Results for 1mrrb-1-DOMAK


1mrrb-1-DOMAK    : AYTTFSATKNDQLKEPMFFGQPVQVARYDQQKYDIFEKLIEKQLSFFWRPEEVDVSRDRIDYQALPEHEKHIFISNLKYQTLLDSIQGRSPNVALLPLISIPELETWVETWAFSETIHSRSYTHIIRNIVNDPSVVFDDIVTNEQIQKRAEGISSYYDELIEMTSYWHLLGEGTHTVNGKTVTVSLRELKKKLYLCLMSVNALEAIRFYVSFACSFAFAERELMEGNAKIIRLIARDEALHLTGTQHMLNLLRSGADDPEMAEIAEECKQECYDLFVQAAQQEKDWADYLFRDGSMIGLNKDILCQYVEYITNIRMQAVGLDLPFNTRSNPIPWINTWLV : RIR2_BPT4
RIR2_BPT4        : MSTVFNTNPVDVLNEPMFFGSGLGLARYDIQRHRVFEELIERQISFFWRPEEVNLMMDAAQFNKLPQYQQNIFTNNLKYQSLLDSIQGRAPSAVLMSLISDPSLDTWVATWTFSETIHSRSYTHIMRNLYTDPSKVFDEIVLDEAIMKRAESIGRYYDDVLVKTREWENAKDMVEYYKDDVEQRAKRDLMKSLYLCLHVINALEAIRFYVSFACTFNFHKNEIMEGNAKIMKFIARDEQLHLKGTQYIIRQLQSGTDGDEWVKIAQECEQEAVDIFMEVNRQEKDWAVHLFKDGDVPGLNTNSMWSFIDYLTVSRMKQCGLPCPITDAKHPYPWIREYLN : CELF19G125
CELF19G125       : QYPLISSQRLDAPANTLFTSKMPRRIFIGLVDSDAYNGSYDKSPFNFKPHGISDIHVDYCGMTALDFDRNKFMEAYIQLQETLNSISTQMFDTSLFELVRQTNVNPIVDTIIAVENIHSEMYAKLLEAYIRDDAELFNAITTFKFIKAKADWCLRWISDHNAP.............................FSERLAAFAAVEGIFFSSSFAAIFWLKKRGLLPGLTHSNELIS.MFLLHPNCFFSTFNLQRRRKP..........AESRITEIINESVLVEQDFVRESLP.TNLIGMNQHMMCKYVEFVADLLLEELGYSKRYNTK.NPFDFMENISI : RIR4_YEAST
RIR4_YEAST       : AHNQFLKTEAEK.DEILLMENSRRFVMFPIKYHEIWAAYKKVEAS.FWTAEEIELAKDTEDFQKLTDDQKTYIGNLLALSISSDNLVNKYLIENFSAQLQNPEGKSFYGFQIMMENIYSEVYSMMVDAFFKDPKNLFKEIANLPEVKHKAAFIERWISNDDS.............................LYAERLVAFAAKEGIFQAGNYASMFWLTDKKIMPGLAMANRNICRDRGAYTDFSCLLFAHLRTKPN...........PKIIEKIITEAVEIEKEYYSNSLP.VEKFGMDLKSIHTYIEFVADGLLQGFGNEKYYNAV.NPFEFMEDVAT : RIR2_PLAF4
RIR2_PLAF4       : RIPIFSKQKGKEINEKILNKESDRFTLYPILYPDVWDFYKKAEAS.FWTAEEIDLSSDLKDFEKLNENEKHFIKHVLAFFAASDGIVLENLASKFLREVQITEAKKFYSFQIAVENIHSETYSLLIDNYIKDEKELFHAIENIPAVKNKALWAAKWINDTN..............................SFAERIVANACVEGILFSGSFCAIFWFKKQNKLHGLTFSNELISRDEGLHTDFNCLIYSLLDNKLP...........EQIIQNIVKEAVEVERSFICESLP.CDLIGMNSRLMSQYIEFVADRLLECLGCSKIFHSK.NPFNWMDLISL : RIR2_SCHPO
RIR2_SCHPO       : NVSEEEKQKEDELDEVVLRPNPHRFVLFPIKYHEIWQFYKKAEAS.FWTAEEIDLSKDLVDWDKLNADERYFISTVLAYFAASDGIVNENLLERFSSEVQIPEARCVYGFQIMIENIHSETYSLLLDTYIREPKEHFDAILTMGSIKAKAKWALRWINDEDS.............................TYAIRLVAFAAVEGIFFSGSFASIFWLKKRGLMPGLTFSNELICRDEGLHTDFACLMFSHLKHRPG...........RKLLKPIIVEAVDIEKEYFTDALP.VSLLGMNKDLMCQYIEFVADRLLVALGNDKYYNVT.NPFDFMENISL : UCU30494
UCU30494         : DDSLVSKSKQLNEEEPLLRDNPRRFVVFPIQYNDIWQMYKKAEAS.FWTAEEVDLSKDISDWEKLKSEEKHFVSHVLAFFAASDGIVNENLVERFSKEVQVTEARCFYGYQIAVENIHSEMYSLLIDTYVKDPTELFNAIETMPCVKEKADWALRWINDEQS.............................SFGERVVAFAAVEGIFFSGSFASIFWLKKRGVMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLMFSHLKNKPS...........QERVYDIIRDAVRIEQSFLTEALP.VNLIGMNCKLMAQYIEFVADRLLLELGCPKIWNVE.NPFDFMDNISL : S76940
S76940           : VTPIFNPTNDSVENRTIWFGNTTNLMQLDVRYNWAVGLYQQMREN.FWIPQRLDITQDVTDYWNLTNEERYAFDGILSYLTFLDSVQTCNI.PHLKSSVTAPEISLCMAEQISQEGMHNQSYQYMIETIIPTEKRVYEFWRTDRVLKERCEYIAMLYQKYVDHP........................TQENYFIALMADYLLEGLYFYNGFIYFYNLASRMLMPGSADIFKMINRDELSHVRLYQKLIPEAMQVFT.........HSTDQIYEMFDKAVEFECRWTNHIVG.NNILGITESSTEQYTKYLANSRLRAIGLDPLYTDAKSPYTHLERFSD : RIR2_BACSU
RIR2_BACSU       : ........MTKIYDAANWSKHEDDFTQM.........FYNQNVKQ.FWLPEEIALNGDLLTWKYLGKNEQDTYMKVLAGLTLLDTEQGNTGMPIVAEHVDGHQRKAVLNFMAMMENVHAKSYSNIFMTLAPTETIVFEWVKQNKYLQKKAQMIVGLYKAIQKDD.........................EISLFKAMVASVYLESFLFYSGFYYPLYFYGQGKLMQSGEIINLILRDEAIHGVYVGLLAQEIYNKQTEEK....KAELREFAIDLLNQLYENELEYTEDLYD...QVGLSHDVK.KFIRYNANKALMNLGFDPYFEEEINPIVLNGLNTK : B44282

                 : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91--------101-------111-------121-------131-------141-------151-------161-------171-------181-------191-------201-------211-------221-------231-------241-------251-------261-------271-------281-------291-------301-------311-------321-------331------- :
OrigSeq          : AYTTFSATKNDQLKEPMFFGQPVQVARYDQQKYDIFEKLIEKQLSFFWRPEEVDVSRDRIDYQALPEHEKHIFISNLKYQTLLDSIQGRSPNVALLPLISIPELETWVETWAFSETIHSRSYTHIIRNIVNDPSVVFDDIVTNEQIQKRAEGISSYYDELIEMTSYWHLLGEGTHTVNGKTVTVSLRELKKKLYLCLMSVNALEAIRFYVSFACSFAFAERELMEGNAKIIRLIARDEALHLTGTQHMLNLLRSGADDPEMAEIAEECKQECYDLFVQAAQQEKDWADYLFRDGSMIGLNKDILCQYVEYITNIRMQAVGLDLPFNTRSNPIPWINTWLV :OrigSeq
cons             : -----------------H------EEE-----HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHH-EE------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHH--- :cons
dsc              : -----------------HH---HHHHHH---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HH-------------------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHH--- :dsc
mul              : ---------------HHH------EEEE------HHHHHHHHHH---H---HHHHH-----HH-------HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH-------HEHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHE-----HHHHH------------HHHHH-H--H-H--HHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HH--EHHHHHHHHHHH-------------HHHHHH-- :mul
nnssp            : ------------------------EEEEE---HHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE-----EEEEE---------HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHH- :nnssp
phd              : -----------HHHHHHH------EEE-----HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHH-EE------HHHHEEEEHHHH-HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH--------HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------- :phd
pred             : -----------------------EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------- :pred
zpred            : ------------HHHHHHH-----EEEE--------HHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE---------HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------------------------HHHHHHHHHHHHHHEEE---HHHHHHH-----HHHHHHHHEHHHHHHHH--HHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEHHH--HHEEEEEHHHHHHHHEEE---EEE------EHHHHH-- :zpred


access           : E-EEBBEEEEEE-EEBBB-EEBEEBBBBBBE-BEBBEBBEEBEBBBB-BBEEBEBBEEBBEBEEBEEEEEEBBBBBBBBBBBBEEBBBEBBBEBBBEEBEBEEBEBBBBBBBBBEBBBBEBBBBBBEBBBEEEEEBBEBBBBBEEBEEEBEBBBEBBEE--EEE--BEBBEEBBEBBEEEBBBBBEEEBEEBBBBBBBBBBBBEBBBBBBBBBBBBBB-EEEBBEEBB-BBEBBBEEEBBEBEBBBBBBBBBEEEEEEEEBBEBBEEBEEBBBEBBBEBBEBEEEBBEEBBEEBEBBBBBBEBBBEBBEBBBEBBBEBBBBEEBBEEEE-BBEBBEEBEE : access

PHD Rel          : 9974357764111011112587633431334136899999976531343211123112144442131213878889998653312122321133421211434331211443325413368899999853682678888642289999999999999425778751112211131437874321437999999999999999998753111311112454211466411354421335542025788998761259992368888999999999999999999876653267974235762578999999999999991875443488899444333479 : PHD Rel
Pred Rel         : 0066679999888876669999767867808888789999998855878975556767886056797787877888888788888867999866666768777858878770865666600887975556999886655558589999908880588887888778877509976878965000779597899777789999888875666555577888885877766777878777688886887777887879986678999786888878999888889788887679999766875778888877788887876899987789999987898000 : Predator Rel


dssp             : -----------------E---------------HHHHHHHHHHHH----HHH-----HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEE--EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----E--E-HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHH--- :dssp
define           : EEEEEEE--------------EEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEE--EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHH--- :define
stride           : -----------------E---------------HHHHHHHHHHHHH---HHH---HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEE--EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E--E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHH--- :stride


Q3 values for 1mrrb-1-DOMAK  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	76.47	71.47	77.06
dsc	76.47	72.94	77.06
pred	76.47	74.71	76.47
mul	63.82	55.29	63.24
nnssp	79.12	71.76	79.12
zpred	62.94	56.47	62.65
cons	83.53	79.12	85.29