Results for 1ubdc-2-AS


1ubdc-2-AS    : PRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGE : HSU37263
HSU37263      : EKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGE : I39315
I39315        : EKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGE : ZN41_HUMAN
ZN41_HUMAN    : EKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGE : F43284
F43284        : EKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTG. : A42075
A42075        : EKPYKCEECGKAFKQSSKLNEHMRAHTGE : Z138_HUMAN
Z138_HUMAN    : EKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEE : HUMZNF45
HUMZNF45      : EKPYKCEECGKGFSVGSHLQAHQISHTGE : RNU78143
RNU78143      : ....LCPECGKSFTQCSSLQKHQCRHTGE : H45193
H45193        : EKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGE : HUMZIFI
HUMZIFI       : EKPYKCNECGKAFSQSAYLLNHQRIHTGE : ZN91_HUMAN
ZN91_HUMAN    : EKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGE : ZN22_HUMAN
ZN22_HUMAN    : ...YQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGE : ZN81_HUMAN
ZN81_HUMAN    : ERHHKCSECGKAFTQKSTLRMHQRIHTGE : ZN39_HUMAN
ZN39_HUMAN    : KKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGE : A43284
A43284        : EKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGE : RNU78142
RNU78142      : ....LCPGCGKSFTNSSNLTKHR.THTGE : I39314
I39314        : EKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGE : ZN31_HUMAN
ZN31_HUMAN    : EKPYECAECGKSFSKSSTLANHQRTHTGE : XMU12777
XMU12777      : NFAHVCVECAKAFRHPSELKKHMRTHTGE : S65086
S65086        : EKPFTCTECGKSFTEKSHLRSHNKIHTGE : S43826
S43826        : EKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGE : ZN36_HUMAN
ZN36_HUMAN    : EKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGE : ZK23_HUMAN
ZK23_HUMAN    : ERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGE : KRXC_MOUSE
KRXC_MOUSE    : EKPYVCQECGKAFNCSSYLSKHQRIHIGD : ZN25_HUMAN
ZN25_HUMAN    : EKPYECKECGKAFSQKSHLTVHQRMHTGE : REX1_MOUSE
REX1_MOUSE    : PRRHVCAECGKAFTESSKLKRHFLVHTGE : HSHOK2EX2
HSHOK2EX2     : EKPYKCDKCGKGFSQSSKLHIHQRVHTGE : ZO14_XENLA
ZO14_XENLA    : EKPHKCTECGKQFLQKNKLDRHHLSHTGV : HSKRZNFC
HSKRZNFC      : EKPFKCHECGKIFIHKSNLIKHQRTHTGE : I51699
I51699        : EKPFICSQCGKSYSQSSNLIKHQMIHTGV : Z11B_HUMAN
Z11B_HUMAN    : EKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGE : RNU78112
RNU78112      : ....LCPECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQ : ZF35_MOUSE
ZF35_MOUSE    : EKPYKCDECGKAFSQSSDLMIHQRIHTGE : GGU14555
GGU14555      : EAKYRCDDCGKLFTTSGNLKRHQLVHSGE : ZN19_HUMAN
ZN19_HUMAN    : EKPYECNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGE : B60191
B60191        : ARAHACPECGKTFATSSGLKQHKHIHSSV : MUSK1ZF
MUSK1ZF       : EKPYRCSECGKGFTSISRLNRHRIIHTGE : RNU78131
RNU78131      : EKPYECTECGKGFSLASSLRTHQRIHTGE : S37482
S37482        : EKPYRCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGE : S70007
S70007        : EKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVE : ZN12_MICSA
ZN12_MICSA    : ERPYVCSECGKGFSRGSELKKHSMNHTGV : ZFY1_MOUSE
ZFY1_MOUSE    : KFPHICGECGKGFRHPSALKKHIRVHTGE : ZN07_HUMAN
ZN07_HUMAN    : EKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGE : CELF47E1
CELF47E1      : HRPHVCSVCQKSFSQSSSLNKHLRVHSGE : ZN35_HUMAN
ZN35_HUMAN    : EKPFECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQ : ZN84_HUMAN
ZN84_HUMAN    : EKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGE : ZN21_HUMAN
ZN21_HUMAN    : EKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGE : HSU71363
HSU71363      : VRPYKCGECGKSYISKGHLRIHQRMHTGE : I38941
I38941        : SRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGE : Z134_HUMAN
Z134_HUMAN    : ERPFVCSKCGKDFIRTSHLVRHQRVHTGE : ZN17_HUMAN
ZN17_HUMAN    : ERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGE : HSU38904
HSU38904      : ERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGE : I50620
I50620        : ERPYVCSACGKAFTQSTNLRQHQRTHTGE : ZF64_HUMAN
ZF64_HUMAN    : ERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGE : SPU19831
SPU19831      : ERLHQCDECTKSFTRASNLRSHMRTHTGE : ZO2_XENLA
ZO2_XENLA     : DRPFSCAECGKAFSGKAQLQDHQNTHTGE : ZG7_XENLA
ZG7_XENLA     : ERPYICTECGKTFPRKKNLQSHQTVHTQE : ZG62_XENLA
ZG62_XENLA    : ERPFICTECGKSFSDKSRLRVHHRSHTGE : ZG49_XENLA
ZG49_XENLA    : ERPFSCSECGKSFSHKNKLTLHQKIHTGE : S51037
S51037        : EKPFSCSECGKSFFYKSVLKDHLVVHTGE : ZN18_HUMAN
ZN18_HUMAN    : EKPCKCDYCGKGFSDFSGLRHHEKIHTGE : RNU78127
RNU78127      : ERPYKCDDCGKSLRRNSHLQMHQQTHTGE : JH0500
JH0500        : EKYYKCDECGKSFSDGSNFSRHQTTHTGE : SSC24D11
SSC24D11      : ERXYECGECGKSFSHSSTLNQHQRIHTGA : Z37A_HUMAN
Z37A_HUMAN    : ERPYGCHECGKSFSEKSTLTQHQRTHTGE : RNU78130
RNU78130      : EKPHECKECGKTFRLYSFLSQHQRIHTGE : ZF14_MOUSE
ZF14_MOUSE    : ERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGE : I48668
I48668        : EIHYECKECGKSFIELSHLKRHYRIHTGE : A48830
A48830        : EKAYICAECNKCFIQKSQLKTHQRIHTGE : MMU29505
MMU29505      : ERSYKCEECGKSFNYSSSLKQHQRIHTGE : A48927
A48927        : KKSHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGE : S47067
S47067        : ERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGE : ZN44_HUMAN
ZN44_HUMAN    : EKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGE : MMU29512
MMU29512      : EKHYVCKQCGKAFIRSSQLLIHERIHTGE : Z136_HUMAN
Z136_HUMAN    : EKPYVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGE : ZN10_HUMAN
ZN10_HUMAN    : DKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGH : XFIN_XENLA
XFIN_XENLA    : EKPYPCTQCGKSFIQNSDLVKHQRIHTGE : RNU41164
RNU41164      : EKPYECTQCGKSFIQSYKLIAHQKIHSGE : MUSZFP7
MUSZFP7       : EKPYICNHCGKAFPSRGSLRRHDRIHSGE : A46017
A46017        : EKPYICKECGKTFRASSHLQKHVRIHTGE : RNU78146
RNU78146      : EKPIQCIECGKAFRDNSSFARHRKMHTGE : ZN23_HUMAN
ZN23_HUMAN    : EKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGE : S47072
S47072        : EKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGE : HSU52098
HSU52098      : EKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGE : RNU78129
RNU78129      : EKPYKCSECGKAFSVRSSLTAHQVIHTGE : S47068
S47068        : EKPYKCDTCGKPFSQRSNLQVHQIIHTGE : RNU78133
RNU78133      : EKPYECSECGKAFSQSSALTVHIRSHTGE : S47073
S47073        : EKPYKCKECGKAFPYSSHLIRHYRIHTGE : ZN26_HUMAN
ZN26_HUMAN    : EKPFKCSECGKAFTQKSSLSEHQRVHTGE : ZN27_HUMAN
ZN27_HUMAN    : EKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGE : HSU57796
HSU57796      : EKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGE : RNU56732
RNU56732      : GKPYLCVDCGKSFRQKATLTRHHKTHTGE : HSU71598
HSU71598      : ERPYVCQDCGKGFVQSSSLTQHQRVHSGE : ZN29_HUMAN
ZN29_HUMAN    : EKPYTCKDCRKAFSQSSSLTQHQRVHTGK : ZN20_HUMAN
ZN20_HUMAN    : VNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGE : ZN42_HUMAN
ZN42_HUMAN    : ERPFVCSECGRSFSRSSHLLRHQLTHTEE : ZO28_XENLA
ZO28_XENLA    : DRPYTCAECGKSFIRMSKLTVHRRTHTGE : MLZ4_MOUSE
MLZ4_MOUSE    : IRYHICSQCGKAFSQISDLNRHQKTHTGD : SSC6G04
SSC6G04       : HKPHKCPECGKAFSVSSKLALHRKTHLGE : MUSZFPKRAB
MUSZFPKRAB    : EKPFKCDACGKSFSRSSHLRSHQRVHTGE : HKR2_HUMAN
HKR2_HUMAN    : EKPYMCGHCGKCFRESSSLAKHQRVHTGE : HSU66561
HSU66561      : DKPYKCDQCGKGFIEGPSLTRHQRIHTGE : A42825
A42825        : EKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGE : ZN12_HUMAN
ZN12_HUMAN    : ...YKCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGE : S47071
S47071        : EKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGE : ZG64_XENLA
ZG64_XENLA    : EKPFMCTQCGKCFRQKKALRRHQFIHTGE : ZG46_XENLA
ZG46_XENLA    : EKPFICSECGKRFSRKDGLGMHQLIHTGE : HSHZF4
HSHZF4        : QKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGE : Z133_HUMAN
Z133_HUMAN    : EKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGE : G45193
G45193        : EKPYECNACGEAFIRSKSLARHQVLHTGK : HSU71600
HSU71600      : EKPHECRDCGKAFKTRNRLCMHQLIHTGE : S47069
S47069        : EKPYECLQCGKAFTRMSGLTRHQWIHTGE : D42825
D42825        : KKPHECDLCGKAFCHRSHLIRHQRIHTGK : ZF33_MOUSE
ZF33_MOUSE    : YKPYGCSLCGKAFYRKSHLGRHQKIHTGE : A45194
A45194        : QKPYKCEECGKALIQFSTLTRHKRIHTGE : E42075
E42075        : EKFYKCEECGKGFWNSSALTKHKRIHTGE : S68858
S68858        : VKPFQCKECGRAFVRSTGLRIHERIHTGE : MMU47104
MMU47104      : QKPYICKECGKAFKGVSQVIHHQLIHRGD : D40984
D40984        : EKPYKCKDCDISFIQISNLRRHQRVHTGE : C40984
C40984        : EKPYKCMEWDRSYIQYSHLKRHQKVHTGE : HSU68536
HSU68536      : KKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGE : RNU78144
RNU78144      : ..SVLCKECGRAFIQMSNLIRHQRILTGE : HSZNF169S2
HSZNF169S2    : QKHHVCPECGRGFCQRSDLIKHQRTHTGE : HSZPHSAL1
HSZPHSAL1     : PKQHYCNTCGKTFSSSSALQIHERTHTGE : I48689
I48689        : RKHHECADCGKTFLWRTQLTEHQRIHTGE : HSU71601
HSU71601      : GRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGE : KR2_MOUSE
KR2_MOUSE     : KKVYGCDECGKTFRQSSSLLKHQRIHTGE : MMU46186
MMU46186      : RKRYWCHECGKGFRQSSALQTHQRVHTGE : RNU78119
RNU78119      : ....ALPECGKSFRESSHLIRHQKIHLGE : RNU78125
RNU78125      : ....LCPECGKSFRRASHLSQHHTIHTGE : RNU78122
RNU78122      : ....ALPECGKSFTQNSTLSQHQRIHTGE : RNU78120
RNU78120      : ....LCPECGKSFTKCSSLRTHQKIHTGE : RNU78123
RNU78123      : ....LCPECGKSFSQSMNLTVHQRTHTGE : RNU78116
RNU78116      : ....LCPECGKSFLYPSLLQMHERTHTGE : RNU78145
RNU78145      : ....ACPECGKSFSKTSQLKAHSRIHTGE : RNU78124
RNU78124      : ....LCPECGKSFNYPSQLKSHYQIHTGE : Z139_HUMAN
Z139_HUMAN    : TKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGE : Z165_HUMAN
Z165_HUMAN    : DKTHQCNECGKAFRHSSKLARHQRIHTGE : A44391
A44391        : SKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGE : ZKR1_CHICK
ZKR1_CHICK    : DRPHRCGDCGKGFVWASHLERHRRVHTGE : I39152
I39152        : KKPYKCDDCGKSFTWNSELKRHKRVHTGE : Z140_HUMAN
Z140_HUMAN    : EKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGK : ZN30_HUMAN
ZN30_HUMAN    : ...YECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGK : ZN16_HUMAN
ZN16_HUMAN    : ...HVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGE : Z132_HUMAN
Z132_HUMAN    : EIPHVCKECGKAFSHSSKLRKHQKFHTEV : I43284
I43284        : EKPYTCKQCGKAVLSSWKLSRHMIMHSGD : KRUH_DROME
KRUH_DROME    : ERPYKCDVCGRAFEHSGKLHRHMRIHTGE : ZG32_XENLA
ZG32_XENLA    : EKSFDCTECGKSFKRKSKLKTHFLCHTGE : ZG57_XENLA
ZG57_XENLA    : GKSYTCTECGKGFIKKSRLVTHMKIHTGE : ZO15_XENLA
ZO15_XENLA    : EKPFICTECGKGFSAKSQLHRHHVIHTGD : ZO26_XENLA
ZO26_XENLA    : EKRFTCTECGKIFTRKSNLRKHQRIHTGD : ZG66_XENLA
ZG66_XENLA    : GKTFFCSECGKYFLYQSQLVRHQRTHTGE : ZO72_XENLA
ZO72_XENLA    : EKLSSCSECGKYFLNCWSLARHHRTHTGE : ZO71_XENLA
ZO71_XENLA    : EKAFSCSECGKCFTNRSQLSRHQMIHTGE : ZG17_XENLA
ZG17_XENLA    : EKSISCSECGKCFIKSSELTVHQMTHIGE : ZG48_XENLA
ZG48_XENLA    : EEPFVCSECGKSFAQSPQLDLHMRIHTGE : XMU43113
XMU43113      : .....CGTCGKSYADSRTLTKHMRIHTGE : ZG9_XENLA
ZG9_XENLA     : EKPFICSDCGKCFNDSSILIRHMKIHTGE : ZO61_XENLA
ZO61_XENLA    : EKPFACSECGKCFAQNSHLTQHRLGHTGE : RNU78114
RNU78114      : CRIRLCPECGKRLLN.VQAQKHQVIHTGE : CF2_DROME
CF2_DROME     : ERPYTCSYCGKSFTQSNTLKQHTRIHTGE : 

              : 322-------332-------342------ :
OrigSeq       : PRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGE :OrigSeq
cons          : -------------------HHHH------ :cons
dsc           : ----------------HHHHHHH------ :dsc
mul           : ------------H-----HHHH-H----- :mul
nnssp         : ---------------------EEEEE--- :nnssp
phd           : -------------------HHH------- :phd
pred          : ----------------HHHHHHHH----- :pred
zpred         : -----HH----HHH----HHHHE------ :zpred

access        : EEE-EBEEBBEEBBEBBEBBE-BEB-EEE : access

PHD Rel       : 99812564567334244331312213789 : PHD Rel
Pred Rel      : 00999999999077777876667777000 : Predator Rel

dssp          : ---EE------EE--HHHHHHHHHH---- :dssp
define        : --EEEE---EEEEEHHHHHHHHHHHHHH- :define
stride        : ---EE------EEE-HHHHHHHHHH---- :stride

Q3 values for 1ubdc-2-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	62.07	31.03	58.62
dsc	75.86	44.83	72.41
pred	79.31	48.28	75.86
mul	68.97	37.93	65.52
nnssp	48.28	20.69	44.83
zpred	55.17	31.03	55.17
cons	65.52	34.48	62.07