Results for 1zymb-2-AUTO.1


1zymb-2-AUTO.1    : KEDEIVIDRKKISADQVDQEVERFLSGRAKASAQLETIKTKAGETFGEEKEAIFEGHIMLLEDEELEQEIIALIKDKHMTADAAAHEVIEGQASALEELDDEYLKERAADVRDIGKRLLRNILGLKII : PT1_MYCGE
PT1_MYCGE         : QTPQFDVKKYTNVKMTPTQAKKLLSSAFQKAKKDLEEIKTITVKNINQEAGMIFDAHIQILNDPTITEQLEQQLN.KNIHPVIAVDNVFQQTALMFSEMDDKYFKERASDILDLHQRLLSYLTGVKLN : PT1_STAAU
PT1_STAAU         : VEPDLTFDKN.EKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELP : PT1_STRSL
PT1_STRSL         : VQPDLSFET..VTVEDTSAEEARLDAALAASQDELSVIREKAVESLGEEAAAVFDAHLMVLADPEMTGQIKETIRAKQVNAEAALTEVTDMFIAIFEGMEDPYMQERAADIRDVTKRVLANLLGKKLP : PT1_SALTY
PT1_SALTY         : KEDEIVIDRKKISADKVDQEVERFLSGRAKASAQLEAIKTKAGETFGEEKEAIFEGHIMLLEDEELEQEIIALIKDKHMTADAAAHEVIEGQATALEELDDEYLKERAADVRDIGKRLLRNILGLAII : PCU43145
PCU43145          : KEYEVKIEEL.EKELKLEKE.KQINKEYEKELNEKSEFIKRQMELLKEKELNINLKENKINNKEIIREEKLNDIESEYIEKNKEKEKLNYEVTNIKMSLDKCEVQEKKDNLEKINKKVIEKENNLREL : PT1_MYCCA
PT1_MYCCA         : KETKLDIQK..QLISDVDQEIIKLEQAIEKSIADLKKIQQITLKKLGEEKAAIFDAHQDIANDPAIKEEVVELIKKEKVNAEYALFTVSNNYFEMFSQLEDPYFKERSADIKDVSLRIISHILGLEIH : LSU823662
LSU823662         : VQPDLSFSK..STISDSEKEINRLHKALQDSTSDLETIRKIAAESLGEEEAQVFDAHMMILADPEFTGAIEGKINDDKVNAEQALKEVADLFVATFESMTNAYMQERAADIKDVTKRVLSHLLGVTLP : PT1_BACST
PT1_BACST         : ETPDLAAEK..RTVADVEAEIARLEAAVAKAKEELEAIKQHALEKLGEDKAAIFAAHLLVLDDPELLNPIKEKIQTERVNAEYALDETALFFISMFEAMDNEYMKERAADIRDVTKRVLAHLLGVTIS : PT1_BACSU
PT1_BACSU         : EEPDLTVEK..KNISDSEAEVSRFDEAIARSKEELEKIKEHALKELG....................QPVKEKISTDSVNAEFALKETSSMFVTMFESMDNEYMKERAADIRDVTKRVTGHLLGVEIP : PT1_HAEIN
PT1_HAEIN         : KEEKIVLDTQKITDDQIDAEVARFYEGRNAAVEQLNSIRERALISLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEILDYLRSNKVNAGVAASKILDQQVTMLSEIDDEYLKERAGDIRDIANRLVKNILGMYIV : PTF1_RHOCA
PTF1_RHOCA        : ARDEVVFDT...DAADAAFETDRLDTALQTAWHELEELHDEVWKTSGPARAAIFRAHQEFLHDPEMVAEAKALIG.QGRSAGFAWHRVFSDRADMLGAMKDAVLSGRAIDLRDAGQRVLQHLGRVRTG : PTF1_XANCP
PTF1_XANCP        : RAAQTEVADQPIGLGDGG...VLLHDALTRTRQQLAAIQDDTQRRLGASDAAIFKAQAELLNDTDLITRTCQLMV.EGHGVAWSWHQAVEQIASGLAALGNPVLAGRAADLRDVGRRVLAQLDAAAAG : ECAE0002183
ECAE0002183       : QPVLCTVQA..KSTLTVEEEQDRLRQAIDFTLLDLMTLTAKAEASGLDDIAAIFSGHHTLLDDPELLAAASELLQHEHCTAEYAWQQVLKELSQQYQQLDDEYLQARYIDVDDLLHRTLVHLTQTKEE : PT1_ALCEU
PT1_ALCEU         : APAALDVSHYLVDEDQLDAEVERLRAARAAVRAELAALKRDLPRDAPEELGAFLDVHAMILDDEALAREPEALIRGRRYNAEWALTTRLEELMHQFDEIEDEYLRERKTDIRQVVERILKALAGAPVL : PT1P_ECOLI
PT1P_ECOLI        : ATLPLMEQVYQASTLDPALERERLTGALEEAANEFRRYSKRFAAGAQKETAAIFDLYSHLLSDTRLRRELFAEVD.KGSVAEWAVKTVIEKFAEQFAALSDNYLKERAGDLRALGQRLLFHLDDANQG : MOX2_XENLA

                  : 20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90--------100-------110-------120-------130-------140----- :
OrigSeq           : KEDEIVIDRKKISADQVDQEVERFLSGRAKASAQLETIKTKAGETFGEEKEAIFEGHIMLLEDEELEQEIIALIKDKHMTADAAAHEVIEGQASALEELDDEYLKERAADVRDIGKRLLRNILGLKII :OrigSeq
cons              : ----EEHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :cons
dsc               : ---HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :dsc
mul               : --HHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- :mul
nnssp             : ---EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :nnssp
phd               : ----EE---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :phd
pred              : ------HHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred             : HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE--EEE :zpred


access            : EEEEBBBEEEEEEBEEBEEEBEEBEEBBEEBEEEBEEBEEEBBEEBEEEEBBBBEBBBBBBEEEEBEEEBEE-BEEEEBBBEBBBEEBBEEBBEBBEEBEEE-BEE-BBEBEEBBEEBBBBBBBBEBE : access

PHD Rel           : 99631123334321217999999999999999999999999999764889999999997424759899999999731112899999999999999999758999999976999999999999413579 : PHD Rel
Pred Rel          : 00766606755577677989999999999999999999999888666688999979876708668899999987766676888888888988980788666788999955888778879886666000 : Predator Rel


dssp              : ----------E-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH---E-HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :dssp
define            : EEEEEEEEEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE :define
stride            : ----------E----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH--E-HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :stride


Q3 values for 1zymb-2-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	87.50	78.91	90.62
dsc	79.69	76.56	82.81
pred	80.47	78.91	83.59
mul	82.03	79.69	86.72
nnssp	85.16	82.81	88.28
zpred	71.88	75.00	76.56
cons	85.16	78.91	88.28