Results for 1onrb-1-AUTO.1


1onrb-1-AUTO.1    : TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL : TAL1_KLULA
TAL1_KLULA        : .SLEALKATGTTVVADTGDFESIAKFTPQDATTNPSLILAAAKQQAYAKLIDSAVQYGKKQGQNIDEQVEIAVDKLLVEFGTAILKVVPGRVSTEVDARLSFDKDATVKKALEIIKLYEAEGISKDRVLIKIASTWEGIQAAQELEKEDIHVNLTLLFSFAQAVAAAEANVTLISPFVGRILDWYKASTG.ETYTAETDPGVISVKSIYNYYKKHGYNTIVMGASFRNVGEIKALAGVDFLTISPKLLDELLSSDEPVAKILDPESAKAEGSEINDEPKFRFELNEDAMATEKLSEGIRKFSADIVTLFDLIKAKI : TAL_SYNY3
TAL_SYNY3         : KNLLEQLRQFTVVVADTGDIQAIETFTPRDSTTNPSLITAAAQMPQYQEIVDSTLLKAKDEAGENADIVRLAFDRLAVAFGLKILQIIPGRVSTEVDARLSYDTEATIAKARYLIGEYAKAGIDKKRILIKIASTWEGIKAAEVLEQEGIHCNLTLLFGLHQAIACAEAKVTLISPFVGRILDWYKKSTG.KEYDSHEDPGVQSVTTIYNYYKRFGYKTEVMGASFRNIGEIIELAGCDLLTISPQLLDQLRNTEGDLPRKLDP.ATVPQDIEVMDKATFDKMHAEDPMASEKLAEGIAGFTKALEVLEHLLEERL : TALB_HAEIN
TALB_HAEIN        : TTQLDSLRNMTVVVADTGDIDAIKKYQPQDATTNPSLILSASALPQYAPLIDEAVAYAKAQSADKAQQLIDAEDKLAVNIGLEILKIVPGRISTEVDARLSYDTQATVEKARKLIALYNAAGISNDRILIKIASTWQGIRAAEILEKEGINCNLTLLFSEAQARACAEAGVYLISPFVGRILDWYKANSDKKEYAPAEDPGVISVTKIYNYYKEYGYNTVVMGASFRNVGEITELAGCDRLTIAPALLKELQENSTALVRKLEYKGEVKAKPQPLTEAEFYWQHNSDAMAVEKLAEGIRKFAIDQEKLETMLSAKL : U67611
U67611            : ESALDQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQELVEEAIAYGKKLGGPQEEQIKNAIDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARRLIELYKEAGVGKDRILIKLSSTWEGIQAGKELEEQGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKSYEPQEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRNTGEIKALAGCDFLTISPKLLGELLKDNSKLAPALSVKAAQTSDSEHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRKFAADAIKLERMLTERM : D89215
D89215            : SSLEQLKATGTVVVSDTGDFESIAKYKPQDATTNPSLILAASKKPQYAALVDAAVDYAKAKGGSINSQIEIAFDRLLIEFGTKILAIVPGRVSTEVDARYSFDTQTTIEKARHLIKLYEAEGIGRERVLIKIASTYEGIQAAKQLEEEGIHCNLTLLFSFVQAVACAEANVTLISPFVGRILDFYKAKNN.RDYTAQEDPGVVSVSNIFNYYKN......................................SVTRPLSWVLLS.........VRSR.......NS..................LVLTF....... : TAL2_YEAST
TAL2_YEAST        : SSLEQLKKAGTHVVADSGDFEAISKYEPQDSTTNPSLILAASKLEKYARFIDAAVEYGRKHGKTDHEKIENAMDKILVEFGTQILKVVPGRVSTEVDARLSFDKKATVKKALHIIKLYKDAGVPKERVLIKIASTWEGIQAARELEVKGIHCNMTLLFSFTQAVACAEANVTLISPFVGRIMDFYKALSG.KDYTAETDPGVLSVKKIYSYYKRHGYATEVMAASFRNLDELKALAGIDNMTLPLNLLEQLYESTDPIENKLNSESAKEEGVEINDEPHFRYVLNEDQMATEKLSDGIRKFSADIEALYKLVEEKM : TALA_ECOLI
TALA_ECOLI        : MNELDGIKQFTTVVADSGDIESIRHYHPQDATTNPSLLLKAAGLSQYEHLIDDAIAWGKKNGKTQEQQVVAACDKLAVNFGAEILKIVPGRVSTEVDARLSFDKEKSIEKARHLVDLYQQQGVEKSRILIKLASTWEGIRAAEELEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRIYDWYQARKPMDPYVVEEDPGVKSVRNIYDYYKQHHYETIVMGASFRRTEQILALTGCDRLTIAPNLLKELQEKVSPVVRKLIPPSQTFPRPAPMSEAEFRWEHNQDAMAVEKLSEGIRLFAVDQRKLEDLLAAKL : ANU31869

                  : 2---------12--------22--------32--------42--------52--------62--------72--------82--------92--------102-------112-------122-------132-------142-------152-------162-------172-------182-------192-------202-------212-------222-------232-------242-------252-------262-------272-------282-------292-------302-------312--- :
OrigSeq           : TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL :OrigSeq
cons              : --HHHHHH--EEEE-----HHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH--EEEE---HHHHHHHHHH----------------EEEHHHHHHHH----EEEEE-HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH---HHHHHH--------------HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :cons
dsc               : --HHHHHH--EEEE-----HHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH---EEE----HHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHH----EEEEEHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH---HHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul               : --HHHHHHHEEEEE------HHH--------------HHHHHH-----HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEE----EEE-HHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--H----HHHHHHE-----HHHHHHHHHHH----E-HHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEE-EEEEHHHHHH--------------EEEEEEEEEE------EEEEEH-------HHHHHH---------HHHHHHHH----HHHHHHH--H-H----H-HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :mul
nnssp             : HHHHHHHHHHEEEEE----HHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHH------HHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEHHHHHHHHHHHHH--EEEE-----HHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHH----EEEE---HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd               : --HHHH----EEEE-----HHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH--EEEEE--HHHHHHHHHHH---------------EEEHHHHHHHH----EEEEE-HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH------E----------------HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred              : ---HHHHH-EEEEEE----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE-----HHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE----EEE--------------------EEEEEHHHHHHHH---EEEEE------HHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---HHHHHH------------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred             : HHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHH-------EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEHHH--------EE--HHHHHEEEEEEEEEE-------EEE-------------------------HHHH-----HHHHHH------------HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH :zpred


access            : EEEEEBEEEBBBBBBEEEEBEBBEEB-EEEEEE-BBBBBBBBEBEEBBEBBEBBBEEBEEEEEEEEEEBEBBBEEBBBEBBBEBBEBBEEEBBBEBEBEBE-EEEBBBEEBEEBBEBBEEEEBEEE-BBBEBBBEBEBBEBBEEBEEEBBEBBBBBBBBBBEBBBBBEBBB-BBBEBBB-BBEBBEBEEEEEE-BEEEEEEBBBBBEBBEBBEE-B-EBBBBBBBBEBBEEBBBBBBBEBBBBBBEBBEEB-EEEEEBBEEBEEEEEEEEEBEBBEEBEB-B-BBEE-BBBEEBBEBBEEBBBEBEBBEEBBEEEE : access

PHD Rel           : 9376642574488726861555763186449999278888854578999999999999972886489999999999998247666442781311321123245379999999999999883855221211111446999999999971782213578999999999970626774221368588765147766467889995145138889965285248760112346999996276743447699999966175211115777678657564433555675311279999999989877667999999999449 : PHD Rel
Pred Rel          : 0077776856090960096586775889999999870767886698898999899988767797677799975567777868707078998666598855677678899999990099886999768059777680880999999906897666680889999009986600908988556677576779998756899000885078789708799688877776666007778699867777778889998695855656685888888855558788778698688887888668887888999997766000 : Predator Rel


dssp              : -EHHHHH----EEEEE---HHHHHHH---EEE--HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEE--HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHEEEEEE--HHHHHHHHHHHH----EEEEEE--HHHHHHHHH----EEEEE-HHHHHHHHH--------HHH-HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE----HHHHHH-----EEEE-HHHHHHHHH-E---------------------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dssp
define            : -HHHHHHHHHEEEEE---HHHHHHHHH--EEEEHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEE-HHHHHHHHHHHH--EEEEEEHHHHHHHHHHH--EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEEEEHHHHHHHHH---EEEEEHHHHHHHHHH-EEEEEEEEEEEE-EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :define
stride            : -EHHHHHHHH-EEEEE---HHHHHHH---EEE--HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE--HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHEEEEEE--HHHHHHHHHHHHH---EEEEEE--HHHHHHHHHH---EEEEEHHHHHHHHHHH-------HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE----HHHHHHH----EEEE-HHHHHHHHH-E---------------------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :stride


Q3 values for 1onrb-1-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	77.22	69.30	78.48
dsc	73.42	67.72	74.05
pred	70.25	60.44	68.99
mul	64.87	58.23	66.46
nnssp	75.00	67.41	75.00
zpred	62.03	59.81	63.61
cons	75.32	68.67	76.58