Results for 1pyta-1-AS


1pyta-1-AS    : KEDFVGHQVLRITAADEAEVQTVKELEDLEHLQLDFWRGPGQPGSPIDVRVPFPSLQAVKVFLEAHGIRYRIMIEDVQSLLDEEQEQMFASQSR : CBP2_RAT
CBP2_RAT      : QETFVGDQVLEIIPSHEEQIRTLLQLEAEEHLELDFWKSPTIPGETVHVRVPFASIQAVKVFLESQGIDYSIMIEDVQVLLDQEREEMLFNQQR : CBPB_PIG
CBPB_PIG      : GEHFEGEKVFRVNVEDENDISELHELASTR..QIDFWKTQIKPHSTVDFRVKAEDILAVEDFLEQNELQYEVLINNLRSVLEAQFDSRCRTTG. : CEZC4348
CEZC4348      : NAEIADDKKFQVLRAHATDVPQLKALRDIHEHDLDFWQTPSKVGHRADIMVDEDRMEWLDSVLKNSNISYDVIIEDVGKLILERFSNLLFSKRM : IPYR_BOVIN

              : 4---------14--------24--------34--------42--------56--------66--------76--------86--------96-- :
OrigSeq       : KEDFVGHQVLRITAADEAEVQTVKELEDLEHLQLDFWRGPGQPGSPIDVRVPFPSLQAVKVFLEAHGIRYRIMIEDVQSLLDEEQEQMFASQSR :OrigSeq
cons          : --------EEEEE---HHHHHHHHHHHHHH---H------------EEEEE---HHHHHHHHHHH---EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :cons
dsc           : ----------EEE------HHHHHHHHHHH----------------EEEEE----HHHHHHHH------EEEEEHHHHHHHHHHHHHH------ :dsc
mul           : -HHHHHHHHH--H-H--H-HHHHHHHHHHH--HH------------EEEEEH---HHHHHHHHH-----EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHH---- :mul
nnssp         : ---------EEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEE----HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd           : --EE---EEEEEE---HHHHHHHHHHHHH----E-------------EEEE--HHHHHHHHHHHH---EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :phd
pred          : --------EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEEE--HHHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred         : HHHHHHHHHHHEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH---- :zpred


access        : EEEBEEEEBBEBBBEEEEEBEEBEEBEE-EEBEBEBBEEEEEEE-EBEBEBEBEBBEBBEBBBEBEEBBBBBBBEBBBEBBEEEBEEBBBEEEE : access

PHD Rel       : 9612121437652564135899999742112221113377998553145616323689999999648725651563689999997998611489 : PHD Rel
Pred Rel      : 0077886507606767879999999999989988550809999997569058977687999997779758066805668999990007777000 : Predator Rel


dssp          : -------EEEEEE---HHHHHHHH-----HHH--EEEE--------EEEEE-HHHHHHHHHHHHH---EEEEEE--HHHHHHHHHHHHHH---- :dssp
define        : EEEE-EEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH---------------EEEEEEEEE-HHHHHHHHHHHHEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH-- :define
stride        : -------EEEEEE---HHHHHHHHH----HHH--EEEE--------EEEEE-HHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHH--- :stride


Q3 values for 1pyta-1-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	77.66	76.60	76.60
dsc	71.28	63.83	70.21
pred	75.53	71.28	76.60
mul	60.64	62.77	59.57
nnssp	69.15	60.64	70.21
zpred	63.83	65.96	64.89
cons	79.79	74.47	78.72