Results for 1mmoh-1-AS


1mmoh-1-AS    : LGIHSNDTRDAWVNKIAHVNTLEKAAEMLKQFRMDHTTPFRNSYELDNDYLWIEAKLEEKVAVLKARAFNEVDFRHKTAFGEDAKSVLDGTVAKMNAAKDKWEAEKIHIGFRQAYKPPIMPVNYFLDGERQLGTRLMELRNLNYYDTPLEELRKQRGVRVVH : MSU815943
MSU815943     : EPIHENSTRTEWEGKIAKLNSVEQATKFIQDFRVAYSSPFRKSYDLDVDYQYIERKIEERLSVLKTEKLSVADLITKATTGEDPAAVEATWVAKMKSAASKYEAERIHIEFRQLYKPPVLPVNVFLRTDAALGTILMGVRNTDYYATPLEGLRKERGVKVLH : MEMG_METCA
MEMG_METCA    : LGIHSNDTRDAWVNKIAHVNTLEKAAEMLKQFRMHHTTPFRNSYELDNDYLWIEAKLEEKVAVLKARAFNEVDFRHNTAFGEDAKSVLDGTVAKMNAAKDKWEAEKIHIGFRQAYKPPIMPVNYFLDGERQLGTRLMELRNLNYYDTPLEELRKQRGVRVVH : BCCSPBGEN

              : 4---------14--------24--------34--------44--------54--------64--------74--------84--------94--------104-------114-------124-------134-------144-------154-------16 :
OrigSeq       : LGIHSNDTRDAWVNKIAHVNTLEKAAEMLKQFRMDHTTPFRNSYELDNDYLWIEAKLEEKVAVLKARAFNEVDFRHKTAFGEDAKSVLDGTVAKMNAAKDKWEAEKIHIGFRQAYKPPIMPVNYFLDGERQLGTRLMELRNLNYYDTPLEELRKQRGVRVVH :OrigSeq
cons          : --------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH--EEE- :cons
dsc           : --------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul           : ----------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH--------------H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE---HHH---EEEEE---------HHHHH----EEEEE :mul
nnssp         : --------HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EE---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH--EEEE :nnssp
phd           : ---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E-EE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHH----EEE- :phd
pred          : ------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHH---------HHHHHHHHHH---- :pred
zpred         : EE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEEEHHHHHHHHEEEEEE------EHHHHHHHHHHEEEEE :zpred


access        : EEBEEEEEEE-BBBEBBEBEBBEEBBEBBEEB-BEBB-EB-EB-EBEEE-BBBEBEBEEEBBBBEBEBBBEBEBEBE-BBEEEBEEBBEBBBBEBEBBEEEEEBEEBBBBB-EB-EEEBBBBBBBBEBEEEBBBBBBEB-BBE--B-BBEEBEEEEBBEBBE : access

PHD Rel       : 998999751588975445679999999999998953567534321245479999999999999988310202121233577656889967999998988799999999876553279965221012302577787433342246899799997229945639 : PHD Rel
Pred Rel      : 009900056077777650666999090009986760099999056607600999990999909999886689685866689978885668670578599909999980087505000007758665777668880978569888799908999997760000 : Predator Rel


dssp          : -E--E-HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHE-----EHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH--EE-- :dssp
define        : -----HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----- :define
stride        : ------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHH-E-----EHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH--EE-- :stride


Q3 values for 1mmoh-1-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	76.54	78.40	80.25
dsc	81.48	90.12	85.19
pred	79.63	83.33	79.63
mul	69.14	69.75	70.37
nnssp	80.25	79.01	81.48
zpred	70.37	74.69	70.37
cons	81.48	83.33	85.19