Results for 2pgd-2-AUTO.1


2pgd-2-AUTO.1    : VKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGLGHKEMAKAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFQDADGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQNIPFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPGLQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAISTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYRH : 6PGD_BACSU
6PGD_BACSU       : TKMVHNGIEYADMQLIAEAYTFLRETLRLPLDEIASIFETWNQGELKSYLIEITAEILRKKDEKTQPLIDVILDKTGQKGTGKWTSMQAIDNGIPSTIITESLFARYLSSLKEERMAAQDVLAGP.AEEKHLDKDTWIEYVRQALYMGKVCAYAQGFAQYKMSSELYGWNLPLKDIALIFRGGCIIRADFLNVISEAFSEQPNLANLLIAPYFTDKLHAYQTGLRKVVCEGISTGISFPCLTTALSYYDGYRT : 6PGD_CERCA
6PGD_CERCA       : VKMVHNGIEYGDMQLICEAYQIMK.ALGLSQAEMATEFEKWNSEELDSFLIEITRDILNYQDDRG.YLLERIRDTAGQKGTGKWTAISALQYGVPVTLIGEAVFSRCLSALKDERVAASKQLKGPNVNAKVEDLPKFLNHIKHALYCSKIVSYAQGFMLMREAAKENNWNLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGNIKDAYTRNPQLSNLLLDDFFKKAIEVGQNSWRQVVANAFLWGIPVPALSTALSFYDGYRT : ECU14430
ECU14430         : VKMVHNGIEYGDMQLIAEAYSLLKHGLNLSNPELAETFTEWNKGELSSYLIDITKDIFTKKDENGIYLVDVILDEAANKGTGKWTSQSSLDLGEPLSLITESVFARYISSLKEQRVAASKVLSGP.VKPFTGDKAEFVEKVRRALYLGKIVSYAQGFSQLRAASEENNWNLNYGEIAKIFRAGCIIRAQFLQKITDAYAENPSIANLLLAPYFKKAADDYQQALRDVVAYAVQNGISTPTFSAAIAYYDSYRA : SYOPGD
SYOPGD           : VKMVHNGIEYGDMQLIAEAYDLLKSVAGLNASELHDVFAAWNKTELDSFLIEITADIFTKVDDLTQPLVELILDAAGQKGTGRWTVETALEIGVAIPTIIAAVNARILSSIKAERQAASEILS..ITEPFSGDRQAFIDSVRDALYCSKICSYAQGMALLAKASQVYNYGLNLGELARIWKGGCIIRAGFLNKIKQAYDADPTLANLLLAPEFRQTILDRQLAWRRVIAIAAERGIPVPAFSASLDYFDSYR. : 6PGD_YEAST
6PGD_YEAST       : VKMVHNGIEYGDMQLICEAYDIMKRLGGFTDKEISDVFAKWNNGVLDSFLVEITRDILKFDDVDGKPLVEKIMDTAGQKGTGKWTAINALDLGMPVTLIGEAVFARCLSALKNERIRASKVLPGPE.VPKDAVKEQFVDDLEQALYASKIISYAQGFMLIREAAATYGWKLNNPAIALMWRGGCIIRSVFLGQITKAYREEPDLENLLFNKFFADAVTKAQSGWRKSIALATTYGIPTPAFSTALSFYDGYRS : 6PGD_HAEIN
6PGD_HAEIN       : VKMVHNGIEYGDMQLICEAYQFLKEGLGLSYEEMQAIFAEWKNTELDSYLIDITTDILGYKDASGEPLVEKILDTAGQKGTGKWTGINALDFGIPLTLITESVFARCVSSFKDQRVAANQLFGKT.ITPVEGDKKVWIEAVRKALLASKIISYAQGFMLIREASEQFGWDINYGATALLWREGCIIRSRFLGNIRDAYEANPNLVFLGSDSYFKGILENALSDWRKVVAKSIEVGIPMPCMASAITFLDGYTS : 6PGD_HUMAN
6PGD_HUMAN       : VKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMAQDEMAQAFEDWNKTELDSFLIEITANILKFQDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKFQFDGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYRH : A48325
A48325           : ..................................................IEITANILKFQDADGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERVQASKKLKGPQKIQFSGDKKSFLEDIRKALYASKIISYTQGFMLLRQAAAEFGWSSTT.EHRLMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPGLQNLLLDDFFKSAVEDCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRH : 6PGD_TRYBB
6PGD_TRYBB       : VKMYHNSGEYAILQIWGEVFDILR.AMGLNNDEVAAVLEDWKSKFLKSYMLDISIAAARAKDKDGSYLTEHVMDRIGSKGTGLWSAQEALEIGVPAPSLNMAVVSRQFTMYKTERQANASNAPGIGYTLKNKSPGPEIKQLYDSVCIAIISCYAQMFQCLREMDKVHNFGLNLPATIATFRAGCILQGYLLKPMTEAFEKNPNISNLMCA..FQTEIRAGLQNYRDMVALISKLEVSIPVLSASLNYVTAMFT : CEC06G81
CEC06G81         : VKMVHNGIEYGDMQLIAEAYHLLSKAVELNHDQMAEVLDDWNKGELESFLIEITANILKYRDEQGEPIVPKIRDSAGQKGTGKWTCFAALEYGLPVTLIGEAVFARCLSALKDERVRASKQLPRPSPDTVVQDKRVFIKQISKALYASKIVSYAQGFMLLAEASKQFNWNLNFGAIALMWRGGCIIRSRFLGDIEHAFQKNKQLSNLLLDDFFTKAITEAQDSWRVVVCAAVRLGIPVPAFSSALAFYDGYTS : D89161
D89161           : VKMVHNGIEYGDMQLICETYDIMKRGLGMSCDESTDVFEKWNTGKLDSFLIEITRDVLRYKADDGKPLVEKILDAAGQKGTGKWTAQNALEMGTPVSLITEAVFARCLSSLKSERVRASKKLTGPN.TKFTGDKKQLIDDLEDALYASKIISYAQGFMLMREAAKEYGWKLNNAGIALMWRGGCIIRSVFLKDITEAFREDPNLESILFHPFFTNGVEKAQAGWRRVVAQAAMLGIPVPATSTGLSFYDGYRS : S57786
S57786           : VKMIHNGIEYGDMQLIAEAYDVLKSVGKLTNEELQSAFTEWNKGELLSFLIEITADIFGIKDDKGGYLVDKVLDKTGMKGTGKWTVQQAAELSVPAPTIEASLDARFLSGLMDERVEAAKVFKSGILTDQQVDKKQLIDDVRKALYAAKICSYAQGMNLIRAKSAEKGWDLALGELARIWKGGCIIRAIFLDRIKQAYDRNPNLANLLVDPEFAKEIIERQTAWRRVVSLSVNSGISLPGMSASLAYFDSYRR : 6PGD_SYNY3
6PGD_SYNY3       : VKMVHNGIEYGDMQLIAEAYDILKNGLGLSNEQLHEVFGQWNQTELNSFLIEISTDIFAKKDPETGHLIDYILDAAGQKGTGRWTVMSGLELGVPIPTIYAAVNARVMSSLKEERVAASGQLS..S.KTFSGDVEAWIPKVRDALYCSKMCSYAQGMALIAKASQEFGYDVNLPEIARIWKGGCIIRAGFLDKIKKAFKDNPQLPNLLLAPEFKQSILDRQGPWREVLMLANEMGIAVPAFSSSLDYFDSYRR : LLU743221
LLU743221        : VKMVHNGIEYGDMQLIAESYDLLKRILGLSNAEIQAIFEEWNEGELDSYLIEITKEVLKRKDDEGGYIVDKILDKAGNKGTGKWTSESALDLGVPLPLITESVFARYISTYKDERVKASKVLSGP.ALDFSGDKKEVIEKIRKALYFSKIMSYAQGFAQLRKASEEFDWDLPYGTIAQIWRAGCIIRAEFLQNITDAFDKDSELENLLLDDYFVDITKRYQEAVRDVVSLAVQAGTPIPTFTSAISYYDSYRS : YQJI_BACSU
YQJI_BACSU       : VKMVHNGIEYGDMQLISESYFILKQVLGLSADELHEVFAEWNKGELDSYLIEITADIFTKKDEETKPLVDVILDKAGQKGTGKWTSQSALDLGVPLPIITESVFARFISAMKEERVKASGLLSGP.VKPVTENKEELIEAVRKALFMSKICSYAQGFAQMKAASEEYNWDLKYGEIAMIFRGGCIIRAAFLQKIKEAYDREPELDNLLLDSYFKNIVESYQGALRQVISLAVAQGVPVPSFSSALAYYDSYRT : MTCY35928
MTCY35928        : VKMVHNGIEYSDMQLIGEAYQLMRDGLGLTAPAIADVFTEWNNGDLDSYLVEITAEVLRQTDAKTKPLVDVIVDRAEQKGTGRWTVKSALDLGVPVTGIAEAVFARALSGSVGQRSAASGLASGK.GEQP.ADPATFTEDVRQALYASKIVAYAQGFNQIQAGSAEFGWDITPGDLATIWRGGCIIRAKFLNHIKEAFDASPNLASLIVAPYFRGAVESAIDSWRRVVSTAAQLGIPTPGFSSALSYYDALRT : CET25B98

                 : 182-------192-------202-------212-------222-------232-------242-------252-------262-------272-------282-------292-------302-------312-------322-------332-------342-------352-------362-------372-------382-------392-------402-------412-------422-------432 :
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cons             : --HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH-------EHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH----EEHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHH----- :cons
dsc              : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHH----- :dsc
mul              : --EE--------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH--------------------EEEEHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHEEEEEEE---HHHHHHHHH----------HHEE----EEEEHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH--HHHHHHH-------HEEE----------EEEEEE------- :mul
nnssp            : HHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH---------HHHHHH------EE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHH----EEHHHHHHHHHHHH-----HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHH----- :nnssp
phd              : --------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-------EHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH----EEEEHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH----- :phd
pred             : -----------HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-------EEE-------------HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEE------HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------- :pred
zpred            : HHE---------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH-------HHEEEHHHHH------EEEEEEE----EEEEEEEHHHHHHHHH--HHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHH---------EEEEH---EEEEEEHH--HHHHH-----HHEEEHHHHHHHHHH-----HEEEEEEEE--EEEEEEEEEEEEEE----- :zpred


access           : BEBBBEBBEBBEBEBBBEBBEBBEEBBEBBBEEBBEBBEE-EEEEBEBBBBEBBBEBBEEEEEEEEEBBEEBBEEBEEEEEEEBBBBBBBEBBBEBBBBBEBBBBEBBBEBEEEEBEBBEEBEEEEBEE-EEEEEEBBEEB-EBBBBBEBBBBBEBBBBBEEBBEEBBBEBEBBBBBBBBEBBBBBBBBBBEEBEEBBEEEEEBBBBBBEE-BEEBBEEB-EEBEEBBBBBBEBBBEBEBBBBBBBBBEB-EE : access

PHD Rel          : 9552366526878999999999999715783999999998511136799999999999632888874247888763346875211357765599622146789999999999899998643488987668887148999999999988999999999999999997323355115655640364134057879999981382377764323679999999999999976646427657512212432113589 : PHD Rel
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dssp             : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH------EHHHHHHHHHHH-E-----E-HHH---------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH--------E-HHHHHHHHHHH------HHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH- :dssp
define           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH------------EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH :define
stride           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----EHHHHHHHHHHH-E-----E-HHH---------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-------EHHHHHHHHHHHH------HHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH- :stride


Q3 values for 2pgd-2-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	79.84	67.98	81.03
dsc	74.70	67.98	76.68
pred	75.49	64.82	76.28
mul	58.50	47.04	58.89
nnssp	76.28	65.61	78.26
zpred	56.52	46.25	55.73
cons	79.84	69.17	81.82