Results for 1rlr-1-JAC


1rlr-1-JAC    : RDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPPALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAVSTFKISLPTPIMSGVRTPTR : VACI3A
VACI3A        : RNGYKENVMFDKITSRIRKLCYGLNTIDPIKIAMKVIQGIYNGVTTVELDTLAAEIAATCTTQH.PDYAILAARIAVSNLHKETKKLFSEVMEDLFNYVNPKNGKHSPIITMDIVNKYKDKLNSVIIYERDFSYNYFGFKTLEKSYLLK..INNKIVERPQHMLMRVAVGIHQ.....WDIDSAIETYNLLSEKWFTHASPTLFNAGTSRH : RIR1_YEAST
RIR1_YEAST    : RDGRKEPVQFDKITARISRLCYGLDPIDAVKVTQRIISGVYEGVTTIELDNLAAETCAYMTTVH.PDYATLAARIAISNLHKQTTKQFSKVVEDLYRYVNAATGKPAPMIVYNIVMENKDKLNSAIVYDRDFQYSYFGFKTLERSYLLR..INGQVAERPQHLIMRVALGIHG.....RDIEAALETYNLMSLKYFTHASPTLFNAGTPKP : RIR1_SCHPO
RIR1_SCHPO    : RDGRQEKVAFDKITARVSRLCYGLDSVDPVEITQKVISGVYPGVTTIELDNLAAETAATMTTKH.PDYAILAARIAVSNLHKQTEKVFSTVVQQLHDYVNPKTDKPAPMIIYDIVMKHKDELDSAIIYDRDFTYNFFGFKTLERSYLLR..IDGKVAERPQHMIMRVAVGIHG.....EDIEAAIETYNLMSQRYFTHASPTLFNAGTPRP : S75875
S75875        : RDGSSTPLNIGKIRAVVDWACLGLE.VNSIALEAGLTTRLREGISTREIQDNLISCALEMCSPNEPDWRYVAGRLHVWSLWKDTLVRRG..YQYGQYLRTVQTKVTNGEYILTYSEGELQEAGCWINSDWDTDYDYAGAVLLTSRYLLPNELPQEALLTCALLLASVEAPDRR.......LQWARRFYESIAARRISLATPILANLRVPGG : RIR1_BPT4
RIR1_BPT4     : SSGVSQSFDPQKIIKVLSWAAEGTS.VDPYELYENIKSYLRDGMTTDDIQTIVIKAAANSISVEEPDYQYVAARCLMFALRKHVYGQYEPRSFIDHISYCVNAGKYDPELLSKYSAEEITFLESKIKHERDMEFTYSGAMQLKEKYLVKDKTTGQIYETPQFAFMTIGMALHQDEP.VDRLKHVIRFYEAVSTRQISLPTPIMAGCRTPTR : RIR1_CAEEL
RIR1_CAEEL    : RDGRKEDVHFDKITSRIQKLSYGLNMVDPVAVAIKVISGLYKGVTTVELDNLAAETAASMTTQH.PEYALLAARIAVSNLHKKTNKVFSEVMKTLHEFHHPHTGKHAPMITWAIIEKNADKLNSAIVYDRDYSYTYFGFKTLERSYLLK..INKEIVERPQQMLMRVSIGIHG.....DDITSAIETYNLMSERYMTHASPTLFNSGTCRP : A30834

              : 10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90--------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------2 :
OrigSeq       : RDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPPALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAVSTFKISLPTPIMSGVRTPTR :OrigSeq
cons          : ---------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----H--HHHHHEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHEEEE----------HHHHHHHHEE-----HHHHH--HHHHHHHHHHE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------- :cons
dsc           : ---------HHHHHHHHHHHHH------HHHHH---HHHHH------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHH---HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------- :dsc
mul           : -------HHHHHHHHEHHHHHE--------HHHHHHH-E---------HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH---HH-HH--HHHHHHHHHH---------HH-E-HHHHHHHHHHHHHE-----------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH-------------------- :mul
nnssp         : ---------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHH-------HHHHH--HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---------EEE------- :nnssp
phd           : ---------HHHHHHHHHHHHH------HHHHEHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E----EEEEE---------EEEEHHHHHHHH---EEEE----------EEE--EEEEE-----HHHH-----EEEEEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------- :phd
pred          : ---------HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHEEEEE-------HHHHHHHHHHEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH--------------------- :pred
zpred         : ------EHHHHHHEEEEEEE-------EHHHHHHEEEEEE---EEEEHHHHHHHHHHHHHE------HHHHHHHHHHHHHHHH---------HHH------------EEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEE------HHHHHHHHHHHE-------EHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHEEE---EEEE------- :zpred


access        : EEEEEEEBEBEEBBBBBBBBBEBBEBBEBBEBBBEBBBBB-EBBEBBEBEEBBBEBBBEBBBEE-EEBBBBBB-BBBBEB-EEBEEEBEEBBBBBBBBBBBEEEEEBEBBBBEBBEE--EEBEBBBBBE-EBEBBBBBBEEBEEE-BBEEEBEEEBBE-BEBBBBBBBBBB-EE-EEEEEBEBBBEBBEBBBBEBBEBBBBBBBEBEEEEE : access

PHD Rel       : 9998777653378899999985367885333111554410335634178899999999985138925899999999999988541323421110112332256898863365154664421123124212212211212211122211025570122142121355676623788831269999999998866331125642246789999 : PHD Rel
Pred Rel      : 0099998868887878778866688877666777557786689806655768999998888679907077899999998688788885876865885688789999976656677888877666569577906566668885788776075776857388789079788667787687888889777880766567898998567789000 : Predator Rel


dssp          : ----------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH------HHHHH--HHHHHHHH----HHHHHH--HHHHHHHHHH---E------E---HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH---EE--HHHHHH------ :dssp
define        : ---------HHHHHHHHHHHHHEEEE-HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH--------EEEEEHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHH-----E :define
stride        : ---------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH--E--E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH----HHHHHH--HHHHHHHHHH--HHHHH---HHHHHHHHHHH--E------E---HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH--EE--HHHHHH------ :stride


Q3 values for 1rlr-1-JAC  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	59.72	59.72	60.66
dsc	73.46	72.04	74.41
pred	70.14	66.35	71.09
mul	70.14	65.40	70.14
nnssp	75.36	75.36	76.30
zpred	66.82	63.98	67.77
cons	72.99	72.99	74.41