Results for 2trt-1-AUTO.1


2trt-1-AUTO.1    : ARLNRESVIDAALELLNETGIDGLTTRKLAQKLGIEQPTLYWHVKNKRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALNLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQIV : TER1_ECOLI
TER1_ECOLI       : TKLQPNTVIRAALDLLNEVGVDGLTTRKLAERLGVQQPALYWHFRNKRALLDALAEAMLAENHTHSVPRADDDWRSFLIGNARSFRQALLAYRDGARIHAGTRPGAPQMETADAQLRFLCEAGFSAGDAVNALMTISYFTVGAVLEEQAGDSDAGLSPLLRAAIDAFDEAGPDAAFEQGLAVIVDGLAKRRLVVRNVE : TER4_ECOLI
TER4_ECOLI       : ARLNRESVIDAALELLNETGIDGLTTRKLAQKLGIEQPTLYWHVKNKRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALTLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQIV : S75298
S75298           : RRLEVKSVQSNKYSIAPSTAEASTHDRILKGALKLFGTKGYEGTTTKDAQAANVAEGTLFRYFTNKVEVATAGWVEILTDLLTELSEMGSY.KAIAQVMKRRMFHLRE.NKYLLQVCFVEAQYHPELREKIQSEIIDKMTVAEAFFQTAMDRGIYFLGMFAVAGFSEQTVIDPHASPQALQEMAEGLADIFLNGVLAK : A40046
A40046           : SRLTQDRIVVTALGILDAEGLDALSMRRLAQELKTGHASLYAHVGNRDELLDLVFDIVLTEVEVP.EPEPGR.WAEQVKEMCRSLRRMFLAHRDLARIAIDRVPLGPNMVGMERTMNLLRSGGLHDELAAYGGDLLSTFVTAEALEQSSRNPGTEFPNLVHLAGPITSLDS.DRRFELGLEIIIAGLLAGAGEAADDQ : Y07H_MYCTU
Y07H_MYCTU       : QRINPEDIISGAFELAQQVSIDNLSMPLLGKHLGVGVTSIYWYFRKKDDLLNAMTDRALSKYVFATPYIEAGDWRETLRNHARSMRKTFADLCDLILIRAALSPKTARAQEMEKAIANLVTAGLSLEDAFDIYSAVSVHVRGSVVLDRLSRKSQSTPLLAHATGRGHRIGAPETNFEYGLECILDHAGRLIEQSSKAA : TER5_ECOLI
TER5_ECOLI       : ARLSLDDVISMALTLLDSEGLEGLTTRKLAQSLKIEQPTLYWHVRNKQTLMNMLSEAILAKHHTRSAPLPTESWQQFLQENALSFRKALLVHRDGARLHIGTSPTPPQFEQAEAQLRCLCDAGFSVEEALFILQSISHFTLGAVLEEQATNQIENAPPLLQEAFNIQARTSAEMAFHFGLKSLIFGFSAQLDEKKHTP : TER8_PASMU
TER8_PASMU       : AKLDKEQVIDDALILLNEVGIEGLTTRNVAQKIGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAETILQKHHHHVLPLPNETWQDFLRNNAKSFRQALLMYRDGGKIHAGTRPSESQFETSEQQLQFLCDAGFSLSQAVYALSSIAHFTLGSVLETQEHQESQKYPPLLTQAVAIMDSDNGDAAFLFVLDVMISGLETVLKSAK... : TER2_ECOLI
TER2_ECOLI       : SRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAIEMLDRHHTHFCPLEGESWQDFLRNNAKSFRCALLSHRDGAKVHLGTRPTEKQYETLENQLAFLCQQGFSLENALYALSAVGHFTLGCVLEDQEHQVAKEMPPLLRQAIELFDHQGAEPAFLFGLELIICGLEKQLKCESGS. : TER7_VIBAN
TER7_VIBAN       : TKLDKGTVIAAGLELLNEVGMDSLTTRKLAERLKVQQPALYWHFQNKRALLDALPEAMLRERHTRSLPEENEDWRVFLKENALSFRTALLSYRDGARIHAGTRPTEPNFGTAETQIRFLCAEGFCPKRAVWALRAVSHYVVGSVLEQQAS..DADPSSFLHVLFHELETDGMDAAFNFGLDSLIAGFERLRAAVLATD : TER3_ECOLI
TER3_ECOLI       : NKLQREAVIRTALELLNDVGMEGLTTRRLAERLGVQQPALYWHFKNKRALLDALAEAMLTINHTHSTPRDDDDWRSFLKGNACSFRRALLAYRDGARIHAGTRPAAPQMEKADAQLRFLCDAGFSAGDATYALMAISYFTVGAVLEQQASEADAEMPARLQSAMKIVYEGGPDAAFERGLALIIGGLEKMRLTTNDIE : A20766

                 : 2---------12--------22--------32--------42--------52--------62--------72--------82--------92--------102-------112-------122-------132-------142-------152-------171-------181-------191-------201----- :
OrigSeq          : ARLNRESVIDAALELLNETGIDGLTTRKLAQKLGIEQPTLYWHVKNKRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALNLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQIV :OrigSeq
cons             : ----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE--------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :cons
dsc              : ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE--------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul              : ------HHHHHHHHHH-H---------HHHHHH--------HH-----HHHHHHHHHHHHHH------------HHHHH---HHHHHHH-H----HHHH----------HHHHHHHHEE---------HHHHHHHEEE-----HHHHHH-H-------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :mul
nnssp            : ----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH-----EEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE--------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :nnssp
phd              : ------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :phd
pred             : -----HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHH--HHHHHHHHHHH----EEEE-------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred            : HHHHH-EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE--EEEHH---HHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHEEEE---------HHHHHHHHHEH------HHHHHHHHHEEEEEE-HHHHHHHH-------HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- :zpred


access           : EEEEEEEBBBBBBEBBEEBBBEBBEBEEBBEEBEBEBBEB-B-BEEEEBBBEBBBEBBBBE-BB-BBE-EEEEBEEBBEEBBEEB-EBBBBB-EBBEBBBEE-EEEEEBEEBEBBBEBBBEBBBEBEEBBBBBBBBBBBBBBBBBEEEEEEEEEEBBEBBEBBBEBBEEEEEEBBBEBBBEBBBEBBEEBBEBBEEEE : access

PHD Rel          : 999962257999999998323331389999994447841012455479999999999999984446788775599999999999999999987444642165789654479999999997614234899988777654445666776544432566389999888774156378998779999999999887643179 : PHD Rel
Pred Rel         : 009770878899899978689796689999999668796555556789999999999908877068999997786777767689099999876966878779999077889999999998690967677876076555665887799788787609076588888886790077877866877776666997666000 : Predator Rel


dssp             : ----HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH---HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :dssp
define           : ---HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH-HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---- :define
stride           : ----HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH---HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----- :stride


Q3 values for 2trt-1-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	86.87	87.88	86.87
dsc	82.83	81.82	82.83
pred	81.82	80.30	81.82
mul	78.79	69.70	76.77
nnssp	84.85	80.30	83.84
zpred	71.72	69.19	69.70
cons	88.38	87.37	88.38