Results for 3mddb-3-AS


3mddb-3-AS    : GAGFKIAMGTFDKTRPPVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLAEHQGISFLLADMAMKVELARLSYQRAAWEIDSGRRNTYYASIAKAYAADIANQLATDAVQVFGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTAQIQRIIIAREHIGRYK : CELT08G22
CELT08G22     : GAGFKVAMEAFDMTRPGVAAGALGLSWRCLDESAKYALERKAFGTVIANHQAVQFMLADMAVNLELARLITYKSANDVDNKVRSSYNASIAKCFAADTANQAATNAVQIFGGNGFNSEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRIVISRMLLGHFA : ACDV_BOVIN
ACDV_BOVIN    : GGGFKVAMHILNNGRFGMAAALAGTMKGIIAKAVDHAANRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMAMLQYVTESMAYMVSANMDQGSTFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGVERVLRDLRIFRIFEGTNDILRLFVALQGCMDKG : ACDM_PIG
ACDM_PIG      : GAGFKIAMGTFDKTRPSVAAGAVGLAQRALDEATKYALGRKTFGKLLAEHQGISFLLADMAMKVDLARLSYQRAAWEIDSGRRNTYYASIAKAYAADIANQLATDAVQVFGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTAQIQRIIIAREHIGRYK : CELC37A22
CELC37A22     : GRGFGYQMKQFNDERLVTVAVGLLPLQKCIDETIEYARDRLLFGKTLLDQQYIQFQLAELEAELEATRALLYRTVLARSRGDDVSMLTAMAKLKIGRLARAITDQCLQVWGGAGYLNENGISRAFRDFRLFSIGAGCDEVMMRIIHKAQSRRQL : RNU64451
RNU64451      : GHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERMQFGKRIFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLVEAGRPFIKEASMAKYYASEVAGLTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKFFRDAKIGTIYEGTSNIQLNTIAKHIDAEY. : HUMACADL
HUMACADL      : NKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHE..AKDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFD.. : D89477
D89477        : GMGFKIAMKTLDMGRIGIASKALGISQAALDCAVNYAENRRAFGVPLTKLQGIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKNFIKEPAMAKLAASEAATAITHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLKSYR : CH19HHR233
CH19HHR233    : ASSLGGPFGCLNNARYGIAWGVLGASEFCLHTARQYALDRMQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLGLHACLQLGRLKDQDKAAPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGRAITGIQA : IVD_HUMAN
IVD_HUMAN     : NKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADF. : MTCY7113
MTCY7113      : GTGFKTALATLDHTRPTIGAQAVGIAQGALDAAIAYTKDRKQFGESISTFQAVQFMLADMAMKVEAARLMVYSAAARAERGEPLGFISAASKCFASDVAMEVTTDAVQLFGGAGYTTDFPVERFMRDAKITQIYEGTNQIQRVVMSRALL.... : ACDB_BACSU
ACDB_BACSU    : GDGFHIAMANLNVGRIGIAAQALGIAEAALEHAVDYAKQRVQFGRPIAANQGISFKLADMATRAEAARHLVYHAADLHNRGLNCGKEASMAKQFASDAAVKAALDAVQIYGGYGYMKDYPVERLLRDAKVTQIYEGTNEIQRLIISKYLLGGT. : CAIA_ECOLI
CAIA_ECOLI    : GNGFNRVKEEFDHERFLVALTNYGTAMCAFEDAARYANQRVQFGEAIGRFQLIQEKFAHMAIKLNSMKNMLYEAAWKADNGTITSGDAAMCKYFCANAAFEVVDSAMQVLGGVGIAGNHRISRFWRDLRVDRVSGGSDEMQILTLGRAVLKQY. : ECAE0002647
ECAE0002647   : GMGFLNVMYNFEMERLINAARSTGFAECAFEDAARYANQRIAFGKPIGHNQMIQEKLALMAIKIDNMRNMVLKVAWQADQHQSLRTSAALAKLYCARTAMEVIDDAIQIMGGLGYTDEARVSRFWRDVRCERIGGGTDEIMIYVAGRQILKDYQ : ATU72505
ATU72505      : VNSFQDTSKVLAVSRVMVAWQPIGISMGIYDMCHRYLKERKQFGAPLAAFQLNQQKLVQMLGNVQAMFLMGWRLCKLYETGQMTPGQASLGKAWISSKARETASLGRELLGGNGILADFLVAKAFCDLEPIYTYEGTYDINTLVTGREVTGIAS : MTCY4D911
MTCY4D911     : ATGLRAPLACLSEARYGIVWGAMGAARSAWQCALDYARQRTQFGRPIAGFQLTQAKLVDMAVELHKGQLLSLHLGRLKDRVGLRPDQVSFGKLNNTREALKICRTARTILGGNGISLEYPVIRHMVNLESVLTYEGTPEMHQLVLGQAFTGLAA : CEF54D55
CEF54D55      : AEGLQGPFGCLNNARLGIAWGALGAAEECFHLARQYTLDRQQFGRPLAQNQLMQLKMADMLTEISLGLQGCLRVSRLKDEGKVQSEQISIIKRNSCGKALEVARKARDMLGGNGIVDEYHIMRHMVNLETVNTYEGTHDVHALILGRAITGLNG : Y07A_MYCTU
Y07A_MYCTU    : GTGLAAISWGLAHERMSIAGQIAASCQRAIGITLARMMSRRQFGQTLFEHQALRLRMADLQARVDLLRYALHGIAEQGR...LELRTAAAVKVTAARLGEEVISECMHIFGGAGLVDETTLGKWWRDMKLARVGGGTDEVLWELVAAGMTPDHD : MTCI54
MTCI54        : GQAFMIAQTRLGGGRIHHAMRTIALARRAFDMMCERALSRQTRHGRLADLQMTQEKIADSWIQIEQFRLLVLRTAWLIDHHDYVRRDIAAVKVAMPQVLHDVVQRAMHLHGALGVSDEMPFVKMMLAAESLGIADGATELHKMTVARRTLREYQ : MTCI527
MTCI527       : GSGFAIAQARLGPGRIHHCMRALGAAERALALMVNRVRNRVAFGRPLAEQGVVQQAIAQSRNEIDQARLLCEKAAWTIDQHGNARHLVAMIKAVAPRVACDVIDRAIQVHGAAGVSDDTPLARLYGWHRAMRIFDGPDEVHLRSIARAELSREK : CELK09H115
CELK09H115    : GKGFEIAQGRLGPGRIHHAMRLIGHAERAIDVIKDRLLTRIAFGRKLVQFDSLRKELALSRCEVEQARLLVLKAAHMIDTVGPAKSEIAMIKVVAPNMAISILDRAMQQQGARGLTPFTPLASFYVWARSLRIADGPDAVHLETIAKIEMKSR. : PIGM_RHOSO
PIGM_RHOSO    : MYHLPFLPFAMAEVTPVVVGALRGAADAFVQRTQGTISQEKASGKQAAQMRLGRALAAADAAETLLDAFFERLTAQRPEQSDPDRAEMKLKAAYLADLARNALNDMVRGIGGDGYRNSAPIQRYFRDLSVLSVHAFLIDTASETIGRFTLDLPV : ACPCAU
ACPCAU        : AASQIAFQGALEYARDRLAMRALSGIQYP.EKNADPIIVHPAVRSMLMTQKAFAEGGRALAYFLAQHADIVEKTKDPQQQASDLAFLTPIAKAFLTESGNESAKHGVQIFGGHGFIIEHGMEQIVRDARISTLYEGTEIQSLDLLARKVLKSEG : CELT10E98
CELT10E98     : GKGYKYAIEYLNAGRIGIGAQMLGLAQGCFDQTIPYLQQREQFGQRIIDFQGMQHQIAQVRTEIEAARLLVYNAARMKQHGLPFVREAAMAKLFASPKNSPSR.........N.TIVTVKLERFTKELPTF....................... : MTCY07A75
MTCY07A75     : GSGYANFLSILDEGRIAIAALATGAAQGCVDESVKYANQRQSFGQPIGAYQAIGFKIARMEARAHVARTAYYDAAAKMLAGKPFKKEAAIAKMISSEAAMDNSRDATQIHGGYGFMNEYPVARHYRDSKVLEIGEGTTEVQLMLIARSLGL... : MTCY8D59
MTCY8D59      : GQGFSQMMKGLETGRIQVAARALGVATAALEDSLAYAQQRESFGRPIWQHQAVGNYLADMATKLTAARQLTRYAAERYDSGQRCDMEAGMAKLFASEVAMEIALNAVRIHGGYGYSTEYDVERR.............................. : CELE04F61
CELE04F61     : GEGFKVAMNILNNGRFGIPAACTGAMKHCIQKTVDHITTRVQFGKKLQEFGNIQEKLVEMISKLYATESIVYMLSSNMDRGIKYQLEAAIGKVLASENAWLVCDDAIQVHGGMGFMRETGLERVLRDLRIFRIFEGANDVLRLFIALTGAQHAG : MTCI3761
MTCI3761      : GRGVPTIIEMVNLTRLDCALGSATSMRTGLTRAVHHAQHRKAFGAYLIDQPLMRNVLADLAVEAEAATIVAMRMAGATDETEARRIGLAAAKYWVCKRSTAHAAEALECLGGNGYVEDSGMPRLYREAPLMGIWEGSGNVSALDTLRAMATRPA : AIDB_ECOLI
AIDB_ECOLI    : GEGIRLILKMGGMTRFDCALGSHAMMRRAFSLAIYHAHQRHVFGNPLIQQPLMRHVLSRMALQLEGQTALLFRLARAWDAKEAARLFTPAAKFVICKRGMPFVAEAMEVLGGIGYCEESELPRLYREMPVNSIWEGSGNIMCLDVLRVLNKQAG : MTCY6A414
MTCY6A414     : LLSNLTMTTAHALMSTLLSAEAVGVARWATDTASAYAKIREQFGRPIGQFQAIKHKCAEMIADTERATAAVWDAARALDESSSVEFAAAVAATLAPATAQRCTQDCIQVHGGIGFTWEHDTNVYYRRALMLAACFGRSEYPQRVVDTATTAGMR : MTCY6G119
MTCY6G119     : RAPKDVVARAYEFGALATAAQLVGAGQALLEAAVNYAKQRTQFGRAIGSYQAIKHKLADVHIAIELACPLVYGAAVSLE.....PRDVSAAKAAASEAALLAARWALQTHGAIGFTCEHDLSLWLLRVQALHSAWGTQEHRRRVLEA....... : MTCY9F930
MTCY9F930     : .GTPDDMERVLDVARVLLAAEMLGGAEACLDLAVQYAGRRTQFDRPIGSFQAVKHACADMMIEIDATRATVMFAAMSAANGDELQTVAPLAKAQTAETFVLCAGSALQIHGAIAFTWEHDLHLYYRRAKTTEALFGSSARNRALLAERAGLVKA : MTCY6G1119
MTCY6G1119    : TVLEVSGERVEDLAATVLAAEAAGVARWTLDTAVAYAKVREQFGKPIGSFQAVKHLCAQMLCRAEQADVAAADAARAAA.SDGLSIAAAVAASIGIDAAKANAKDCIQVLGGIGCTWEHDAHLYLRRAHGIGGFLGGGRWLRRVTALTQAGVRR : MTCY22D719
MTCY22D719    : ..AYESALARA...RTLLAAEAVGGAADCVDSAVAYAKVRQQFGRTIATFQAVKHHCANMLVAAESAIAAVWDAARAAADEEQFRLAAAVAAALAFPAYARNAELNIQVHGGIGFTWEHDAHLHLRRALVTVGLFGGDAPVRDVFERTAAGVTR : MTCY8D526
MTCY8D526     : AEAFHAALNTVNVCKYNLGWGAIGMCTHALYESVTHAANRHLYGTVVTDFSHVRRLLTDAYVRLIAMKLVASRASDYMRSAADYLLYSPLTKAKVTSEGERVITALWDVIAAKGVEKDTFFETVAREIGLLPRLEGTVHINIGLLGKFMPNYLF : MTCY3A217
MTCY3A217     : GKGFAGVMETFDNTRPIVAAMAVGIGRAALEEILTGAGVEISYDKPSHTQSAAAAEFLRMEADWEASYLLSLRAAWQADNNIPNSKEASMSKAKAGRMASDVTCKTVELAGTTGYSEQSLLEKWARDSKILDIFEGTQQIQQLVVARRLLGLSS : A48702
A48702        : GEGFVVAMRTFDRTRPAVAGLATGLQARCLDEASKYALERKTFGIPIANHQAVATMLMADAINMELSRMITYRCAWEVMSGVPRGYYSSMAKCFAADSANIAASNAVQILGGNGYNSEYPVEKLMRDAKLFQIYEGTCQIQRVVVSRNLLSRLK : CELT25G12
CELT25G12     : GEGFKVAMKTFDKTRPTVAALATGVAYRCLDVATQYSLERKAFGTQIANHQGVSFLLAEMAINCELARLMTYKSGAEVDAGRPGSYYASIAKLFASDTANQAATNAVQIFGGAGFNTEYPAEKLMRDAKIFQIYEGTSQIQRMVIARQLLARVA : ACDA_BACSU
ACDA_BACSU    : GEGFKIAMKTLDGGRNGIAAQAVGIAQGALDAALQYAKERKQFGKSIAEQQGIAFKLADMATMIEASRLLTYQAAWLESSGLPYGKASAMSKLMAGDTAMKVTTEAVQIFGGYGYTKDYPVERYMRDAKITQIYEGTQEIQRLVISRMLAD... : ACDS_MEGEL
ACDS_MEGEL    : GKGFKIAMMTLDGGRIGVAAQALGIAEAALADAVEYSKQRVQFGKPLCKFQSISFKLADMKMQIEAARNLVYKAACKKQEGKPFTVDAAIAKRVASDVAMRVTTEAVQIFGGYGYSEEYPVARHMRDAKITQIYEGTNEVQLMVTGGALL.... : TTBCSOPRN1
TTBCSOPRN1    : GEGFKIAMATLDGGRIGIAAQRLGIAQAALDEEIKYAKERQQFGRPIGKFQGIQWYIADMATRINASRWLVYNAAWRKQVGLPYTMEAAMAKLYASETAMFVTTKTVQIFGGYGFTKDYPVERFMRDAKITEIYEGTSEVQKMVISGNLLK... : ACDS_CLOAB
ACDS_CLOAB    : GKGFPIAMKTLDGGRIGIAAQALGIAEGAFNEARAYMKERKQFGRSLDKFQGLAWMMADMDVAIESARYLVYKAAYLKQAGLPYTVDAARAKLHAANVAMDVTTKAVQLFGGYGYTKDYPVERMMRDAKITEIYEGTSEVQKLVISGKIF.... : CELC17C35
CELC17C35     : GKGYKYAIEVLNASRIVIGAQMG.............................LQHQIAKIQTEIEAARLMVYNCARMKDCGMPFVKEASMAKYYAPEVACKTTKQCIEWLGGVGFTKNFMAEKFYRDAVVGGIYEGTSNIQLNTIAKFIDNEFK : MTCY3A218
MTCY3A218     : EASDNDYSEALALARLGWAALAVGTSHAVLDYVVPYVKQRQAFGEPIAHRQAVAFMCANIAIELDGLRLITWRGASRAEQGLPFAREAALAKRLGSDKGMQIGLDGVQLLGGHGYTKEHPVERWYRDLRAIGVAEG....VVVI.......... : MTCY10D71
MTCY10D71     : DAAIAQLFAGLNPERIMGAASAVGMGRFALGRAVDYVKTRKVWSTPIGAHQGLAHPLAQCHIEVELAKLMTQKAATLYDHGDDAAEAANMAKYAAAEASSRAVDQAVQSMGGNGLTKEYGVAAMMTSARLARIAPISREMVLNFVAQTSLGLPR : PRVB_ESOLU

              : 242-------252-------262-------272-------282-------292-------302-------312-------322-------332-------342-------352-------362-------372-------382-------392- :
OrigSeq       : GAGFKIAMGTFDKTRPPVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLAEHQGISFLLADMAMKVELARLSYQRAAWEIDSGRRNTYYASIAKAYAADIANQLATDAVQVFGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTAQIQRIIIAREHIGRYK :OrigSeq
cons          : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--- :cons
dsc           : ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH--- :dsc
mul           : ----HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEH----------HHHHHHHHHHEEE-------HHHHHHHHH----- :mul
nnssp         : ---HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-- :nnssp
phd           : -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--- :phd
pred          : --------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE---------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH---- :pred
zpred         : ----HEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE-------E-HHHHHHHHHH-EEE------HHEEEHHH------- :zpred


access        : EEEBEBBBEBBEEB-BBBBBBBBBBBEBBBEEBBE-BEE-EEBBEBBBEBEBBBBBBBEBBBEBEBBEBBBBEBBEBBEEEEEBBBBBBBBEBBBBEBBBEBBEEBBEBBBB-BBBEEBBBEEBBEEBEBBBBBEBBEEBBBBBBBEBBBEEEE : access

PHD Rel       : 9862122243334357789999999999999999999999975312447779999999999999999999999999996245136999999999887689999999999835542111127999987676566416368888778888632279 : PHD Rel
Pred Rel      : 0076775557777878888888868888888889999887886876887788899999999999999899998988886797777889999999877788888887555589987777778888888888766789776677788887777000 : Predator Rel


dssp          : --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE--EEHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH--E-----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH--- :dssp
define        : -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH :define
stride        : EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EE--EEHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE---HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-- :stride


Q3 values for 3mddb-3-AS  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
phd	84.42	80.52	85.06
dsc	83.12	78.57	82.47
pred	77.92	72.73	75.97
mul	77.92	76.62	74.68
nnssp	83.77	81.17	84.42
zpred	74.68	75.32	73.38
cons	86.36	81.17	85.71