Results for 1pmi-2-GJB


1pmi-2-GJB    : KPLDQLAKTLATVPELNEIIGQELVDEFISGIKLPAEVGSQDDVNNRKLLQKVFGKLMNTDDDVIKQQTAKLLERTDREPQVFKDIDSRLPELIQRLNKQFPNDIGLFCGCLLL : PYU36927
PYU36927      : IKYPDENKIKNDIDTLNQKI.DKSIETLTEIKKNSEN..HIDEIKQIDKLKKVPNKTMFNEDKEIEKKIENIVEKIDKKKNIYKEIDKLLNEISKIENEKLKNINLSYGKSLGN : MANA_YEAST
MANA_YEAST    : KPLQEIADELKRIPELRNIVGEETSRNFIENIQPSAQKGSPEDEQNKKLLQAVFSRVMNASDDKIKIQARSLVERSKNSPSDFNKPD..LPELIQRLNKQFPDDVGLFCGCLLL : MANA_HUMAN
MANA_HUMAN    : RPVEEIVTFLKKVPEFQFLIGDEAATHLKQTMS........HDSQVASSLQSCFSHLMKSEKKVVVEQLNLLVKRISQQAAAGNNMEDIFGELLLQLHQQYPGDIGCFAIYFLN : MANA_EMENI
MANA_EMENI    : RPLAEIVHFLKAVAPLRYLIGVQTATDFENAVRGFENTEDPEQTKNKVALRTLFTSLMQSASENIEQAARELVAAAQSSPSLVNAPDTELASIIIRLNEQFPNDIGLFVFFFLN : MTCY01B28

              : 153-------163-------173-------183-------193-------203-------213-------223-------233-------243-------253-------263- :
OrigSeq       : KPLDQLAKTLATVPELNEIIGQELVDEFISGIKLPAEVGSQDDVNNRKLLQKVFGKLMNTDDDVIKQQTAKLLERTDREPQVFKDIDSRLPELIQRLNKQFPNDIGLFCGCLLL :OrigSeq
cons          : --HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEE--- :cons
dsc           : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEE---- :dsc
mul           : --HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HH-HHHHHHHH--------------HHHHHHHH-HHH----HHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHH----------E------ :mul
nnssp         : --HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEEE-- :nnssp
phd           : ---HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH-------EEEE-E- :phd
pred          : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH-------------- :pred
zpred         : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHH-------EEEEEEEEE- :zpred


access        : EEBEEBBEBBEEBEEBEEBBBEEBBEEBEEBBEEBEEEEEEEEBEEEEBBEEBBBEBBEEEEEEBEEEBEEBBEEBEEEEEBBEEBEE-BBEBBEEBEEEBEEEBBBBBBBBBE : access

PHD Rel       : 996489989986289999632268999999862667889954366789999999996335078999999999999721622237725789999999999489875122221139 : PHD Rel
Pred Rel      : 007677979976777787765556556776877999999766068699999898986857776877799899977750097886979967999999998799996057676000 : Predator Rel


dssp          : --HHHHHHHHHH-HHHHHHH-HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHH-----HHHHHHHHHHH-----HHHH----E :dssp
define        : -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH------------- :define
stride        : --HHHHHHHHHH-HHHHHHH-HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---HHHHHHHHHHHH----HHHHHH---E :stride


Q3 values for 1pmi-2-GJB  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	79.82	73.68	78.07
dsc	84.21	79.82	84.21
pred	80.70	78.07	79.82
mul	75.44	70.18	72.81
nnssp	81.58	76.32	83.33
zpred	75.44	72.81	76.32
cons	84.21	78.07	84.21