Results for 1reqc-2-AS


1reqc-2-AS    : YKDMDWLDTYAGIPPFVHGPYATMYAFRPWTIRQYAGFSTAKESNAFYRRNLAAGQKGLSVAFDLPTHRGYDSDNPRVAGDVGMAGVAIDSIYDMRELFAGIPLDQMSVSMTMNGAVLPILALYVVTAEEQGVKPEQLAGTIQNDILKEFMVRNTYIYPPQPSMRIISEIFAYTSANMPKWNSISISGYHMQEAGATADIEMAYTLADGVDYIRAGESVGLNVDQFAPRLSFFWGIGMNFFMEVAKLRAARMLWAKLVHQFGPKNPKSMSLRTHSQTSGWSLTAQDVYNNVVRTCIEAMAATQGHTQSLHTNSLDEAIALPTDFSARIARNTQLFLQQESGTTRVIDPWSGSAYVEELTWDLARKAWGHIQEVEKVGGMAKAIEKGIPKMRIEEAAARTQARIDSGRQPLIGVNKYRLEHEPPLDVLKVDNSTVLAEQKAKLVKLRAERDPEKVKAALDKITWAAGNPDDKDPDRNLLKLCIDAGRAMATVGEMSDALEKVFGRYT : MUTB_STRCM
MUTB_STRCM    : VEGLDFLETYPGVAPYLRGPYPTMYVNQPWTIRQYAGFSTAEESNAFYRRNLAAGQKGLSVAFDLPTHRGYDSDHPRVTGDVGMAGVAIDSIYDMRQLFDGIPLDKMTVSMTMNGAVLPVLALYIVAAEEQGVPPEKLAGTIQNDILKEFMVRNTYIYPPKPSMRIISDIFAYTSQKMPRYNSISISGYHIQEAGATADLELAYTLADGVEYLRAGQEAGLDVDAFAPRLSFFWAIGMNFFMEVAKLRAARLLWAKLVKQFDPKNAKSLSLRTHSQTSGWSLTAQDVFNNVTRTCVEAMAATQGHTQSLHTNALDEALALPTDFSARIARNTQLLIQQESGTTRTIDPWGGSAYVEKLTYDLARRAWQHIEEVEAAGGMAQAIDAGIPKLRVEEAAARTQARIDSGRQPVIGVNKYRVDTDEQIDVLKVDNSSVRAQQIEKLRRLREERDDAACQDALRALTAAAERGPGQGLEGNLLALAVDAARAKATVGEISDALESVYGRHA : MUTA_MOUSE
MUTA_MOUSE    : T..LDLPEELPGVKPFTRGPYPTMYTYRPWTIRQYAGFSTVEESNKFYKDNIKAGQQGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVRGDVGMAGVAIDTVEDTKILFDGIPLEKMSVSMTMNGAVIPVLATFIVTGEEQGVPKEKLTGTIQNDILKEFMVRNTYIFPPEPSMKIIADIFQYTAQHMPKFNPISISGYHMQEAGTDAILELAYTIADGLEYCRTGLQAGLTIDEFAPRLSFFWGIGMNFYMEIAKMRAGRRLWAHLIEKMFPKNSKSLLLRAHCQTSGWSLTEQDPYNNIVRTAIEAMAAVFGGTQSLHSNSFDEALGLPTVKSARIARNTRIIIQEESGIPKVADPWGGSYMMESLTNDVYEAALKLIYEVEEMGGMAKAVAEGIPKLRIEECAARRQARIDSGSEVIVGVNKYHLEKEDSVHLLAIDIISLRKKQIEKLKKIKSSRDQALAEQCLSALTQCAASG.....DGNILALAVDAARARCTVPEITDAFKKVFGEHK : MUTA_PROFR
MUTA_PROFR    : AP...KKLGYPGVAPFTRGTTVRNGDMDAWDVRALHEDPDEKFTRKAILEGLERG..........VTSLLLR.........VDPDAIAPEHLDEV...LSDVLLEMTKVEVFSRYDQGAAAEALVSVYERSDKPAKDLALNLGLDPIAFAALQGT.....EPDLTVLGDWVRRLAKFSPDSRAVTIDANIYHNAGAGDVAELAWALATGAEYVRALVEQGFTATEAFDTINFRVTATHDQFLTIARLRALREAWARIGEVFG.VDEDKRGARQNAITSWRDVTREDPYVNILRGSIATFSASVGGAESITTLPFTQALGLPDDFPLRIARNTGIVLAEEVNIGRVNDPAGGSYYVESLTRSLADAAWKEFQEVEKLGGMSKAVMTEHVTKVLDACNAERAKRLANRKQPITAVSEFPMIGARSIETKPFPAAPARK......LAWH..RDS..............................E..............VFEQLMDRST : MUTA_STRCM
MUTA_STRCM    : AAP...DAGFPGFAPFVRGSVPEGNTPGGWDVRQRYASADPARTNEAVLTDLENG..........VTSLWLT.........LGSAGLPVTGLERA...LDGVYLDLVPVALDAGSEAATAARELLRLYEAAGVADDAVRGTLGADPLGH.EARTG...EKSTSFAAVAELARLCGERYPGLRALTVDALPYHEAGASAAQELGASLATGVEYLRALHDKGLGVEKAFAQLEFRFAATADQFLTIAKLRAARRLWARVAEVSG..VPAAGAQRQHAVTSPVMMTRRDPWVNMLRTTVACLGAGVGGADAVTVLPFDHELGLPDAFARRIARNTSTILLEESHLARVIDPAGGSWYVERLTDELAHAAWDFFKEIERADGQVAALRSGLVGDRIAATWAERRKKLARRREPITGVSEFPLLTERPVEREPAPAAPPGG.....LPRVR..RDE..............................A...............YEELRGR.. : MEU28335
MEU28335      : ......MSAQASVAEVKRD........KPWIIRTYAGHSTAAESNKLYRGNLAKGQTGLSVAFDLPTQTGYDPDHELARGEVGKVGVSIAHLGDMRALFDQIPLAQMNTSMTINATAPWLLSLYLAVAEEQGAPLAALQGTTQNDIIKEYLSRGTYVFPPAPSLRLTKDVILFTTKNVPKWNPMNVCSYHLQEAGATPVQELSYALAIAIAVLDTVRDDPASFSDVFSRISFFVNAGMRFVTEICKMRAFAELWDEIAQERYITDAKKRIFRYGVQVNSLGLTEQQPENNVHRILIEMLAVTLSRARAVQLPAWNEALGLPRPWDQQWSMRMQQILAFETDLLEYDDIFDGSTVIEARVEALKEQTRAELTRIAEIGGAVTAVEAGELKRALVESNARRISAIEKGEQIVVGVNKWQQGEPSPLTAGDGAIFTVSEEAETRIREWRSKRDERAVGQALADLEQAARSG......ANIMPPSIAAAKAGVTTGEWGQRLREVFGEYR : CEZK1058
CEZK1058      : RDCAQRSVELPGQFPFTRGPYPTMYTQRPWTIRQYAGFSTVEESNKFYKENIKAGQQGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVFGDVGMAGVAVDSVEDMRQLFDGINLEKMSVSMTMNGAVVPVLAMYVVAAEEAGVSRKLLAGTIQNDILKEFMVRNTYIYPPEPSMRIIGDIFAYTSREMPKFNSISISGYHMQEAGADAVLEMAFTIADGIQYCETGLNAGLTIDAFAPRLSFFWGISMNFYMEIAKMRAARRLWANLIKERFPKSDKSMMLRTHSQTSGWSLTEQDPYNNIIRTTIEAMASVFGGTQSLHTNSFDEALGLPTKFSARIARNTQIIIQEESGICNVADPWGGSYMMESLTDEIYEKALAVIKEIDELGGMAKAVASGMTKLKIEEAAAKKQARIDAGKDVIVGVNKYRLDHEQQVEVLKIDNAKVREEQCAKLNHIRATRDAEKAQKALDAITEGAR.G.....NGNLMELAIEAARARCTVGEISDAMEKVFNRHA : SBM_ECOLI
SBM_ECOLI     : LDNLEVTGTLPGLPPYVRGPRATMYTAQPWTIRQYAGFSTAKESNAFYRRNLAAGQKGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVAGDVGKAGVAIDTVEDMKVLFDQIPLDKMSVSMTMNGAVLPVLAFYIVAAEEQGVTPDKLTGTIQNDILKEYLCRNTYIYPPKPSMRIIADIIAWCSGNMPRFNTISISGYHMGEAGANCVQQVAFTLADGIEYIKAAISAGLKIDDFAPRLSFFFGIGMDLFMNVAMLRAARYLWSEAVSGFGAQDPKSLALRTHCQTSGWSLTEQDPYNNVIRTTIEALAATLGGTQSLHTNVFDEALGLPTDFSARIARNTQIIIQEESELCRTVDPLAGSYYIESLTDQIVKQARAIIQQIDEAGGMAKAIEAGLPKRMIEEASAREQSLIDQGKRVIVGVNKYKLDHEDETDVLEIDNVMVRNEQIASLERIRATRDDAAVTAALNALTHAAQHN......ENLLAAAVNAARVRATLGEISDALEVAFDRYL : JC4560
JC4560        : LEGMEHLDYVSGLPPFLRGPYSGMYPMRPWTIRQYAGFSTAEESNAFYRRNLASGQKGLSVAFDLATHRGYDADHSRVVGDVGKAGVSICSLEDMKVLFDGIPLSKMSVSMTMNGAVLPILAFYINAGLEQGAKLEEMAGTIQNDILKEFMVRNTYIYPPEFSMRIIADIFEYTSQNMPKFNSISISGYHMQEAGATADIEMAYTLADGMQYLKAGIDAGIDVDAFAPRLSFFWAIGVNHFMEIAKMRAARLLWAKIVKSFGAKNPKSLALRTHSQTSGWSLTEQDPFNNVGRTCIEAMAAALGHTQSLHTNALDEAIALPTDFSARIARNTQIYIQEETLVCKEIDPWGGSYYVESLTNELVHKAWTLIKEVQEMGGMAKAIETGLPKLRIEEAAARTQARIDSHQQVIVGVNKYRLPKEDPIDILEIDNTAVRKQQIERLNDLRSHRDEKAVQEALEAITKCVETK.....EGNLLDLAVKAAGLRASLGEISDACEKVVGRYK : NCS2_CAEEL

              : 55--------65--------75--------85--------95--------105-------115-------125-------135-------145-------155-------165-------175-------185-------195-------205-------215-------225-------235-------245-------255-------265-------275-------285-------295-------305-------315-------325-------335-------345-------355-------365-------375-------385-------395-------405-------415-------425-------435-------445-------455-------465-------475-------485-------495-------505-------515-------525-------535-------545-------555--- :
OrigSeq       : YKDMDWLDTYAGIPPFVHGPYATMYAFRPWTIRQYAGFSTAKESNAFYRRNLAAGQKGLSVAFDLPTHRGYDSDNPRVAGDVGMAGVAIDSIYDMRELFAGIPLDQMSVSMTMNGAVLPILALYVVTAEEQGVKPEQLAGTIQNDILKEFMVRNTYIYPPQPSMRIISEIFAYTSANMPKWNSISISGYHMQEAGATADIEMAYTLADGVDYIRAGESVGLNVDQFAPRLSFFWGIGMNFFMEVAKLRAARMLWAKLVHQFGPKNPKSMSLRTHSQTSGWSLTAQDVYNNVVRTCIEAMAATQGHTQSLHTNSLDEAIALPTDFSARIARNTQLFLQQESGTTRVIDPWSGSAYVEELTWDLARKAWGHIQEVEKVGGMAKAIEKGIPKMRIEEAAARTQARIDSGRQPLIGVNKYRLEHEPPLDVLKVDNSTVLAEQKAKLVKLRAERDPEKVKAALDKITWAAGNPDDKDPDRNLLKLCIDAGRAMATVGEMSDALEKVFGRYT :OrigSeq
cons          : -------------------------------HHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-----EEEE-----------------------EEE-HHHHHHHHHH--------EEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHH---HHHHHHHHHHH--EE------HHHHHHHHHHH----------EE---HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH-HEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHH-----E-HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHEEHH-----EEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE------------EE-------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :cons
dsc           : -------------------------------HHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHEEEEE---------------------EEEHHHHHHHHHHHHH-------EEEE------HHHHHHHHHHHHH-----HH----HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHH---------------HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHEEHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHEE------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEE-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH---- :dsc
mul           : ------H-----------------------EEEE-------H---HH-HHHHHH---------------------------------EEHHH-H-HHHHHHHHHHHHEE-E------E-HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH---H-HHHHHHE-----------HHHHHHHHE----------------------HHHHHHHHHHHHH-HHEEEHH---------H----HH-H------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHE------------------EEEHHHHHHHHHH------------HHH------HHHH----EEEEE------EE---------EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH------EEE-------H---HHHHH------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--- :mul
nnssp         : ----------------------------------------HHHHHHHHHHHHHH--------------------------------EEE--HHHHHHHHH--------EEEE-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE------HHHHHHHHHHH----------EE---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH--EEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH----EEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE------------EE--------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH-- :nnssp
phd           : -----------------------------HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-----EEEE---------------------------HHHHHHHHHH------EEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHH----HHHHHHHHHHH-EEE-----HHHHHHHHHHHHHH------EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHH----------------HHHHHHHHHHHHHHH-----E---HHHHHH----HHHHHHHHHHHHEEEE-----EEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE--------------------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :phd
pred          : ------------------------------EEE-----------HHHHHHHHHH-----EEEE----------------------EEEEEE-HHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH-----------------------HHHHHHHHHH---EEEE-----------HHHHHHHEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH-------EEEE-----HHHHHHHHHHHHH----EEE-------------HHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----------EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred         : -------------EEEEE------------EEEE------HHHHHHHHHHHHH-----------EEE-----------------EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHEEEHHHEHH----------HHEEEEEEEE---------EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHH---EEHHHHHHHHHHEH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHEEE--------EEE----EEEEEEEHHHHHHHH---EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEHH-----EEE-----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHH----------HHHHHHHH-- :zpred

access : EEEBEBBEEBEEBBEBBEEE-BEB--B-BBBBEBBBEBEEBEEBEEBB-EBBEEEEEEBBBBBEBBEBEB-EEE-EEBBBEBBEBBBBBBBBEEBEBBBEBBBBEEBBBBBBBEBBBBBBBBBBBBBBEEEE-EBEEBEE-B-EEBBEEBBB-BBBB-EEEEEBEBBBEBBBBBBEEBEEB-BBBBBBBBBEEBBBEBBBEBBBBBBEBBEBBEBBBEBBBEBEEBBEEBBBBBBBBBEBBBBBBEB-BBEEBBBEBBEEBBEEEEEEBBBEE-BEBBEBEBEEEEE--EBB-BBBEBBBBBBEBBEBBBB-BBEEBBEBEEEBBB-BBEEBBBBBBEEBEBBEBBEEEEBEBBBEBBBEEBBEEBBEBBEEBEEBEEBBEBBBEEBBE--BEEBBBEEEBEBEEEEEBBBBBBEB-BEEEEEBEBBEBEBBEBEEEEBEEBEEBEEEEEEEEBEEBBEBBBEBBEEEEEEE-EBBBBBBBBEBBEBEBEBEEBBEBBEEBBEE-E : access PHD Rel : 99986567778998677799886777783535664135543565689999999635996255324444533899975566666554222313689997617731132375424522269999999988762666132111210247887544413131887320379999999975168787311212234422256999999999999999999864365421111100023114366999999999999999999996178786210122023356642232676125679999999998477321112424643146861356886423342322135521215777322456899999999999999999965369999954672379999999999995189748875312578877553434476421389999999885024288899999999997535999877432699999999865333258999999971279 : PHD Rel Pred Rel : 00876857788900000099888566896655055690766677889867988677966666678888999999987557879666999556688978868887755855567666378887700999787997766666687667787985660060909006667888887568899988756698655667996898998788866569556777695756676888766556665788990009000000999888799909765575556689996660097906688889999998777066677776655608897688788988880777868868608999986577788999999999999797576968677769966899999999999997799677907665578899986798667657799999999999986788899909999998899000000766777999888888587687778996667000 : Predator Rel

dssp : H----------------------HHH----EE--EE----HHHHHHHHHHHHH-----EEEEE-HHHH-------HHHHHH-----E----HHHHHHH----------EEEE----HHHHHHHHHHHHHH----HHH--EEE---HHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE-EEEE-HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHH-HHHEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH---EEEEE-----------HHHHHHHHHHHHHHH----EEE------------HHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----E---E---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH------HHH-HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---- :dssp define : --------------------------EEEE-EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEEHHHHHEEEE------------EEEEEHHHHHHHHHH------EEEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----HHHHHHH--EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHEEEEEEEE---EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE-----EEEE-EEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHEEEEEE :define stride : -----------------------HHH----EE---E----HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-HHHHH-----------------E----HHHHHHHH---------EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHH---HHH--EEE---HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE-EEEEHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHH-HHHEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHH---EEEEE-HHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH------HHH-HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH---- :stride
Q3 values for 1reqc-2-AS View SS in Rasmol dssp define stride phd 75.89 70.16 76.48 dsc 77.27 71.15 76.68 pred 72.73 67.98 73.12 mul 64.23 58.10 64.43 nnssp 76.28 66.60 76.68 zpred 62.25 56.13 61.86 cons 76.88 70.16 77.87