Results for 1pnmb-2-AS


1pnmb-2-AS    : GADRVTEIDRLLEQKPRLTADQAWDVIRQTSRQDLNLRLFLPTLQAATSGLTQSDPRRQLVETLTRWDGINLLNDDGKTWQQPGSAILNVWLTSMLKRTVVAAVPMPFDKWYSASGYETTQDGPTGSLNISVGAKILYEAVQGDKSPIPQAVDLFAGKPQQEVVLAALEDTWETLSKRYGNNVSNWKTPAM : A56681
A56681        : SADRVKEIDNRIEAYDKLTADDMWAILQQTSRVDLNHRLFTPFLTQATQGLPSNDNSVKLVSMLQQWDGINQLSSDGKHYIHPGSAILDIWLKEMLKATLGQTVPAPFDKWYLASGYETTQEGPTGSLNISTGAKLLYESLLEDKSPISQSIDLFSGQPQNDVIRKTLNTTYQKMIEKYGDNPANWQTPAT : MANA_YEAST

              : 260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------4 :
OrigSeq       : GADRVTEIDRLLEQKPRLTADQAWDVIRQTSRQDLNLRLFLPTLQAATSGLTQSDPRRQLVETLTRWDGINLLNDDGKTWQQPGSAILNVWLTSMLKRTVVAAVPMPFDKWYSASGYETTQDGPTGSLNISVGAKILYEAVQGDKSPIPQAVDLFAGKPQQEVVLAALEDTWETLSKRYGNNVSNWKTPAM :OrigSeq
cons          : ---HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH--EEE------EE----HHHHHHHHHHHHHHH----------EEE-------------EEEE---HHHHHHHHH--------EEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------ :cons
dsc           : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH-------------EEEE--HHHHHHHHHH-------HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------ :dsc
mul           : ---HHHHHHHHHHH---HHH--HHHHHH-----------E-----H------------EEEE------------------------EHHHHHHHHHHHHH-EEE--------------------------------HHHHHHH--------EEE-------HE-HHHH----HHHH--------------- :mul
nnssp         : -HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH-------------HHHHH---------HHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHH---------------------------EEE---HHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------------ :nnssp
phd           : ----HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH--EEE------EE----HHHHHHHHHHHHHHHEEEE------EEEE--EEE-------EEEE---HHHHHHHHHH-------EEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------ :phd
pred          : --------HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH-----------EEE-----EEEEHHHHHHHHHHHH------------------------EEEE---HHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------- :pred
zpred         : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE-----EEEEEEEEEEE-------------EEEEEEE----EE-------EEE----EEEEHHHHHHHHHHEEEEEEEE-HHE-------EE-------EEEEEEHEEEHHHHH------EEEEEE------HEEEEEHHHHHHHHEE--------------E :zpred


access        : EEEEBEEBEE-BEBEEEBEBEEBBBBBEEBBE--BEBEBBBEBBEBBBEEBEEEEEE-EBBEBBEEBEBBEBB-EEEEEBE-EBBBBBBBBBEEBBEEBBBBBBEBEBEEBBBBEEEEB-EEEEEEBBBBBBBBEBBBEBBEEEEEEBEEBBEBBEEEEEEEBBBEBBEEBBEEBBEE-EEE-EEBEEEEE : access

PHD Rel       : 99951589878998314339999999999632332121211146686135777774169998766752221126999711147721447999999998641434188762046513342268984324651541676666673679984411222577524898999999999999998769775689999 : PHD Rel
Pred Rel      : 00767609099986967777780987876777766555606786887698999907007999998667770088999950009005669778000599987600899990767799966880999900067066577779867799977565656690007799799766909877677999889999000 : Predator Rel


dssp          : -----HHHHHHHHH---E-HHHHHHHHHHHHHE---HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---E--E-----EE---HHHHHHHHHHHHHHH-HHHH----HHHHH-------------------HHHHHHHHH--HHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHH--EE-- :dssp
define        : --HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-EEEEE---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----EEEEEHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEEEE :define
stride        : ---HHHHHHHHHHH---E-HHHHHHHHHHHHHE--HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---E--E-----EE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHH--------E--E--------HHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHH--EE-- :stride


Q3 values for 1pnmb-2-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	70.68	71.20	70.16
dsc	72.25	71.73	74.35
pred	72.77	67.54	73.82
mul	58.64	51.31	59.69
nnssp	74.35	69.11	76.44
zpred	47.12	48.69	50.79
cons	71.73	69.63	73.30