Results for 2gsq-2-AS


2gsq-2-AS     : LDGKTSLEKYRVDEITETLQDIFNDVVKIKFAPEAAKEAVQQNYEKSCKRLAPFLEGLLVSNGGGDGFFVGNSMTLADLHCYVALEVPLKHTPELLKDCPKIVALRKRVAE : SC2_OCTDO
SC2_OCTDO     : FHGKNNMEMARVEYISDCFYDILDDYLRMYQDDNCRMMFKRTRYQETLRRILPFMERTLEMYKSGGQFFMGDQMTMADMMCYCALENPIMEESSLLNSYPKLQALRTRVMS : BTU49179
BTU49179      : LYGKDMKERALIDMYSEGVADLGEMIMHFPLCPPAEKDALTLIREKTTNRYLPAFENVLKSH..GQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDPSLLANFPLLKALKARVSS : SC1_OCTVU
SC1_OCTVU     : FHGRNNMEMARVDFISDCFYDILDDYMRMYQDGNCRMMFKRMRFQETCRRILPFMERTLEMYNGGSQYFMGDQMTMADMMCYCALENPLMEEPSMLSSYPKLMALRNRVMN : GTA1_RABIT
GTA1_RABIT    : LYGKDMKERALIDMYTEGVADLYELVLLLPLCPPEQKDAVDFIKEKIRTRYFPAFEKVLKSH..GQDYLVGNRLSKADILLVELLYNVEELDPSAIASFPLLKALKTRISS : LOU19290
LOU19290      : FYGKNNMDMFRIDYICDCFYEIMHDYMRYFHTKNGRFGQMQGRYMDTCRRVLPFMERTLESRNSGSQFFMGDQMTLCDMMCYCCMENPMMENQSMFTNYPKLMALWKRVAA : LOU19255
LOU19255      : FHGKNNVDMFKVDSICDSLFELFNDYMTLFNEKDAAKKPLQKRYMDTCRRVLPYLEKTLEANKGGSGWFIGDQMLFCDMMCYAGLENPVQENPNFLKDYPKLAGLRNRVAA : GTA3_RAT
GTA3_RAT      : LYGKDLKERVRIDMYADGTQDLMMMIIGAPFKAPQEKEELALAVKRAKNRYFPVFEKILKDH..GEAFLVGNQLSWADIQLLEAILMVEEVSAPVLSDFPLLQAFKTRISN : GTA1_RAT
GTA1_RAT      : LYGKDMKERALIDMYTEGILDLTEMIMQLVICPPDQKEATALAKDRTKNRYLPAFEKVLKSH..GQDYLVGNKLTRVDIHLLELLLYVEEFDASLLTSFPLLKAFKSRISS : CEF37B18
CEF37B18      : FAGKT.EEEAWVDAVVDLFKDFLSEFKHYASLNGKSADERTEIAIPARNVYFKNLNDLLKRS..KSGFLIGDGITFADIVVTNYLETLKTFELYNGSDEPKLVALQKKVYE : CELF11G1110
CELF11G1110   : IAGQNDTEAAEVDAIADQFKDYLNDVSPTVLAGFKPGDKRTDVFVPAFKKNFEFFENILASN..HSGFFVGNSLTWVDLLISQHVQDILDKDLAVVEEFKKVLAHRKKVQS : JX0294
JX0294        : LYGKDTKERLLIDMYTEGMTDLYELFFKVILAPPEEKDAKSLIKDRAKNRFLPAFEKVLKSH..GQGYLVGNKLSKADILLTELLYMVEEFDASLLANFTLLQALKTRVSN : SC20_OMMSL
SC20_OMMSL    : YYGKNNMDMFRIDYICDCFYEILHDYMRYFHTKNGRFMQIQNRYLDTCRRILSFLERTLEMRNGGKEFFMGDQMMLCDMMCYCCLENPMLEDQTTFNNFPKLMSLWKRVAS : SC4_OCTDO
SC4_OCTDO     : FHGKNNMDMARVDYISDSFYDILDDYMRMYHDKDGRMMFKRMRYQETCRRIFPYLEKTLEMRNGGNQFFMGDQITMADMMCFCALENPLMEDQNILRSYPKLQALRNRVIN : SC18_OMMSL
SC18_OMMSL    : MVEPPQKLSPELESQSSLCSERPQCGPPMMGSDFERLSFMRRRYDETCRRVLPFLEGTLKQRYGGDRYFMGEYMTMCDLMCYCALENPLLDNAYLLHPYPKLRGLRDRVSR : SC04_OMMSL
SC04_OMMSL    : YRSDNTDDSCQAEDRRGGHSDSHRIDISSEESASRRSRNMRLRYMETCRRVLPFMERTLEMQHGGDTFFCGDEMMLCDMMCYCALENPLMENASFFGQYPKLMALRERVAS : GLNA_AZOVI

              : 76--------86--------96--------106-------116-------126-------136-------146-------156-------166-------176-------1 :
OrigSeq       : LDGKTSLEKYRVDEITETLQDIFNDVVKIKFAPEAAKEAVQQNYEKSCKRLAPFLEGLLVSNGGGDGFFVGNSMTLADLHCYVALEVPLKHTPELLKDCPKIVALRKRVAE :OrigSeq
cons          : -------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEE---HHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHH-- :cons
dsc           : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul           : -------HHHHHHH-----HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH----E--HHHHHHH-------EEE----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH---HHHHHHHHHH-- :mul
nnssp         : -------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEE---HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHH :nnssp
phd           : -------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEE-----HHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHH-- :phd
pred          : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHH--- :pred
zpred         : H-----HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHE------HHHHHHHHHH---------HHHHHHH------EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE- :zpred


access        : EEEEE-EEBB-BEBBBEBBBEBBEBBBEBBB-EEEEEEBBEBB-EEBBEEBBEBBEEBBEB-EEEEBBBBBEEBBBBBBBBBBBBE-BEEEEBEBBEEBEEBEBBEEEBEE : access

PHD Rel       : 999974215678899999999999976533226211448998877889989899999999946895167323222357899875531111151121233689999998369 : PHD Rel
Pred Rel      : 007777779777887777788887887655890777777888787777885887788776879999758789765788888888655958999688897668997777000 : Predator Rel


dssp          : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH- :dssp
define        : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH :define
stride        : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH :stride


Q3 values for 2gsq-2-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	85.59	81.08	85.59
dsc	76.58	74.77	76.58
pred	90.09	85.59	90.09
mul	79.28	69.37	77.48
nnssp	87.39	81.98	89.19
zpred	67.57	64.86	65.77
cons	85.59	80.18	85.59