Results for 1pbwb-1-AS


1pbwb-1-AS    : LPDLAEQFAPPDIAPPLLIKLVEAIEKKGLECSTLYRTQSSSNLAELRQLLDCDTPSVDLEMIDVHVLADAFKRYLLDLPNPVIPAAVYSEMISLAPEVQSSEEYIQLLKKLIRSPSIPHQYWLTLQYLLKHFFKLSQTSSKNLLNARVLSEIFSPMLFRFSAASSDNTENLIKVIEILISTEWNERQPAPALPP : A43953
A43953        : CDLTTLVKAHFTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSFSDLIEDVKMAFDRDGEKADIVNEDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYP...KFIESAKTTDPDEQLEILHEALKLLPPAHCETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMSAENLGIVFGPTLMRAPEL..DAMAALN........DIRYQRLVVEMLIK : HSPHOSINK
HSPHOSINK     : LPDLPEQFSPPDVAPPLLVKLVEAIERTGLDSESHYRPEPAPRTDWSLSDVDQ.......WD..TAALADGIKSFLLALPAPLVTPEASA......EARRALREAAGPVGPALEPPTLPLHRALTLRFLLQHLGRVARRAPALGPAVRALGATFGPLLLRAPPPPSDGSEPSPDFPALLVEKLLQEEVAPPALPP : P85A_BOVIN
P85A_BOVIN    : LPDLAEQFAPPDVAPPLLIKLVEAIEKKGLECSTLYRTQSSSNPAELRQLLDCDTASLDLEMFDVHVLADAFKRYLLDLPNPVIPVAVSSELISLAPEVQSSEEYIQLLKKLIRSPSIPHQYWLTLQYLLKHFFKLSQTSSKNLLNARVLSELFSPLLFRFPAASSENTEHLIKIIEILISTEWNERQPAPALPP : HSU42391
HSU42391      : VDSLTSDKAS...VPIVLEKLLEHVEMHGLYTEGLYRKSAANRTRELRQALQTD..PAAVLEFPIHAITGVLKQWLRELPEPLMTFAQYG...DFLRAVELPEKQEQLAAIYAVLEHLPEANHNSLERLIFHLVKVALLEDVNRMSPGALAIIFAPCLLRCPDNSDKDVLKITTCVEMLIKEQMRKMEISQLEAA : HUMRIP1R
HUMRIP1R      : LADAVERTMM.IRLPAVFRECIDYVEKYGMKCEGIYRVSIKSKVDELKAAYDRE.ESTNLYE...NTVASLLKQYLRDLPENLLTKELMP...RFEEACGRTTETEKVQEFQRLLKELPECNYLLISWLIVHMDHVIAKELETKMNIQNISIVLSPTVQISNRVLYVFFTHVQELFGNVVLKQVMKNMATMPTLP : HSU17032
HSU17032      : LQDLVTAEKP...IPLFVEKCVEFIEDTGLCTERLYRVSNKTDQENIQKQFVQDHNINLVMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHP...ELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFGQPLMRPDLKSMTTKIHQSVVETFIQQCQFFFVETTNIVAP : HSBCR
HSBCR         : LKRMPSRKQTRSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYP...NFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEK..ESKLPANPSQPITMTDSWSLMSQVQVLLY : A49307
A49307        : LKRTPSKKQTRSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISVATDIQALKAVFDANNKDILLMLMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYP...AFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEV..ESKAHLT.....SAADIWSHMAQVQVLLY : YN54_CAEEL
YN54_CAEEL    : IADCPTGSCE.DHVPMIVQACVCVIETYGMDTVGIYRIPNTAAVNALKESLSNRFDSVDLVERDVNVVSSLLKMFLRKLPEPLLTDKLYP...FFIDANRISTHHNRLHKLRNLLRKLPRPHYDTLRFLIVHLSEITKHSDVNKMECRNLALMFGPSIVRPSDDN.TMVTHMSDQCKIIETLIHYNETTEDAVPE : CEZK6691
CEZK6691      : LKGLLEHQNR..HIPLIIEKSIDQLQRRGLRAKGIYRTCVKSKIEEICNAFERSSSDDEVLDENPMNLASVVKLYLRKLPEPLLTFELYDDFVRLAQASGSNCEEERVEQLRQLARKLPVHNYETLKFIMLHLNRVSWFHEVNLMSTSNLSTVIAPSLIWMSPK......RI....................... : IT5P_HUMAN
IT5P_HUMAN    : LETISELTLMPMEIPKELWMMVDYLYRNAVQQEDLFQQPLRSEFEHIRDCLDTG.MIDNLAS...HSVAEALLLFLESLPEPVICYSTYH......NC..LECSGNY.TASKQVISTLPIFHKNVFHYLMAFLRELLKNSAKNHLDENILASIFGSLLLRNPAG..HQKLDMTE.......KKKAQ.EFIHQFLC : CEF47A42
CEF47A42      : LTDLYMRTGK..KVPVIVEKCCASIEDQGIVT.GIYRQCIQSNIQRLRAKFDSG.AEPDLFGRDIYSVSSLLKQYFRQLPNPLFTYQAYP...KLIEAFEKEDSLSEVESLRFSLETMPEAHYRTAKFLMEHLTRLCKSKSLTDMTSKNLAIVWSPNLFRPPPTLNGADTHLLSGLNVHTAICDFFEFVNDIDEE : BEM2_YEAST
BEM2_YEAST    : LEDVCERENT..LIPTIVVKLLEEIELRGLDEVGLYRIPSIGSINALKNAFDEEATDNSFLEFEVNAIAGCFKMYLRELPDSLFSHAMVNDFTDLKAHAMVNEEYKRMMN..ELLQKLPTCYYQTLKRIVFHLNKVHQHVVNNKMDASNLAIVFSMSFINQEDL....ANSMG......SRLGAVQ.TILQDFIK : YLE5_CAEEL
YLE5_CAEEL    : LSAICQHENS..LVPKFIRVITEVIESKGLETDGIYRVSNLSAVQKIRCQADQDNYKALVEE.DIHVLTGALKLFFRELTDPLFPISLHK...EYTSAMQMPNATTRFKKFEELLSRLPNENRETLKMLLRHLNRVASHSSQNRMQQHNLAIVFGPTLFHNGDG...AVNLATKNKKAGKKAKPSKKEETQATPV : YB9G_YEAST
YB9G_YEAST    : LESLIEFEQD..MVPAIVRQCIYVIDKFGLDQEGIYRKSNVLDVSKLKEEIDKDPANISMLPSDIYLVGSLLKTFFASLPDSVLPKALSS...EIKVCLQIEDPTTRKNFMHGLIYNLPDAQYWTLRALVFHLKRVLAHEAQNRMNLRALCIIWGPTIAPANPD...DANDVN..FQIMAMEVLLE.VSDQAFEP : CELF35D24
CELF35D24     : LSRLVQRERR..DTPIVLTRLIQEIEKRGVDYSGLYVLCSVEKKKMLRAELESNPLGTELES.DTNVIACLIKDFLRELPEPLISPQIHG...MLLEAASVALPNDVRHLVLKIIDCLQLSAKNCLLLVLDHLSTVLCSSPHNGLTPTRLSLIFAPLLFFCLDTFSYTISPTSKMAAVRTLDINQA.SSLQMILS : D86976
D86976        : GQDFSHAARSPDGVPFIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNVKTRVEKLCQAFENGKELVELQA..PHDISNVLKLYLRQLPEPLISFRLYHELVGLAEAEAKAASRGRAGRLRELLRDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPT..EATVSLSSLVDYPHQARVIEYLVFEEEPE : 3BP1_MOUSE
3BP1_MOUSE    : LRTHLQDLGR..DIALPIEACVLLLLSEGMQEEGLFRLAGASVLKRLKQTMASD..PHSLFC.GPHAVAGALKSYLRELPEPLMTSDLYD...DWMRAASLKEPGARLEALHDVCSRLPQENFNNLRYLMKFLALLAEEQDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWPPEKEGLDAASVSSIQVVGVVEALIQFDINFNVSG : GGU36309
GGU36309      : TAQLDSIGFS......IIKKCIHAVETRGINEQGLYRIVVNSRVQKLLSILMDPTATETEICWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQR...SFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLHLLMNHLAKVADNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEE..TVAAIMDIKFQNIVIEILIE.KIFNTVPE : S55387

              : 115-------125-------135-------145-------155-------165-------175-------185-------195-------205-------215-------225-------235-------245-------255-------265-------275-------285-------295-------305-- :
OrigSeq       : LPDLAEQFAPPDIAPPLLIKLVEAIEKKGLECSTLYRTQSSSNLAELRQLLDCDTPSVDLEMIDVHVLADAFKRYLLDLPNPVIPAAVYSEMISLAPEVQSSEEYIQLLKKLIRSPSIPHQYWLTLQYLLKHFFKLSQTSSKNLLNARVLSEIFSPMLFRFSAASSDNTENLIKVIEILISTEWNERQPAPALPP :OrigSeq
cons          : --------------HHHHHHHHHHHHHH------EEEE--HHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHEEE-----E-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------- :cons
dsc           : ----------------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHH--HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHH--------- :dsc
mul           : --HHHHH--------EHHHHHHHHH---------EEEE-----HHHHHHHH------HHHHH---HHHHHHHHHHHHH-----HHH-------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE--------------HHHH----HHHHHHHHHHHH------- :mul
nnssp         : HHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH-------EEEE--HHHHHHHHHHHH-------EE---HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH------------EE----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------- :nnssp
phd           : --------------HHHHHHHHHHHHHH------EEEE---HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHEEE-----E-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :phd
pred          : --------------HHHHHHHHHHHHH-------EEEE----HHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHEEEE-------------HHHHHHHHHHHHHHHH------------ :pred
zpred         : HHHHHH---------EHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE---HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHEEEEE---HEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEE--------HHHH-------HHHHH----------- :zpred

access : EEEBBEEEEEEEEBBBBBBEBBEBBEEEBBEBEBBB-BBBEEEBEEBEEBBEEEEEEBBBBBBEBBBBBBBBEBBBEEBEEEBBBBEBBEEBBEBBEBBEBEEEEEEBEBB-EBBEEBEEEB-BBBEBBBEBBBEBBEEEEEEEBEBEBBBBBBBBBBBEBEEEEEEBBBEBBEBBEBBBBBBBBEEBBBEBBEE : access PHD Rel : 986433678999763789999999998545556324423420699999997148765442245516999999999999278561123117999999986431311479999999975661348899999999999976544321221233122184310169987755442123455554544555532113699 : PHD Rel Pred Rel : 009998800000987658988989977766688767777876788999998679996655588765588889999785999988556568888887877776878999999985688997768888999999888887767777877765666088876609799777778677777708877767090000000 : Predator Rel

dssp : ---HHHH--------HHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHH--------HHHE-HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHH---HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHH-------------- :dssp define : --HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEEEE- :define stride : ---HHH---------HHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHH--------HHHE-HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH---HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHH------------- :stride
Q3 values for 1pbwb-1-AS View SS in Rasmol dssp define stride phd 70.77 69.74 73.33 dsc 78.97 70.26 77.44 pred 76.92 77.44 78.97 mul 62.05 60.51 64.10 nnssp 71.79 72.31 72.82 zpred 61.54 58.97 66.15 cons 74.36 72.31 76.92