Results for 1mrt


1mrt         : KSCCSCCPVGCAKCSQGCICKEASDKCSCCA : KRUC_HUMAN
KRUC_HUMAN   : ...CCCCSSGCSSCC.QCSCCKPC.QCSCCK : MT2_MESAU
MT2_MESAU    : KSCCSCCPVGCAKCSQGCVCKEASEKCSCC. : MT2E_RABIT
MT2E_RABIT   : KSCCSCCPAGCTKCAQGCICKGALDKCSCC. : MT1_HOMAM
MT1_HOMAM    : TGCTSCRCAPCEKCTSGCKCPSKEKPCXCC. : HUMGRANUL
HUMGRANUL    : SS.CSRCPDGSTCCEGKYGCCPM..NATCCS : MT_PLEPL
MT_PLEPL     : KSCCPCCPSGCPKCASGCVCKGKTCDTSCC. : MT3_BOVIN
MT3_BOVIN    : KSCCSCCPAECEKCAKDCVCKGGEKKCSCC. : LEMEPT512
LEMEPT512    : ...CGGS....CGCG.GCKCGNG...CGGCG : S65712
S65712       : KSCCSCCPVGCSKCAQGCVCKG..AKCTCC. : A38739
A38739       : KDCCACKTCADCTCGSGCSCTEG..NCP... : CSMETALLO
CSMETALLO    : KSCCSCCPSGCSKCASGCVCKGNSCDKSCC. : MT1_SCYSE
MT1_SCYSE    : EGCTSCRCSPCEKCSSGCKCANKEKACSCC. : HGU20787
HGU20787     : EA.CSACNIITCTCS.GVRCR...VYCSHGF : MT_CHICK
MT_CHICK     : KSCCSCCPAGCNNCAKGCVCKEPASKCSCC. : DOGVWG
DOGVWG       : DE.C.ACNCVNVSCPNDCGCTTT..TCFPDK : A55677
A55677       : R..CGTNPQQCCHCDGQCPCLPN.LAVDRCA : KR3A_SHEEP
KR3A_SHEEP   : PT.CVCRPCCWTTCCVQCPCCRP.TSCPS.. : TGTHI13
TGTHI13      : N..CNVCRLPGPVCAATCDCKIISGKCPPGY : PAC6_RAT
PAC6_RAT     : DHGCKRCDNSCLTCNKNCSCPSG.LDLGMC. : MT4_HUMAN
MT4_HUMAN    : KSCCPCCPPGCAKCARGCICKGGSDKCSCC. : MT1_DROME
MT1_DROME    : K..CASQATKGCNCGSDCKCGGDKSACGCSE : MTA_COLVI
MTA_COLVI    : KSCCSCCPAGCNNCAKGCVCKEPAS...... : CELC27A24
CELC27A24    : T..CTCCCTRCCTCC.PCCCGCG.CGCGCCG : S28399
S28399       : YE.CTPCNCNQFGCNGKCQCLPGIDRCDA.. : MT23_MYTED
MT23_MYTED   : SG.CDACKCASCGCSVVCRCSGTA..CDCT. : DRODFUR2X
DRODFUR2X    : P..CYKSDFGCQKCHHYCTCNDAPLACTSCP : EGF_MOUSE
EGF_MOUSE    : KQ.CVSCPGNVSKCSHGCLTSDG.PRCICPA : I52825
I52825       : P..CASCPPLPLGCLDACGCCP...MCARGE : MUSLAMB2A
MUSLAMB2A    : ..CCSPVGSLSTQCDSYGRCS..CDKCDRCQ : CET01D31
CET01D31     : SS.CMGCDNRHKNCATGCFCKNGVWHTSKCI : CHHB_BOMMO
CHHB_BOMMO   : TG.CGCCCRGCCGCGCGCGCCENRTGLSICS : MTA_TRIRP
MTA_TRIRP    : ...CGGN....CGCG.ACKCGNG...CGGCK : D89931
D89931       : ...CGGN....CGCG.GCQCGSG...CGGCK : OSU77294
OSU77294     : ...CGGN....CGCG.GCQCGGG...CGGCK : CER1026
CER1026      : GG.CSSCGGCNCSCLPSPVCMPPPPPCPMP. : MT1_MIMGU
MT1_MIMGU    : ...CGSG....CKCGDNCSCSMYDMIEGVAP : CGMT1
CGMT1        : ...CGSG....CSCGSGCNCKNPLEKTTSKT : IBB2_ARAHY
IBB2_ARAHY   : PP.CDHCPAACCVCTPQCRCTDR..TQGRCP : I48100
I48100       : GA.CGTGPCCTVDCQANVLCRKSDEYCNGRS : S47645
S47645       : FA.CGSGPCCNKTCTRGHVCRKSDEYCNGTS : S24596
S24596       : K...SCCPVGCVQCAQGCICKGASNKCSCC. : MT_XENLA
MT_XENLA     : KSCCSCCPAECSKCSQGCHCEKGSKKCSCC. : I46489
I46489       : ..SCRPTCCRPTCCRRPTSCQTTCPSC.... : A45910
A45910       : ..SCQP.CCQTTCCRFQPCCVSSCPCCCVSS : CEE01G62
CEE01G62     : RP.CNKCPQG.YSCMHLC.CSSG.SGMGVSQ : S34583
S34583       : EG..KGENFNCKKCHESCECKGPSKNCTGCS : S49228
S49228       : QM.CCCCRVCCLCCG.LCGCSKC.CRCTKCS : CRS5_YEAST
CRS5_YEAST   : GS.CKSCGEK.CKCE.TCTCEKS..KCNCEK : MYCMBPRP
MYCMBPRP     : TE.CKCQECEECSCSLTCGCQEA..TCSCAQ : S41203
S41203       : KMDCSCSPVGSCACAGSCKCKE..CKCTSCK : DPU67347
DPU67347     : DC.CSCSDCSNCKCGDSCKCSKPCVTCKCG. : A48434
A48434       : DS.CPACPTNCASCANTKTCNKCSDTAKACK : GIACRP136
GIACRP136    : NGGCAECHSTCATCSAADKCKT.CGDD.... : A45664
A45664       : NGACPLCDSTCAECSDADACTK.CNKCI... : TS11_GIALA
TS11_GIALA   : KG.CDTCSDATTKCGNSQTCTKCS.SCETCT : SGS3_DROME
SGS3_DROME   : VA.CCGCPTTTTTCATTQPCTTTTTTTTTCA : CELF35A52
CELF35A52    : QA.CDCAPVVQCACQPSCDCAQQ.AQPTFQV : CELC14C117
CELC14C117   : S..CSACQPSCQQCIAQNLCQSAQSSCGSNT : I50132
I50132       : RK.CLDCSRKSSQCILDCSRKSS..QCMSKE : CELZK783
CELZK783     : VS.CTPCDSSTQLCIGECICKSGRETCADID : SELP_HUMAN
SELP_HUMAN   : CH.CKTGSAITCQCKSLCSCQG...LRAEEN : CELB0244
CELB0244     : ..ECDKCPSGTIKCAAFTRCN..GSDELK.. : CELR01H21
CELR01H21    : ..ECNKCQKGAHKCGASKVCD..GSDEHQC. : CEF56H11
CEF56H11     : RR.CNECTTG.AACEYQCICDRGAPDGTKC. : GGU88872
GGU88872     : DI.CHNCDRH.AVCTFKCSCSSGI.NGIKC. : MT1_TETPI
MT1_TETPI    : KE.CTGEGCKCCKCCSGCCCGDK..AKACCT : CHHC_BOMMO
CHHC_BOMMO   : ..GCGGCGGCGCGCGGGCGCCGG...CGGCG : A55035
A55035       : P..CVGCPCGSCTCE.KGSCKKG.CSKGCCT : I46412
I46412       : KP.CCCVPACSSSCGGCGSCGGS.GGCSSCG : MT1_CANGA
MT1_CANGA    : CGDCSCHGCGECKCGHGSSCHGSGDKCEC.. : D908709
D908709      : ..WCAGCGAECTGCGGETGCCNG...CSGC. : MMALPHTEC
MMALPHTEC    : EE.CETCETLAPICVEGCQCDEGRLQGSQC. : LEMT2MR
LEMT2MR      : EG..SIEKATECKCGSSCKCDP....CNCCS : CEB002412
CEB002412    : PPSESCCPIRQCKCRSICQCPDG.KVVNVTK : 41BB_MOUSE
41BB_MOUSE   : KVVCDNCQPG.TFCRPVCSCPPS.TFSSIGG : MMU37501
MMU37501     : R..C.QCPRG..HCDGHCTCPPGSERCDTCS : RATORFD
RATORFD      : PGHCQRCPCQNGVCHGECSCPSGMTVCGQPC : JH0675
JH0675       : ED.CLRCPAGCGLCVGECICEEGGEDCSQPR : AGRI_CHICK
AGRI_CHICK   : RV.CDRCGKCQAICEGRCVCPTEVSSQPVCG : BAR3_CHITE
BAR3_CHITE   : ND.CCGCPVPRPDCTNTCACGCGDPSCPKQQ : CPU54640
CPU54640     : ...C.GCPVDMDGCPDSCSCECP..LKQDC. : UNC6_CAEEL
UNC6_CAEEL   : ..CCHPVGSLGKSCNSSGQCV..CTTCNRCA : HSLAMB2S
HSLAMB2S     : HG.CACLPSPEPTCNGQCHCLCGGRTCSE.. : LMA1_MOUSE
LMA1_MOUSE   : ..CCDLRGTLPDTCDDSGTCS..CPQCSKCQ : CET22A37
CET22A37     : ..CCNAAGTDPLQCKEIGECP..CTKCD... : JC2395
JC2395       : VG.CQPCQPGEKDCTPTCPCTEG..EEYTDR : CRU73817
CRU73817     : RR.CRCCRGSRPRCNWVCCCLPG.CCCWGCW : CTU54641
CTU54641     : DS.CDAPPCANERCDCECACINR.EPKGGCD : GRN_CAVPO
GRN_CAVPO    : ...CACCPDSG.GASYSC.CDPG.VDLRTTA : IBB_VICFA
IBB_VICFA    : DT.CLCTKSEPCRCVVGERCHS...ACNSCV : IBB2_SOYBN
IBB2_SOYBN   : S..CDRCACTRCRCLTTDFCYKP...CKSSD : D11_DICDI
D11_DICDI    : GR.CEPCTD..VACTQVKYCQDG.TGCCPCT : EC_MAIZE
EC_MAIZE     : ...CEHCECSPCTCGANCSCGAS.CNCASCA : S65195

             : 31--------41--------51--------6 :
OrigSeq      : KSCCSCCPVGCAKCSQGCICKEASDKCSCCA :OrigSeq
cons         : ------------------------------- :cons
dsc          : ------------------------------- :dsc
mul          : ------------------------------- :mul
nnssp        : ------------------------------- :nnssp
phd          : ------------------------------- :phd
pred         : ------------------------------- :pred
zpred        : ------------------------------- :zpred

access : EEEBEE-EEE--EBEEEBEBEEEEEE-EEEE : access PHD Rel : 9982256656544467432377787654699 : PHD Rel Pred Rel : 0000000909900000087700000000000 : Predator Rel

dssp : ------------------------------- :dssp define : ------------------------------- :define stride : -----------HHH----------------- :stride
Q3 values for 1mrt View SS in Rasmol dssp define stride phd 100.00 100.00 90.32 dsc 100.00 100.00 90.32 pred 100.00 100.00 90.32 mul 100.00 100.00 90.32 nnssp 100.00 100.00 90.32 zpred 100.00 100.00 90.32 cons 100.00 100.00 90.32