Results for 1nol-1-AUTO.2


1nol-1-AUTO.2    : TLHDKQIRICHLFEQLSSATVHSDRLKNVGKLQPGAIFSCFHPDHLEEARHLYEVFWEAGDFNDFIEIAKEARTFVNEGLFAFAAEVAVLHRDDCKGLYVPPVQEIF : MOTMRSPIII
MOTMRSPIII       : DVKVRELCILKLLNHILQPTIYEINMFKMGMLPRGEIFVHTNTLHLDQAVKVFRVLYFAKDFDYFMKTACWLRERINGGMFVYALTAAVFHRTDCIGITLPAPYEIY : S46948
S46948           : DELLRQKFILDVLHQVYMPLQQQLDMLRSQQMLGKTICRINNEIHLQQMLGLYRLLVTARDFDTFKRLVVHARQNINTEMFVNALVLALGERSDTQMLIVPALYEIL : JSP1_TRINI
JSP1_TRINI       : VFAKRQMDLMTLFFHVLEPNYIEKMLENQCCVPRAVPFSILEDEHKFEVVTLFNVLHSAKDYDTFYKTAVYVRDRVNPDLFSYVLSAVIVNRPDTKGIYIPRVFEIF : HCYE_EURCA
HCYE_EURCA       : PDKQKQLRVISLFEHMTSIN.TPARLHHLGRLPQGELFSCFHEEDLEEATELYKILYTAKDFDEVINLAKQSRTFVNEGLFVYAVSVALLHRDDCKGIVVPAIQEIF : FBP1_DROME
FBP1_DROME       : EDLQLQKFILDIVQNIRQPLQQSIDLDRQRRLLDEQVYSVGRLEHVQQLRGIYRLLARAQDLDTLRRNVVYLRRNINPVLLVNALALAIRDREDTQTLIVPAVQELL : A56097
A56097           : QQLLRQKFILDVLQQVNMPIQNRLDLIRQQQILNKQICTISNDRHVQQMVGLYRLLVGARDFEAFQQLVVYARQHVNTEMFVNALILALAERQDTEMLVVPALHEVL : PLPROP
PLPROP           : EMADAQKQLLYLFERPYDPINAPRLLGRAPSVPRGAVFSFFIRSHREAARDLCDVLMKTQNSTDLMQLAASVRRHVNENLFIYALSFTILRKQELRGVRLPPILEVF : HCYD_EURCA
HCYD_EURCA       : TIADHQARILPLFKKLTSLSPDPPRLKGVGFLPRGTLFGSFHEEHLAEAIVFIEIIHDAKNFDDFLALATNARAVVNEGLYAFAMSVALLSRDDCNGVVIPPIQEVF : HCY6_ANDAU
HCY6_ANDAU       : TVADKQARLMPLFKHLTALTREKERLKGVGILPRGTLFSCFHARHLAEATELYVALYGAKDFNDFIHLCEQARQIVNEGMFVYAVSVAVLHREDCKGITVPPIQEVF : HCYA_EURCA
HCYA_EURCA       : ILHDKQVQALKLFEKLSVAATGEERLRNITTLGPNEFFSCFYPDHLEQAKRVYEVFCHAANFDDFVSLAKQARSFMNSTLFAFSAEVALLHREDCRGVIVPPVQEVF : S55387
S55387           : ADVQQQKDVLYLLNKIYGDIQDGQDLN.DGKLLEQHWFSLFNTRHRNEALMLFDVLIHCKDWASFVGNAAYFRQKMNEGEFVYALYVAVIHSSLAEQVVLPPLYEVT : CMU48881
CMU48881         : FDAQKQHDVNSALWKVYEDIQDPKELN.ENRLLKQHWFSLFNTRQREEALMLYDVLEHSTDWSTFAGNAAFFRVSMNEGEFVYALYAAVIHSELTQHVVLPPLYEVT : HCYC_PANIN
HCYC_PANIN       : LLAQKQHDVNYLVYKLYGDIRDDADFK.DGRLLQKHWFSLFNTRQREEALMMHRVLMNCKNWHAFVSNAAYFRTNMNEGEYLYALYVSLIHSGLGEGVVLPPLYEVT : HCYB_PANIN
HCYB_PANIN       : GNANKQQDINHLLDKIYEPTKYPKELN.DHRLLEQHWFSLFNTRQREEALMLFAVLNQCKEWYCFRSNAAYFRERMNEGEFVYALYVSVIHSKLGDGIVLPPLYEIT : LMU74469
LMU74469         : VFLTRQRDVLRLFVKIQQPAVIPLQLHKEGALLSRDDFSILYAKHLWQAVDLFKILYRIPDYETFHKVAVWLRYNVNVGLFEYVARVVLLHRDDTRELLLPPPYEVL : GALLHP82X
GALLHP82X        : TVLDRQYKLLTLFFHPHEPIHIKQMLHNNYQVPRGVPFTVLESVHRFEISVYYSLLYSAKTYDTFYKTAVFLRQHVNENLFVNVLSVVILHRSDTQDIRIPPIYDVF : LDDP19
LDDP19           : .........LKLLYHVNQPSTYPVQFWRFGLLPRGEVFSVFYEEHLRQAIALFKLFYYAKTYDEFHRVATWARQNVNEGMFVYAFSVAIIHRPDCRRLMLPPIYEIK : JSB2_TRINI
JSB2_TRINI       : DIKQRQLVILKLLNHVVEPLMYKIKMRKVGFLPRGEIFTLHVDRQLKEVVTMFHMLYYAKDFTTFVKTACWMRLYLNEGMFVYALTVAVRHREDCKGIILPPPYEIY : SSP1_BOMMO
SSP1_BOMMO       : DMKMKELCIMKLLDHILQPTMFEMEMYKMGMLPRGETFVHTNELQMEEAVKVFRVLYYAKDFDVFMRTACWMRERINGGMFVYAFTAACFHRTDCKGLYLPAPYEIY : A61619
A61619           : SLLNIQTKVLSLLENWKQVNPDDLSLYKAGFIPKNEVFSIFYENQALEVIALYRLFYYAKDFETFYKTAAFARVWLNEGQFVYAFYLAVIHRADTRGIVLPAPYEIW : ARYA_MANSE
ARYA_MANSE       : IFVEKQKKVFSLFKNVNQLDYEALLLYRTGFMPKGFEFSIFYERMREEAIALFELFYYAKDFETFYKTASFARVHVNEGMFLYAYYIAVIQRMDTNGLVLPAPYEVY : SSP2_BOMMO
SSP2_BOMMO       : VFVEKQKKILSFFQDVSQLNTDDLKMYRTGFMPKNLEFSVFYDKMRDEAIALLDLFYYAKDFETFYKSACFARVHLNQGQFLYAFYIAVIQRPDCHGFVVPAPYEVY : D87272
D87272           : EFLKKQKQVLDLLVGVANNEQFKLEAYHRGFLPRDAILSFSNHKARADVIKLFDVFYFAKDFDTFYKAAVWARNHVHPGMFASAYVLAFYHRADLQNFYIPPFYEIY : BDU31328
BDU31328         : TFLTRQRDFLRLLVRIEQPNYYALSAYKRGMLPRGVPYSPYYTTQSYETKLLFDLFYYANDYDTFYKTVCWARDRINEGQFLYAFSTAVFQREDLSDYILPPPYEIY : PELCP7K
PELCP7K          : .......................ISYYKKGLLPRGEPFSVYYEKHREQAIKLFELFFAANDYDTFYKTACWARDRVNEGMFMYALTVAAFHREDTKDLVLPPPYEVN : PELCP8K
PELCP8K          : QFLAKQRDVLRLFHRVHQHNILNGVLQEGHARPRGEPFSVNYEKHREQAIMLYDLLYFANDYDTFYKTACWARDRVNEGMFMYSFSIAVFHRDDMQGVMLPPPYEVY : DMU63556
DMU63556         : AFLMKQKFLFEIVYRVEDPLMFEFEAYKAHALLPKEFFGALVMSHAKQARGLFNFFYYAKDWETFAANVAWARMHVNEGMFVYALTMAVIHRNDFHGLMLPSIYEIF : AGU51225
AGU51225         : EFLFKQKFFFEVLRNIHLPLKYDFDYYKTGAFLEKELFSIYNEQYLRQTYAVFTFLYNSADWDTYYKNMIWARDNINEGMFIYVLHLTVMHRPDLQGIVLPAIYEIY : AAU86079
AAU86079         : DFLMKQKFFFEILRHIHMPLQYEFNMYKMDLFLGKEIFTINNKYLLKQTYMLFSFLYNSLDWDTYYKNVIWARENINEGMFIYAITLTVMHRTDLQGLVLPAIYEIY : AAU86080
AAU86080         : DFLVKQKQLLEVFQHVHQHEVHTVKFYKYGMLPFDEIFSVFHYTHREQAIALFHLFYYAKDWETFYKSVVWARFHVNEGMFVYAVTVAMLHRKDLAGLELPAPYEIY : CVU89789
CVU89789         : DFLVKQKFMLDILQHVYQDDVFVFELWQHDPIYDDEIFSPVYERHVEYAHYLTRLFYFAKDWNSFTHAVYWARTHVNKQLFIYSLTVASIHRDDLKGIVLPAIYEIQ : HS7C_TRYBB

                 : 1---------11--------21--------39--------49--------59--------69--------79--------89--------99--------109---- :
OrigSeq          : TLHDKQIRICHLFEQLSSATVHSDRLKNVGKLQPGAIFSCFHPDHLEEARHLYEVFWEAGDFNDFIEIAKEARTFVNEGLFAFAAEVAVLHRDDCKGLYVPPVQEIF :OrigSeq
cons             : HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH---------EEEEH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EE-------- :cons
dsc              : HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------- :dsc
mul              : -HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH----------EEEEH---HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-------EE-----EEE :mul
nnssp            : HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH----EEHHHHHHHHHH----EEEE------- :nnssp
phd              : ---HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH----------EE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE------EE------E- :phd
pred             : --------HHHHHHHHHH--HHHHHHHH--------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH--------------- :pred
zpred            : HHHHHHHHHHHHH---------HHHH----------EEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEEEEE :zpred


access           : E-EEEEEEBBEBBEEBBEBBEBEBEB-EBBBBBEE-BBBBBBEEBBEEBBBBBBBBBBBEEBEEBBEBBBBB-E-BEEBBBBBBBBBBBBBEEEBEBBBBEBB-EB- : access

PHD Rel          : 93235668999999962112114665211455676402412516899999999999987558999999999999852224032466532210035532226534319 : PHD Rel
Pred Rel         : 00899900099888855856885888876688998866655787879999999878758777668788888778776670687989777757999876008908000 : Predator Rel


dssp             : -HHHHHHHHHHH-----------HHH----------------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-HHH-------HHHH- :dssp
define           : HHHHHHHHHHHHHH---------------------EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEHHHHHH :define
stride           : -HHHHHHHHHHH---HHH------------------------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-HHH-------HHHH- :stride


Q3 values for 1nol-1-AUTO.2  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	70.09	71.03	71.96
dsc	63.55	63.55	61.68
pred	61.68	62.62	63.55
mul	70.09	70.09	70.09
nnssp	66.36	78.50	71.96
zpred	72.90	81.31	69.16
cons	68.22	76.64	70.09