKDLTKQKVELMQAKLTPVAEEVRDRLREQVEELRKNLAPYSSELRQKLSQKLEEIRERGIPQASEYQAKVVEQLSNL : APE_MOUSE
APE_MOUSE       : NQPWEQALNRFWDYLRWVQTLSDQVQEELQSSQVTQELTALMEDTMTEVKAYKKELEEQLGPVAEETRARLGKEVQAAQARLGADMEDLRNRLGQYRNEVHTMLGQSTEEIRARLSTHLRKMRKRLMRDAEDLQKRLAVYKAGA : DMD_MOUSE
DMD_MOUSE       : NSNWIAVTSRVEEWLNLLLEYQKHMETFDQNIEQITKWIIHADELLDESKKKPQQKEDILKRLKAEM.NDMRPKVDSTRDQAAKLMANRGDHCRKVVEQISELNRRFAAISHRIKTGKASIPLKELEQFNSDIQKLLEPLEAEI : HUMAPOE
HUMAPOE         : GQRWELALGRFWDYLRWVQTLSEQVQEELLSSQVTQELRALMDETMKELKAYKSELEEQLTPVAEETRARLSKELQTAQARLGADMEDVCGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHLRKLRKRLLRDPDDLQKRLAVYQAGA : HUMAPOA4A
HUMAPOA4A       : EVSADQVATVMWDYFSQLSNNAKEAVEHLQKSELTQQLNALFQDKLGEVNTYAGDLQKKLVPFATELHERLAKDSEKLKEEIGKELEELRARLLPHANEVSQKIGDNLRELQQRLEPYADQLRTQVNTQAEQLRRQLTPYAQRM : APA1_HUMAN
APA1_HUMAN      : ...........................................................LGPVTQEFWDNLEKETEGLRQEMSKDLEEVKAKVQPYLDDFQKKWQEEMELYRQKVEPLRAELQEGARQKLHELQEKLSPLGEEM : RSU79576
RSU79576        : .SQWDRVKDFATVYVDAVKDSGRDYVSQFESSTLGKQLNLNLLDNWDTLGSTVGRLQEQLGPVTQDFWANLEKETDWPRNEMNKDLENVKQKMQPHLDEFQEKWNEEVEAYRQKLEPLATELHKNAK....EMQRHLKVVAEEF : MMU79574
MMU79574        : ......VKDFANVYVDAVKDSGRDYVSQFESSSLGQQLNLNLLENWDTLGSTVSQLQERLGPLTRDFWDNLEKETDWVRQEMNKDLEEVKQKVQPYLDEFQKKWKEDVELYRQKVGPL.AELQESARQKLQELQGRLSPVAEEF : HSU30872
HSU30872        : TTALDQLSEKMKEKTQELESHQSECLHCIQVAEAEKEKTELLQTLSSDVELLKDKTHQSLEKDSQALSCELENQIAQLNKELVKESESLQARLSESDYNVSKALEAEFALRLSSTQEEVHQLRRGIEKLRVRIEADELHIAEKL : DMU35816
DMU35816        : ASNMESQLTEAQQLLEEETRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEARNYERKLAMQEIKKKAEEDADLAKELEEGKKRLNKDIEALERQVKELIARLDKSKKKDATIELEAQRTKVLELEKKQKNFDKILAEEKAISEQIA : CEF20G43
CEF20G43        : RNGLAWMRLREWQWWRLLTKVKPLLEVTNKDELIAEQELKVTAEKLRRSEVFISDYKQQMEKMDEER.LVLKTRLDAESS.ERAEIFEERSRMAARRDELEGILEEKRLEIEEQKAKKADSESRKLTEMVRHLEENLEDEERSR : D78270
D78270          : LAVKSNQVEHLQQETATLRKQMQKVKEQFVQQKVMYRRDATSKDQLINEKATKKRLDSEMKELRQEL.IKLQGEKKTVEVELQKDMSLVHQQMAELEGHLQSVQKEDEMEIHLQSLKFDKEQMIALTEANETLKKQIEELQQEA : S39081
S39081          : SQKESRSLSTELFKMKNAYEESLDHLETLKRENKNQQEIADLTEQIAEGGKAVHELEKVKKHVEQEK.SELQASLEEAEASLEHEEGKILRLQLELNQEIDRKIAEKDEEIDQLKRNHLRIVESMQSTLDAEIRSRNALRLKKK : HSMYH2R
HSMYH2R         : LDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAELEELRAVTERSRKLAEQELIESERVQLLHSQNTSLINQK.KKMDADLSQLQTEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMMEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIA : A47297
A47297          : KKMQTHVQDLEEQLDEEEAAQKLQLEKVTAEAKIKEEDILVLEDQNSKFKEKKLLEEESTSQLAEEEEAKNLAKLKNKQEMMISDLEERLKKEEKTRQELEKAKRKDFQDQIAELQAQIEELKLQLAKKEEELQAALARGDEEV : SCMMYH
SCMMYH          : IR..KYLVLRNWPWWRLYTKVKPMLNIARQEEEMKAEELAKLKEEYEKLEKLKKELEEQNVTVLQQK.NDLFLQLQTEQD.SLADAEEKISKLVLQRGDMEQRIKEERLADEEDQAANLTEVKKKMSAEIEELKKDVEDLESSL : HROMHCEMB
HROMHCEMB       : LR..AFFGVRDWEWMKLMFKIKPLLQTAEAAKEMEEAENEELKTNYEKEMKRRKELEESQVSLIQEK.NDLLMQLQSEQD.RIEDAEDRCDQLIRTKVELDGKIKEERLEDEEELNNELVSKKRKLEDECSELKKDIDDLEITL : SMOAAI
SMOAAI          : PSQLEHVKVAMMEYMAQVKETGQRSIDLLDDTEF.KEYKVQLSQSLDNLQQYAQTTSQSLAPYSEAFGAQLTDAAAAVRAEVMKDVEDVRTQLEPKRAELKEVLDKHIDEYRKKLEPLIKEIVEQRRTELEAFRVKMEPVVEEM : APA1_SALSA
APA1_SALSA      : .............YIAQVKLTAQRSIDLLDDTEY.KEYKMQLSQSLDNLQQFADSTSKSWPPTPRSS.APSCDATATVRAEVMKDVEDVRTQLEPKRAELTEVLNKHIDEYRKKLEPLIKQHIELRRTEMDAFRAKIDPVVEEM : MYSP_SCHJA
MYSP_SCHJA      : IESLSLENGELIRRAKSAESLASELQRRVDELTIELTSQNNQLESENMRKSLVNDLTDKNNALERENRDQVKELKSSLRDARLTDLEALRSQLEAERDNLASALHD.AEEALRDMDQKYQASQAALNHLKSEMEQRLDEELESL : D50476
D50476          : MN...KKREAEFQKMRRDLEESTLQHEATAAALRKADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEYKMEI.DDLTSNMEAVAK.AKANLEKMCRTLEDQLSEIKTKSDERQLNDMNAQRARLQTENGEFSRQLE..EKE.ALVSQLT : APE_CAVPO
APE_CAVPO       : GQPWELALSRFWDYLRWVQTLSDQVQEELLSNQVTQELTLLIEDTMKEVKAYKAELEKELGPVAEDTKARLAKELQAAQARLGADMEEVRNRLSQYRSEVQAMLGQSSEELRARLTSHPRKMKRRLQRDIDELQKRMAVYKAGA : C60940
C60940          : GQPWEAALARFWDYLRWVQTLSDQVQEGVLNTQVTQELTALMDETMKEVKAYKAELDEQLGPMTSETQARVAKELQAAQARLRADMEDVRNRLTQYRGELQAMLGQSSEELRARFASHMRKLRKRVLRDAEDLQRRLAVYKAGV : APE_RABIT
APE_RABIT       : GQPWELALGRFWDYLRWVQSLSDQVQEELLSSQVTQELTMLMEETMKEVKAYKSELEEQLSPMAQEHRARLSKELQVAGA.LEADMEDVCNRLAQYRGEAQAMLGQSTEELARAFSSHLRKLRKRLLRDAEDLQKRMAVYGAGA : APE_BOVIN
APE_BOVIN       : SQPWEQALGRFWDYLRWVQTLSDQVQEELLNTQVIQELTALMEETMKEVKAYKEELEGQLGPMAQETQARVSKELQAAQARLGSDMEDLRNRLAQYRSEVQAMLGQSTEELRARMASHLRKLPKRLLRDADDLKKRLAVYQAGA : APE_PIG
APE_PIG         : SQPWEQALGRFWDYLRWVQSLSDQVQEELLSTKVTQELTELIEESMKEVKAYREELEAQLGPVTQETQARLSKELQAAQARVGADMEDVRNRLVLYRSEVHNMLGQTTEELRSRLASHLRNVRKRLVRDTEDLQKRLAVYQAGL : TRHY_SHEEP
TRHY_SHEEP      : RDRKFREEEQQLRLLEREQQLRQERNRKFREEQLLREEQLRLQEGEPQLQKRDRKFHEQLLQEREEQ.LRRQERDRKFREELKEREEQLRRQERDRKFEEEQLLQEREELRRQEREPQLRQERDRKFREEEQLLQEREKLRRQE : MYS2_DICDI
MYS2_DICDI      : LKAEKETLKAMYDSKDALEAQKRELEIRVEDMESEKKLALENLQNQKRSEEKVRDLEEQKLRNTLEKLKKYEEELEEMKR.VNDGQSDTISRLEKIKDELQKEVEEESFSEESKDKGVLEKTRVRLQSELDDLTVRLDSETKDK : MYSB_MESAU
MYSB_MESAU      : ......EKHATENKVKNLTEEEMAGLDQIIAKLTKKALQEAHQQALDALEARKTKVNKSKVKLEQQV.DDLEGSLEQEKK.VRMDLERAKRKLEG...YLKVTQESDLENDKQQLDEKLKKKDFELNALNARIENEQALGSQLQ : A61513
A61513          : KAKLESTLDEMEENLAREQKIRGDVEKSKAKLEVLEDEQGLVAQFNEKLKELQSRIQELEERLEAER..AARSKAEKSRQQLGSELEEVVDRLEEQDGATAAQSDLTKKREAELMLKKRDKERRRLEMEKEELQAALEEAESAL : CEF11C1

                : 23--------33--------43--------53--------63--------73--------83--------93--------103-------113-------123-------133-------143-------153-------163- :
OrigSeq         : GQRWELALGRFWDYLRWVQTLSEQVQEELLSSQVTQELRALMDETMKELKAYKSELEEQLTPVAEETRARLSKELQAAQARLGADMEDVCGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVYQAGA :OrigSeq
cons            : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :cons
dsc             : ---HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHH--HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul             : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :mul
nnssp           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd             : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred            : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred           : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred

access : EEEEEEBEEEB-E-BEBBEEBEEEBEEEBEEEEBEEEBEEEBEEEBEEBEE-EEEBEEEBEEBEEEBEEEBEEEBEEBEEEBEEEBEEBEEEBEE-EEEBEEEBEEEBEEBEEEBEEEBEEBEEEBEEEBEEBEEEBEEBEEEE : access PHD Rel : 993577889999999999998799999999999999999999999999999999999997488999999999999999999999999999999998999999997789999999999999999999999999999999987249 : PHD Rel Pred Rel : 007777797668778888987979999999999999999999999999999999999999987999999999999999999998899999999999999999999999999999999999999999989999999997777000 : Predator Rel

dssp : --HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :dssp define : -HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE :define stride : --HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :stride
Q3 values for 1lpe-1-DOMAK View SS in Rasmol dssp define stride phd 84.03 89.58 88.19 dsc 88.89 85.42 91.67 pred 84.72 89.58 88.89 mul 84.03 88.19 88.19 nnssp 81.94 90.28 86.11 zpred 81.94 88.89 86.11 cons 84.03 89.58 88.19