Results for 1taq-2-AS


1taq-2-AS    : ADYRALTGDESDNLPGVKGIGEKTARKLLEEWGSLEALLKNLDRLKPAIREKILAHMDDLKLSWDLAKV : DPO1_MYCTU
DPO1_MYCTU   : PDFAALRGDPSDNLPGIPGVGEKTAAKWIAEYGSLRSLVDNVDAVRGKVGDALRANLASVVRNRELTDL : DPO1_BACCA
DPO1_BACCA   : VDLKGLMGDKSDNIPGVPGIGEKTAVKLLRQFGTVENVLA.IDEIKGKLKETLRQHREMALLSKKLAAI : TAU62584
TAU62584     : VDFRALVGDPSDNLPGVKGIGEKTALKLLKEWGSLENLLKNLDRVKPNVREKIKAHLEDLRLSLELSRV : EXO_ECOLI
EXO_ECOLI    : PDYWGLAGISSSKVPGVAGIGPKSATQLLVEFQSLEGIYE.LDAVAE.WRKKLETHKEMAFLCRDIARL : DPO1_THEAQ
DPO1_THEAQ   : ADYRALTGDESDNLPGVKGIGEKTARKLLEEWGSLEALLKNLDRLKPAIREKILAHMDDLKLSWDLAKV : EXO5_BPT5
EXO5_BPT5    : ISLKAIMGDLGDNIRGVEGIGAKRGYNIIREFGNVLDIIDPLPGKQK.YIQNLNASEELLFRNLILVDL : S73784
S73784       : IEYKGLVGDNSDNLTGIKGIGPKKGIDLLKQYGTIDNIFA.FDKLSKALQTILQGQIDTAKKFSFLASI : I64228
I64228       : VEYKGLVGDNSDNLAGIKGIGPIKGIELLQQYGTIDNIYT.FNNLPNQLQKLLNNQKEIAKTFSFLAKI : YY30_MYCTU
YY30_MYCTU   : AELALLRGDPSDGLPGVPGVGEKTAATLLARHGSLDQIMADDRKTTM.LRTKLLAASAYIKAADRVVRV : RPFTSY1
RPFTSY1      : REVMALIGDRSDNIPGVPSIGPKTASSLITKFGSVENIFN.LDQISS.QRKTLQNAREAALISWKLIGL : TPU57757
TPU57757     : LDLFSLMGDSSDNVPGVRGIGPKTAAHLLHCFGTLDGIYR.TYSLKE.LRTKIVCGKKDAFFSRSLIEL : YPCP_BACSU
YPCP_BACSU   : IDIKALMGDSSDNYPGVKGIGEKTAYKLIREYETIDRLLE.LSLLPK.QQGKIQQGLSDLEMSRKLAEI : DPO1_DEIRA
DPO1_DEIRA   : VDYRALTGDASDNIPGAKGIGPKTAAKLLQEYGTLEKVYEHAGTLKPGTRKKLLDSEENVKFSHDLSCM : ATHPOLA
ATHPOLA      : PDYKALVGDQSDNIPGVKGIGEKSAQKLLEEYSSLEEIYQ.LDKIKS.IREKLEAGKDMAFLSKRLATI : DPO1_THEFL
DPO1_THEFL   : VDYRALAGDPSDNIPGVKGIGEKTAQRLIREWGSLENLFQHLDQVKPSLREKLQAGMEALALSRKLSQV : CADNAPOLI
CADNAPOLI    : ADLRGLKGDTSDNIPGVRGIGEKGAIALLKQFRSLDALLE.IDAAPK.YQTLLREQAEAARFSRQLATI : S77056
S77056       : VDFKALCGDKSDCIPGINGIGEKTAIKLLAEYETLEKVYE.LAQIKG.LKTRLDNGKDDAMHSQMLARI : DPO1_STRPN
DPO1_STRPN   : IDLKALMGDKSDNIPGVTKVGEKTGIKLLLEHGSLEGIYE.IDGMKTKMKENLINDKEQAFLSKTLATI : DPO1_HAEIN
DPO1_HAEIN   : IDYLALMGDSADNIPGVAGVGEKTALGLLQGIGSMAEIYA.LEKVAEKLGEKLLAEKNNADLSYTLATI : DPO1_ECOLI
DPO1_ECOLI   : IDFLALMGDSSDNIPGVPGVGEKTAQALLQGLGGLDTLYA.PEKIAGTMAAKLEQNKEVAYLSYQLATI : IBB2_SOYBN

             : 180-------190-------200-------210-------220-------230-------240------ :
OrigSeq      : ADYRALTGDESDNLPGVKGIGEKTARKLLEEWGSLEALLKNLDRLKPAIREKILAHMDDLKLSWDLAKV :OrigSeq
cons         : --HHHH---------------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :cons
dsc          : --HHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :dsc
mul          : -HHHEE------------------HHHHHHH---HHHHHH-HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :mul
nnssp        : HHHHHH---------------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd          : ---E-----------------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred         : ---------------------HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred        : HHHEEEE-------EEEEEEEHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE :zpred

access       : EEBEBBBEE-EEEBEEBEEBBEE-BBEBBEEBBEBEBBBEBBEEBEEEBEEEBEEEEEBBEBBEEBBEE : access

PHD Rel      : 963121568646777667777579999999954299999858879999999999978999998775139 : PHD Rel
Pred Rel     : 006777699009999998787667999999966778686778660768877999866978987777000 : Predator Rel

dssp         : HHHHHH----------------------HHHH----E--E----------HHHH--------HHHHH-- :dssp
define       : HHHHHHH--------------------HHHHHHH--------------HHHHHH--HHHHHH------- :define
stride       : HHHH--------------------------------E--E---------HHHHHH-------HHHHH-- :stride

Q3 values for 1taq-2-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	44.93	49.28	44.93
dsc	47.83	57.97	42.03
pred	44.93	49.28	44.93
mul	56.52	57.97	56.52
nnssp	50.72	52.17	47.83
zpred	33.33	39.13	33.33
cons	47.83	52.17	42.03