Results for 1tfr-1-GJB


1tfr-1-GJB    : KEGICLIDFSQIALSTALVNFPDKEKINLSMVRHLILNSIKFNVKKAKTLGYTKIVLCIDNAKSGYWRRDFAYYYKKTWDWEGYFESSHKVIDELKAYMPYIVMDIDKYEADDHIAVLVKKFSLEGHKILIISSDGDFTQLHKYPNVKQWSPMHKKWVKIGSAEIDCMTKILKGDKKDNVASVKVRSDFWFTRVEGERTPSMKTSIVEAIANDREQAKVLLTESEYNRYKENLVLIDFDYIPDNIASNIVNYYNSYKLPPRGKIYSYFVKAGLSKLTNSINEF : DPO1_BACCA
DPO1_BACCA    : KKKLVLIDGSSVAYR.AFFALPLLHNDKGIHTNAVYGFTMMLNKILAEEE.PTHMLVAFDAGKTTFRHEAFQEYKGGRQQTPPELSEQFPLLRELLRAYRIPAYELENYEADDIIGTLAARAEQEGFEVKVISGDRDLTQLASITDIEPYTPEAVREKYGLTPEQIVDLKGLMGDKSDNIPGVPVKLLRQFGTVEGEREMALLSKKLAAIRRDREKVVALFKELGFQSFLEKMAALVVEVVEENVGIAVVNEHGRFFLRPETALADPQFVAWLGDETKKKSMF : MMU83242

              : 12--------22--------32--------42--------52--------62--------72--------82--------101-------111-------121-------131-------141-------151-------161-------171-------183-------193-------203-------213-------223-------233-------243-------253-------263-------273-------283-------293-------303 :
OrigSeq       : KEGICLIDFSQIALSTALVNFPDKEKINLSMVRHLILNSIKFNVKKAKTLGYTKIVLCIDNAKSGYWRRDFAYYYKKTWDWEGYFESSHKVIDELKAYMPYIVMDIDKYEADDHIAVLVKKFSLEGHKILIISSDGDFTQLHKYPNVKQWSPMHKKWVKIGSAEIDCMTKILKGDKKDNVASVKVRSDFWFTRVEGERTPSMKTSIVEAIANDREQAKVLLTESEYNRYKENLVLIDFDYIPDNIASNIVNYYNSYKLPPRGKIYSYFVKAGLSKLTNSINEF :OrigSeq
cons          : ---EEEEE--HH-HHHHHE------------HHEEEEEEEEE----------EEEEEEEE------HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHH---EEEHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEEEE----HHHHH----------HHHHHHE-----EHHHHHHH----------EEEEEEEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE--------EEEE----------------HHHHHHH---------- :cons
dsc           : ----EEE---HH---EEEE---------HHHHHHHHH---------------EEEEEEE--------HHHHHHH------EEEE----HHHHHHHH----EEEEHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEEE-----HHHHH------------HHEEE-----EEHHHHHH----------EEEEEHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHH----HHEEEEE-------------------------EEEEEEEE------------- :dsc
mul           : ---EEEE---------E-EHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE-----H---HHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHEE-HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EE-----H---H---------H-HH-HH----HHHHHHHHHHHH--------------H------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH------EEEEE------------EE--EEEHHH---------- :mul
nnssp         : ---EEEEE--HHHHHHHH---------------EEEEEEEEE-----------EEEEEE-------HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHH----EEE-------HHHHHHHHHHHH---EEEEEE----HHHHH----------HHHHHHH----HHHHHHHHH----------EEEEE-EEE--------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE----------------HHHHHHHH--------- :nnssp
phd           : ---EEEEE-----HHHHHE------------EEEEEEEEEEEE-E-------EEEEEEEE------HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHH---EEEHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE---HHHHH-----------HHHHHH--------EEHHH------------EEEEEEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE-------EEEEE-----EE---------HHHHHHH---------- :phd
pred          : ---EEEEEEHHHHHHHEEE---------HHHHHHHHHHHH------------EEEEEEEE------HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHEEE---------HHHHHHHHHH----EEEEEE----EEEE-----EEE-----EEEEEE--EEEHHHHHH--------EEEEEEEEEEEEEEE--------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE--------EEEEEE-----------EEEEEEE------------- :pred
zpred         : HHHEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHH-----EHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE----HEEE----------HHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----EEEEEEEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHHHEEEEEE-----------EEEEEEEHHHHHHH--HHHH :zpred


access        : EEEBBBBEBBBBBBBBBBBBBEEEEEBEBBBBBBBBBBBB-BBBEEBEEEE-E-BBBBBEEBEE-B-BEBBBEB-EEEEE-EEEBEEEBEBBEEBBEBBBBBBBEBEE-EBEEBBBBBBBEBEEEEBEBBBBBBE-EBBEBBEBEEBEEBBEEBEEEBEBBBBEBBBBBEBBEEEEEEEBBEBEBEBB--BB-BEEEEEBEBEBEBBBBB-EEEEEBEBBBEEBEBEEBEEEBBBBBBEBBEEBBBBBBBBBBBBBEB-EEBEBBBBBBBBBBEEE-EEEEEE : access

PHD Rel       : 9968896177531553221034344678731124544554352112323899179999856775313588999953544577445420469999998344333411221136899999999997388499983497255214356846789044554216894210011221589746989834898833223123133146899999999569999999976412899998787302111232213442123411159855421234432222242243699 : PHD Rel
Pred Rel      : 0070000650687676505009907556789999008856656688055899780000978999976098878787650099788790679999899085667656650776780000799766996900000990955078890908009997086769986650088487079909970900907668770688809999568988780600599990095776887888000007809906066500070887080099968978766665677778000 : Predator Rel


dssp          : --EEEEEEHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEE--------HHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEE------HHHHHHHHHHHHHH----EEEE---HHHHHH-----EEEEE----EE----HHHHHHHHHHHHEEHHH-EE-------HHHH-----------HHHHHHHHH-HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-HHH--HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH---HHHHHHHHH- :dssp
define        : -EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEE-----HHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE--HHHHHHHHHH-EEEEE----------HHHHHHHHHHHHH-----EEEE-----HHHHHH---EEEEE-HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHEEEEE--HHHHHHHHHH----------- :define
stride        : --EEEEEEHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE--E-----HHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEE----E-HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE---HHHHHH-----EEEEE----EE---HHHHHHHHHHHHH-EHHH-E--------HHH------------HHHHHHHHH-HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-HHH--HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH--HHH---HHH- :stride


Q3 values for 1tfr-1-GJB  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	53.36	53.36	54.06
dsc	52.30	49.12	52.30
pred	57.60	53.36	56.54
mul	57.24	55.12	59.01
nnssp	59.36	53.71	60.78
zpred	54.06	51.59	54.06
cons	55.83	54.06	56.18