Results for 2scpb-1-DOMAK


2scpb-1-DOMAK    : SDLWVQKMKTYFNRIDFDKDGAITRMDFESMAERFAKESEMKAEHAKVLMDSLTGVWDNFLTAVAGGKGIDETTFINSMKEMVKNPEAKSVVEGPLPLFFRAVDTNEDNNISRDEYGIFFGMLGLDKTMAPASFDAIDTNNDGLLSLEEFVIAGSDFFMNDGDSTNKVFWGPLV : SCP1_BRALA
SCP1_BRALA       : QKQKIKFTFDFFLDYN..KDGSIQWEDFE.EMIKYKEVNSLSDADYKSMQASLEDEWRDLKGRADINDDVSWEEYLAMWEKTIACKSVADLPWCRIPFLFKGMDVSGDGIVDLEEFQNYCKNFQLQCDVPAVY.NVITDGGKVTFDLNRYKELYYRLLTSPAADAGNTLMGQKP : RNU39875
RNU39875         : DEELEEIKKETGFSHSTRLYSRFTSLDGETLSREFQRIPLAINPLGDRIINAFFSEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNQLGSIAIQEADQDGDSAISFTEFVKV...LEKVDVEQKMSIRFLH.. : D50461
D50461           : HQEVFLGKDMDGFDEDPRLMVIFSKVDTDIKEMQWIMEKEHFQEAVKENKLHFRAVGDGHVSWDEYKKGDEETQEVLGTEDEFLFLHPEHSRMLMVKEIFRDLDQDGDKQLSLPEFISLVGTVENQQWVKDRKEELIDSNHDGIVTMEELENY..MDPMNEYNALNEAKQMI.. : SCP_PATYE
SCP_PATYE        : VSKWKIWYKSLDVNHD....GIISIENVE.ESRNFTDLHKLVGDKSTGVKVDMQKWWDTYIFLTPGAIS..ETQFVENLGNSFKKDKAFLATMTCFNMIFDVIDTDKDRSIDLNEFIYAFAAFGHENVVRTAF.ALLKPDDDNTVPLRTVVDAWISFVTCEDASKTDVIKSAFE : A45472
A45472           : NSKWIKKYANNINKSDKTLCGALSNMRFESLAQAILFIGLTTLEERKELTDIFKKLGDGQLDKKELIEGYNILRSFKNVEEEVDILKEVDFDKNIEYSEFISVCMDKQILFSEERLRDAFNLFDTDKELANLFLGEADKNKDNMIDFDEFVNM...MHKICDNKS......... : EMCDPK
EMCDPK           : DHPWIKSTDVTAKDSIPSLESTILNIRFQTLAAALLYMGLTTNEETDELNKIFQKMGDGQLDKQELMEGYVELMKLKGIETEVEVLEAVDFDKNIEYSEFVTVAMDRRTLLSRQRLERAFEMFDSDGELATIFLAEVDRNNDGEVDFEEFQQM...LLKLCGNTAA........ : SCPA_PENSP
SCPA_PENSP       : WDNRVKYVVRYMYDID..DDGFLDKNDFE.LAVRTLIEGEFSAADYANNQKIMRNLWNEIAELADFNDGVTVDEFKMAVQKHCQGKKYSEFPAFFIANQFKAIDVNGDGKVGLDEYRLDITRSAFAEEIDDAYLTTEDDRKAGGLTLERYQDLYAQFISNPNESCSACFLFGPL : CBP_SACER
CBP_SACER        : SDRLKKRFDRWDFDGN....GALERADFE.KEAQIAEAFDAGAAEVQTLKNAFGGLFDYLAKEAGVGDGLTEEQFIRVTENLIFQGEASFNRVLVVKGTWGMCDKNADGQINADEFAAWLTALGMSKEAAEAF.NQVDTNGNGELSLDELLTAVRDFHFGRLDVELLG...... : LBP_RENRE
LBP_RENRE        : YHLRKMKTRMKRVDVT..GDGFISREDYE.LIAVIAKIAKLSAEKAEETRQEFLRV.ADQLGLAPGVIS.VEEAAVNATDSLLKKAEEKAMAVIQSLIMYDCIDTDKDGYVSLPEFKAFLQAVGPDIKAITCF.NTLDFNKNGQISRDEFLVTVNDFLFGLEETALANAFYGDL : HRU46939

                 : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91--------101-------111-------121-------131-------141-------151-------161-------171- :
OrigSeq          : SDLWVQKMKTYFNRIDFDKDGAITRMDFESMAERFAKESEMKAEHAKVLMDSLTGVWDNFLTAVAGGKGIDETTFINSMKEMVKNPEAKSVVEGPLPLFFRAVDTNEDNNISRDEYGIFFGMLGLDKTMAPASFDAIDTNNDGLLSLEEFVIAGSDFFMNDGDSTNKVFWGPLV :OrigSeq
cons             : ---HHHHHHH------------EH---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHE---------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHH----- :cons
dsc              : ---HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH--------------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-----HH---HHHHHH----- :dsc
mul              : --HHHHH---------------EHH---H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH-----HHHHHHHHH-HHHHHHHHH---H--HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHH-HHH--------HHHHHHHH---HHH-------H------- :mul
nnssp            : HHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH---------------- :nnssp
phd              : ---EEEEEE-------------EE---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHH----------HHHEEEEEEE--------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH---- :phd
pred             : ---HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH----------HHHHH------------------------ :pred
zpred            : HHHHHHHE-------------EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEHHHHHHHH------HHHHHH-------- :zpred


access           : EEEEEEE-EE---E-EEE-EEBBBE-EBEBBBBBBBEBBEBBEEEBEEBEEBBEEBBEE-BEBEEB-EEBEE--BBEEBEE-BEEEEE-EBEEBBB-BBBEBBEEEEEE-BE-EEBBBBBEBBEBEEEBBEBBBE-BEEEEEE-BEBEEBBEBBBEBBE-EEEEEBEBBB-EEE : access

PHD Rel          : 997267531210587887652022366578999999885222136689998888742113122124657514666777677651677343321101123333222787775568999999854786478999988517898885427999997555421676404678751899 : PHD Rel
Pred Rel         : 007777788887556899999865688788999999988777788078868867888788787677879777768788878885866678775558887555689999990878788788886676786888885578999990558987777576667999999656788000 : Predator Rel


dssp             : -HHHHHHHHHHHHHH------EE-HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH------EEHHHHHHHHHHH---HHH-HHHH--HHHHHHHH------EE-HHHHHHHHHH-------HHHHHHHH-------EEHHHHHHHHHHHHH-----HHHH------ :dssp
define           : HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE :define
stride           : HHHHHHHHHHHHHHH------EE-HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------E-HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-------E-HHHHHHHHHHHHH--------------- :stride


Q3 values for 2scpb-1-DOMAK  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	66.67	60.92	65.52
dsc	72.99	59.77	70.69
pred	72.41	64.37	79.89
mul	71.84	61.49	73.56
nnssp	77.01	71.84	83.91
zpred	69.54	67.24	75.29
cons	76.44	66.09	76.44