Results for 1nox-1-GJB


1nox-1-GJB    : PVLDAKTAALKRRSIRRYRKDPVPEGLLREILEAALRAPSAWNLQPWRIVVVRDPATKRALREAAFGQAHVEEAPVVLVLYADLEDALAHLDEVIHPGVQGERREAQKQAIQRAFAAMGQEARKAWASGQSYILLGYLLLLLEAYGLGSVPMLGFDPERVRAILGLPSRAAIPALVALGYPAEEGYPSHRLPLERVVLWR : NFNB_ECOLI
NFNB_ECOLI    : ..MDIISVALKRHSTKAFDASKLTPEQAEQIKTLLQYSPSSTNSQPWHFIVASTEEGKARVAKSAAGERKMLDASHVVVFCAKTAWLKLVVDQEDADGRFATPEKAANDKGRDMHRKDLH.DDAEWMAKQVYLNVGNFLLGVAALGLDAVPIEGFDAAILDAEFGLKEKYTSLVVVPVGEDFNATLPKSRLPQNITLTEV : S75047
S75047        : ..MDTFDAIYQRRSVKHFDPDRLTAEEERKLLEAAIQAPTSFNIQHWRFLIIRDPQLRQTIREKYGNQAQMTDASLLILVAADVNDPARYWRNAPREVANYLVGIASFYGGKQLQRDEAQ..RSIGMAMQ......NLMLAAKAMGYDSCPMIGFDLQKVAELVKLPADYAIGPMVAIGEDARAKG..GQTPLEELVWEN : S52225
S52225        : THRDALTEVLRRRDVRHFRPDPIDEAVIDRLRAVMDMAPSVGNARPWRVIRVDSPALRAEVLANFNA.ARAAAGSAYAGEQAEAYLKLQGIDQAPLQLAVFTHRPAAGHGLGRASMPVTLQQSTAMAFTR......SGCRAGENLGLGMVSVLD..PKAVERLLNAPPDWDFVAWLCIGTDDTPLLHRAGWQENLPTEWE : B64114
B64114        : TREQVLELFHQRSSTRYYDPTKISDEDFECILECGRLSPSSVGSEPWKFLVIQNKTLREKMKPFSWGQ..LDNCSHLVVILAKKNDSPFFVDVMARKGLNAEQQQAALTKYKDMKLLENDRTLFDWCSKQTYIALANMLTGASALGIDSCPIEGFHYDKMNECLAEEGLDPQEYAVSVARSRDIAK.KSRKGLDEVVKWV : FRA1_VIBFI
FRA1_VIBFI    : .THPIIHDLENRYTSKKYDPSKVSQEDLAVLLEALRLSASSINSQPWKFIVIESDAAKQGMHDSFANQPHIKACSHVILFANKLSDYDVVLSKAVADKRITEEQEAAFASFKELNCDENG.EHKAWTKPQAYLALGNALHTLARLNIDSTTMEGIDPELLSEIFADELKYECHVALAIGEDYNASLPKSRKAFEAVITIL : MTCY711
MTCY711       : GTAEALELGRQRRSVRRFSTDPVPGDLVEAAVAEALTAPAPHHTRPTRFVWLQTPAIRARLLDRMKD.KWRSDLTSDGLPADAIERGQILYDAPEVVIPMLVPDAHSYPDAARTDAEHTMFTVAVGAAVQ......ALLVALAVRGLGSCWIGSFAADLVRDELDLPVDWEPLGAIAIGYADEPSG..LRDPVPAADLLI : AB001488128
AB001488128   : VMAEFTHLVNERRSASNFLSGPITKEDLNEMFELVALAPSAFNLQHTKYVTVLDQDVKEKLKQAANGQYKVVSSSAVLLVLGDKQAADIYEGLKVLGILNKQEYHMVQDTVSFYENRGEQ.FKRDEAIRNASLSAMMFMLSAKEKGWDTCPMIGFDAEAVKRILNIDDQFEVVMMITIGESRRPRG..YRKPVNEFVEYM : AB001488145
AB001488145   : KTNDFMEIMKGRRSIRNYDPAKISKEEMTEILEEATTAPSSVNAQPWRFLVIDSPEGKEKLAPLASFQTQVTTSSAVIAVFADMNYLEEIYSKAVELGYMPQEVDRQIAALTHFEKLPAQVNRETILIDGGLVS.MQLMLTARAHGYDTNPIGGYDKENIAETFGLDKEYVPVMLLSIGKAADEGYASYRLPIDTIAEWK : MPLNIRDHOM1
MPLNIRDHOM1   : .....MNLLTSRRAIRTFENNKIPRNVFKKILKDTSYAPSSFNLQPWHFFIIETLENKKKLAICLNNRSQLETSSAMILIFGDIN.KKELKTKIYNDLETSKKE.IIFKKINYYDSMTNEEIKNELFLECGIVS.LQLMLSAKNYGYETCPIGGFNKKKINELFKIEKKYLPILIVAIGKDEETKN..FKMETTDFTHWL : HCYA_EURCA

              : 6---------16--------26--------36--------46--------56--------66--------76--------86--------96--------106-------116-------126-------136-------146-------156-------166-------176-------186-------196------- :
OrigSeq       : PVLDAKTAALKRRSIRRYRKDPVPEGLLREILEAALRAPSAWNLQPWRIVVVRDPATKRALREAAFGQAHVEEAPVVLVLYADLEDALAHLDEVIHPGVQGERREAQKQAIQRAFAAMGQEARKAWASGQSYILLGYLLLLLEAYGLGSVPMLGFDPERVRAILGLPSRAAIPALVALGYPAEEGYPSHRLPLERVVLWR :OrigSeq
cons          : ---HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH----------EEEEE--HHHHHHHHHHHH---HHHH--EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHH-------EEEEEE---------------HHHH--- :cons
dsc           : ---HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----------EEEEE--HHHHHHHHHHHHH--HHH---EEEEEHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHH--------EEEE-----------------HHHH--- :dsc
mul           : --HHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHH----------EEEEEHH---HHHHHHHHH----HH----EEEHHHH---HHHHHHHHHHH---H--H-HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-H------HHHHHHHH-------------HHHHHHHHH----HHHHEEE----------------HHHHHHH :mul
nnssp         : -HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHH-----------EEEEE--HHHHHHHHHHH---HHHHH--EEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHH-------EEEEEE--------------HHHHHHHH :nnssp
phd           : ---HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH----------EEEEE---HHHHHHHHHHH---EHHHHHHHEEEE---HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHH------EEEEEEE---------------------- :phd
pred          : ---HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH---------EEEEEEE---HHHHHHHHH----------EEEEE----HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHH----------EEEE---------------------- :pred
zpred         : --HHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE--HHHHHHHHHHHH------HHHHHHEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH---EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHH----------HHHHHHH :zpred


access        : EEEEBBEBBEEEEBBEEBEEEEBEEEBBEEBBEBBEEBEEBBEBEEBEBBBBEEEEBEEEBEEBBEEEBEBEEBBBBBBBBBEBEEBEBBBEEBBBEB-BBEEEEBBBEEBEEBEEEEEEEE-EBBBBEEBBBBBBBBBBBBEB-B-EBBBBBBBEEEBBEEBBEBEEEBBBBBBBBBBEE-EEE-EEBEEEBEEBBE-E : access

PHD Rel       : 95469999853233303689977738999999998534453577862689853726899999996220013411222246402113455665454531121267888754665433232346799887667899999999999843475633576779999997257764125777622456778997777633211359 : PHD Rel
Pred Rel      : 00677799979755855799998787799999999868099998996890096776699988976778675586669900766667888888885666566888999999998888676777786887668667789999998867987888888787898888589998566668557889998999997776668000 : Predator Rel


dssp          : ----HHHHHHH------E------HHHHHHHHHHH-----HHH---EEEEEE--HHHHHHHHHH-----HHHH--EEEEEEE-HHHHHH-HHH--------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE----HHHHHHHH------EEEEEEEEE-E-----------HHHH---- :dssp
define        : ---HHHHHHHHHEEEE---EEEEHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHH--HHHHHH-EEEEEEEEHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE---HHHHHHHHHH----EEEEEEEEE-------EEEEE-HHHHHEEEE :define
stride        : ----HHHHHHH------E------HHHHHHHHHHHH----HHH---EEEEEE--HHHHHHHHHHH---HHHHH--EEEEEEE-HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEE----HHHHHHHH------EEEEEEEEE-E-----------HHH----- :stride


Q3 values for 1nox-1-GJB  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	77.00	71.00	79.00
dsc	78.50	70.50	79.50
pred	74.50	67.50	76.50
mul	66.50	60.50	67.50
nnssp	78.00	69.00	80.00
zpred	69.00	63.50	70.00
cons	80.00	73.50	81.00