Results for 1pdo-1-GJB


1pdo-1-GJB    : TIAIVIGTHGWAAEQLLKTAEMLLGEQENVGWIDFVPGENAETLIEKYNAQLAKLDTTKGVLFLVDTWGGSPFNAASRIVVDKEHYEVIAGVNIPMLVETLMARDDDPSFDELVALAVETGREGVKALK : ECAE0001225
ECAE0001225   : MLGWVITCHDDRAQEILDALEKKHGALLQCRAVNFWRGLSSNMLSRMMCDALHEADSGEGVIFLTDIAGAPPYRVASLLSHKHSRCEVISGVTLPLIEQMMACRETMTSSEFRERIVELGAPHQQQKNP : VFU650153
VFU650153     : MLAVILSGHGAFASGMAQAVHQVIGEQDQFRFIDFPEQMTTPQLEAAMRQAMEEIDSGEGIVFLTDLLGGTPFRTASLLSQARQDIEVITGTNMQMTAEMLLERDALSLLEFRNLALECGHRVEMAAKA : PTRA_KLEPN
PTRA_KLEPN    : MVHAIFCAHGQLAGAMLDSVCMVYGEVN.VSAVAFVPGE.NAADIAINLEKLVSAHTDEEWVIAVDLQCGSPWNAAAGLAMRHPQIRVISGLSLPLALELVDNQHTLSADDLCQHLQAIASQQPETVEE : PTFA_BACSU
PTFA_BACSU    : MISVIISGHGDFPIALKESSGMIFGEENNLIAVPFFKGEGIQTLQEKYHQALKDIPEEHEVLFLVDIFGGTPYNAAASFIAEDQRMDMAAGVNLPILLEVLSLREHLALKDLLNNLKAMSQQEHLEKVK : LCU28163
LCU28163      : MSKIIISGHGQYSIGLLNAFHMIFGENNGYCAVPFLKGEGIPQLQAKIATAVDDFKTEEPILIMVDIFGGTPYNAATQWIYDKPEMDVISGTNLPLLLEAATDLNENDIQQLVSDLLTAVPEEKIQAIK : AB008913

              : 2---------12--------22--------32--------42--------52--------62--------72--------82--------92--------102-------112-------122------ :
OrigSeq       : TIAIVIGTHGWAAEQLLKTAEMLLGEQENVGWIDFVPGENAETLIEKYNAQLAKLDTTKGVLFLVDTWGGSPFNAASRIVVDKEHYEVIAGVNIPMLVETLMARDDDPSFDELVALAVETGREGVKALK :OrigSeq
cons          : -EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE------HHHHHHHHHHHHH------EEEEEE-------HHHHHHHHH---EEEEE---HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :cons
dsc           : --EEEE------HHHHHHHHHHHH-------EEEE------HHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE---------HHHHHHHH---EEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul           : -HEEEE------HHHHHHHHHHHHH-------E--------HHHHHHHHHHHHHH---H-EEEEE------------HHHH-----HEE------HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--------- :mul
nnssp         : -EEEEEE-----HHHHHHHHHHHH------EEEE------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE-------HHHHHHHHH----EEEE---HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd           : -EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHH------EEEEEE------HHHHHHHHHH---EEEEE---HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HHH----- :phd
pred          : ---EEEE----HHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE--------HHHHHHHH----EEEE----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH--------- :pred
zpred         : HHEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE------EHHHHHHHHHHHEEEEEE--EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :zpred


access        : EBBBBBBB-BEBBBBBBEBBBBBBBE--EBBBBBBBEEEBBEEBBBEBBEBBEEBEEEEBBBBBBBBBEE-E--BBBBBBBEEEEBEBBBBBBBEBBBEBBBBEEEBEBEEBBEBBBBBBBEEEBEEEE : access

PHD Rel       : 989998248737999999999996122503678716787625899999999997278861799995478892369999766315515761563379999998741354589999999953523222489 : PHD Rel
Pred Rel      : 000055099778877899999878679988666579999976799999999987669986579086889998766588877877756955688768888897878870789999990986997766000 : Predator Rel


dssp          : --EEEEE--E-HHHHHHHHHHHHH-----EEEE-E-----HHHHHHHHHHHH--------EEEEE-----HHHHHHHHHH-----EEEEE---HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH------ :dssp
define        : -EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHEEEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE---HHHHHHHHHHHH-----EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH---- :define
stride        : --EEEEE--E-HHHHHHHHHHHHH-----EEEE-E-----HHHHHHHHHHHHH-------EEEEE-----HHHHHHHHHHH----EEEEE---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----- :stride


Q3 values for 1pdo-1-GJB  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	86.05	76.74	87.60
dsc	79.07	76.74	82.17
pred	79.07	80.62	80.62
mul	73.64	72.87	73.64
nnssp	82.17	79.84	83.72
zpred	64.34	67.44	67.44
cons	85.27	79.07	86.82