Results for 1rec-2-DOMAK


1rec-2-DOMAK    : KTNQKLEWAFSLYDVDGNGTISKNEVLEIVTAIFKMISPEDTKHLPEDENTPEKRAEKIWGFFGKKDDDKLTEKEFIEGTLANKEILRLIQFEPQKVKEKLK : S82199
S82199          : KVDQKLRWYFKLYDVDGNGCIDRGELLNIIKAIRAINRCN.........ETAEEFTNMVFDKIDINGDGELSLEEFMEGVQKDTHIVKLIQNDGKNP..HAP : RECO_MOUSE
RECO_MOUSE      : KPTQKLEWAFSLYDVDGNGTISKNEVLEIVMAIFKMIKPEDVKLLPDDENTPEKRAEKIWAFFGKKEDDKLTEEEFIEGTLANKEILRLIQFEPQKVKERIK : VIS1_RAT
VIS1_RAT        : SFEQKLNWAFNMYDLDGDGKITRVEMLEIIEAIYKMVGTVIMMK..MNEDTPEQRVDKIFSKMDKNKDDQITLDEFKEAAKSDPSIVLLLQCDIQ....... : NCS1_CAEEL
NCS1_CAEEL      : NLDEKLHWAFKLYDLDQDGFITRNEMLSIVDSIYKMVGSSVQLP..EEENTPEKRVDRIFRMMDKNNDAQLTLEEFKEGAKADPSIVHALSLYEGLS..... : S82200
S82200          : KLEHKLRWTFKVYDKDGNGCIDKPELLEIVESIYKLKKVCRSEVE.ERTPTPEEVVDRIFQLVDENGDGQLSLDEFIDGARKDKWVMKMLQMD.VNPGGWIS : BDR1_HUMAN
BDR1_HUMAN      : KLEQKLKWAFSMYDLDGNGYISRSEMLEIVQAIYKMVSSVMKMP..EDESTPEKRTDKIFRQMDTNNDGKLSLEEFIRGAKSDPSIVRLLQCDPSSASQF.. : VISI_CHICK
VISI_CHICK      : KTHLKLEWAFSLFDVDRNGEVSKSEVLEIITAIFKMIPEEERLQLPEDENSPQKRADKLWAYFNKGENDKIAEGEFIDGVMKNDAIMRLIQYEPK....... : CATR_CHLRE
CATR_CHLRE      : PKKEEIKKMISEIDKDGSGTIDFEEFLTMMTAKMGERDSREAFRLFDDDNITIKDLRRVAKELGENLTEEELQEMIAEADRNDNEIDEDEFIRIMKK..... : NCS2_CAEEL
NCS2_CAEEL      : TPEQKLEWAFRMYDIDGNGTIDEKEMIKIIEAIYEMLGPEVTKS..ADDS.PRKRAKMIFEKMDVNNDKELTLKEFVDGCLADKELFQILTNEVKK...... : CELK03E6
CELK03E6        : TLDEKLDCAFSLYDVDKDGFITKDEMADIVDAIYSMIGNMLELP..KDEDTPQKRVEKIFTNMDRNLDGQLTREEFKEGSKADPWIVQALTMDISS...... : S61168
S61168          : TLEEKLSWAFELYDLNHDGYITFDEMLTIVASVYKMMGSMVTLN..EDEATPEMRVKKIFKLMDKNEDGYITLDEFREGSKVDPSIIGALNLYDGL...... : FREQ_DROME
FREQ_DROME      : NLDEKLQWAFRLYDVDNDGYITREEMYNIVDAIYQMVGQQPQS...EDENTPQKRVDKIFDQMDKNHDGKLTLEEFREGSKADPRIVQALSLGGG....... : ACU61222
ACU61222        : TVEEKLKWAFRLYDLDNDGFITRDELLDIVDAIYRMVGESVRLP..EEENTPEKRVNRIFQVMDKNKDDKLTFDEFLEGSKEDPTIIQALTLCDSGQ..... : NCS1_SCHPO
NCS1_SCHPO      : ELNDKLIWAFQLYDLDNNGLISYDEMLRIVDAIYKMVGSMVKLP..EDEDTPEKRVNKIFNMMDKNKDGQLTLEEFCEGSKRDPTIVSALSLYDGL...... : S61168

                : 97--------107-------117-------127-------137-------147-------157-------167-------177-------187-------19 :
OrigSeq         : KTNQKLEWAFSLYDVDGNGTISKNEVLEIVTAIFKMISPEDTKHLPEDENTPEKRAEKIWGFFGKKDDDKLTEKEFIEGTLANKEILRLIQFEPQKVKEKLK :OrigSeq
cons            : ---HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH--H------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH----HHHHHHHH----------- :cons
dsc             : ---HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH--HH------------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----HHHHHHHH----------- :dsc
mul             : HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHH----------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHH-H---HHHHHHHH---------- :mul
nnssp           : HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHH-------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHH :nnssp
phd             : ---HHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH-----HHHHHEE------------ :phd
pred            : ---HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHH----HHHHHHHHH---------- :pred
zpred           : HHHHHHHHHHHEE--------EHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE----------- :zpred


access          : EEEEEBEBBBEB-E-EEEE-BEEEEBBEBBEBBBEBBEEEBE-E-EEEEEEEEEEBEEBBE-BEEEEEEE--BEEB-EE-EEEEEBBEBBEBEEEEEEEE-E : access

PHD Rel         : 972588887443245888744457999999999998432257678867788356789999974578887213789986488873654112114678644689 : PHD Rel
Pred Rel        : 007777999777589000096899099999999888678988767999999788878897787790008956778788677968777778759090077000 : Predator Rel


dssp            : -HHH-HHHHHHHH-------EEHHHHHHHHHHHH----HHHH----HHH--HHHHHHHHHHH-------EE-HHHHHHHHHH-HHHHHHH---HHHHH---- :dssp
define          : HHHHHHHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH-- :define
stride          : -HHHHHHHHHHHH-------EEHHHHHHHHHHHHH------HHH-------HHHHHHHHHHHH------EE-HHHHHHHHHH-HHHHHHH---HHHHHH--- :stride


Q3 values for 1rec-2-DOMAK  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	68.63	68.63	74.51
dsc	73.53	71.57	75.49
pred	69.61	71.57	75.49
mul	70.59	68.63	74.51
nnssp	75.49	78.43	83.33
zpred	68.63	76.47	74.51
cons	71.57	73.53	75.49