Results for 1nal4-1-AUTO.1


1nal4-1-AUTO.1    : NLRGVMAALLTPFDQQQALDKASLRRLVQFNIQQGIDGLYVGGSTGEAFVQSLSEREQVLEIVAEEGKGKIKLIAHVGCVTTAESQQLAASAKRYGFDAVSAVTPFYYPFSFEEHCDHYRAIIDSADGLPMVVYNIPALSGVKLTLDQINTLVTLPGVGALKQTSGDLYQMEQIRREHPDLVLYNGYDEIFASGLLAGADGGIGSTYNIMGWRYQGIVKALKEGDIQTAQKLQTECNKVIDLLIKTGVFRGLKTVLHYMDVVSVPLCRKPFGPVDEKYQPELKALAQQLMQ : S50750
S50750            : KALRLITAIKTPYLPDGRFDLEAYDDLVNMQIGQGAEGVIVGGTTGEGQLMSWEEHIILIAHTVNCFGGKIKVIGNTGSNSTREAIHATEQGFAVGMHAALHINPYYGKTSLDGMVAHFRSVLSMG...PTIIYNVPARTGQDIPPHVIQTLAESVNLAGVKECVG....NDRIKQYTDDIVVWSGDDQCHDARWGYGATGVVSVASNLVPGLMRELMFGGVN......PTLNSKLLPLIDWLFHMPNPIGLNTALAQLGVIRP.VFRLPFVPLPVDKRIEFANLVKEIGR : DAP2_WHEAT
DAP2_WHEAT        : KSLRLITAVKTPYLPDGRFDLEAYDSLINTQINGGAEGVIVGGTTGEGHLMSWDEHIMLIGHTVNCFGTNIKVIGNTGSNSTREAIHASEQGFAVGMHAALHVNPYYGKTSTAGLISHFDEVLPMG...PTIIYNVPSRTGQDIPPAVIEALSTYPNMAGVKECVG....HERVKCYTDKITIWSGDDECHDSRWKYGATGVISVTSNLVPGLMRSLMFEGEN......AALNEKLLPLMKWLFSEPNPIGLNTALAQLGVVRP.VFRRPYAPLSLEKRTEFVRIVEAIGR : TVU35878
TVU35878          : SLKGLFSALLVSFNEDGTINEKGLREIVRYNIDKMIDGLYVGGSTGENFELSTEEKKQIFRIAKDEAKDQVALIAQVGSINIHESIELGKYATELGYNCLSAVTPFYYKFTFPEIKNYYNTIVNATG.MNMIVYSIPALTGVSMTADQFGELFENPKIIGVKFTAGDFYLLERVKRAYPDHLIWAGFDEMMLPACSLGIDGAIGSTFNVNAKRARQIFELSKAGKYDEALEVQHVTNDLIAGILSNGLYLTIKELMR.LDGVDAGYCREPMT...KALTPAQVAFAKQLKE : NPL_ECOLI
NPL_ECOLI         : NLRGVMAALLTPFDQQQALDKASLRRLVQFNIQQGIDGLYVGGSTGEAFVQSLSEREQVLEIVAEEAKGKIKLIAHVGCVSTAESQQLAASAKRYGFDAVSAVTPFYYPFSFEEHCDHYRAIIDSADGLPMVVYNIPALSGVKLTLDQINTLVTLPGVGALKQTSGDLYQMEQIRREHPDLVLYNGYDEIFASGLLAGADGGIGSTYNIMGWRYQGIVKALKEGDIQTAQKLQTECNKVIDLLIKTGVFRGLKTVLHYMDVVSVPLCRKPFGPVDEKYLPELKALAQQLMQ : DAPA_ECOLI
DAPA_ECOLI        : MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGTTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHT.DLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIKEATG.LTRVNQIKELVSDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGL : DAPA_BRELA
DAPA_BRELA        : HFGTVGVAMVTPFTESGDIDIAAGREVAAYLVDKGLDSLVLAGTTGESPTTTAAEKLELLKAVREEVGDRAKLIAGVGTNNTRTSVELAEAAASAGADGLLVVTPYYSKPSQEGLLAHFGAIAAAT.EVPICLYDIPGRSGIPIESDTMRRLSELPTILAVKDAKG.LVAATSLIKETG.LAWYSGDDPLNLVWLALGGSGFISVIGHAAPTALRELYTSFEEGDLVRAREINAKLSPLVAAQGRLGGVSLAKAALRLQGINVG.DPRLPIMAPNEQELEALREDMKKAGV : YJHH_ECOLI
YJHH_ECOLI        : KFSGIIPPVSSTFHRDGTLDKKAMREVADFLINKGVDGLFYLGTGGEFSQMNTAQRMALAEEAVTIVDGRVPVLIGVGSPSTDEAVKLAQHAQAYGADGIVAINPYYWKVAPRNLDDYYQQIARSVT.LPVILYNFPDLTGQDLTPETVTRLALNENIVGIKDTIDLRTMINTVKSVRPSFSVFCGYDDHLLNTMLLGGDGAITASANFAPELSVGIYRAWREGDLATAATLNKKLLQLAIYALETPFVSLIKYSMQCVGLPVETYCLPPILEASEEAKDKVHVLLTAQGI : YAGE_ECOLI
YAGE_ECOLI        : LFTGIIPPVSTIFTADGQLDKPGTAALIDDLIKAGVDGLFFLGSGGEFSQLGAEERKAIARFAIDHVDRRVPVLIGTGGTNARETIELSQHAQQAGADGIVVINPYYWKVSEANLIRYFEQVADSVT.LPVMLYNFPALTGQDLTPALVKTLADRSNIIGIKDTIDLRSMIHTVKGAHPHFTVLCGYDDHLFNTLLLGGDGAISASGNFAPQVSVNLLKAWRDGDVAKAAGYHQTLLQIQMYQLDTPFVNVIKEAIVLCGRPVSTHVLPPASPLDEPRKAQLKTLLQQLKL : MTV00218
MTV00218          : RLGTLLTAMVTPFSGDGSLDTATAARLANHLVDQGCDGLVVSGTTGESPTTTDGEKIELLRAVLEAVGDRARVIAGAGTYDTAHSIRLAKACAAEGAHGLLVVTPYYSKPPQRGLQAHFTAVADAT.ELPMLLYDIPGRSAVPIEPDTIRALASHPNIVGVKDAKA.LHSGAQIMADTG.LAYYSGDDALNLPWLAMGATGFISVIAHLAAGQLRELLSAFGSGDIATARKINIAVAPLCNAMSRLGGVTLSKAGLRLQGIDVG.DPRLPQVAATPEQIDALAADMRAASV : DAPA_BACSU
DAPA_BACSU        : NFGNVSTAMITPFDNKGNVDFQKLSTLIDYLLKNGTDSLVVAGTTGESPTLSTEEKIALFEYTVKEVNGRVPVIAGTGSNNTKDSIKLTKKAEEAGVDAVMLVTPYYNKPSQEGMYQHFKAIAAET.SLPVMLYNVPGRTVASLAPETTIRLAAIPNVVAIKEASG.LEAITKIIAETPEFYVYSGDDALTLPILSVGGRGVVSVASHIAGTDMQQMIKNYTNGQTANAALIHQKLLPIMKELFKAPNPAPVKTALQLRGLDVG.SVRLPLVPLTEDERLSLSSTISEL.. : DAPA_SYNY3
DAPA_SYNY3        : PFGPVLTAMVTPFNADGGVDYGVAEKLADHLITHGSDGLVVCGTTGESPTLSWEEEHELFRVVKQTVGDRGSVIAGTGSNCTREAMEATQIAAKLGVDGSLQVVPYYNKPPQEGLLAHFQAIANCAPELPLMLYNIPGRTGQSLAPETVYRLAEVENIVAIKEATG.LEQASLIRAHTPDFAIYAGDDVLTLPLLAVGGAGVVSVASHLVGDRLQAMVQHFAQGATAQALEIHLQLIPLFKILFCATNPIPVKTALGLQGWPVG.SFRPPLCALSPGHTEQLRDVLRDLAL : DAPA_PROMA
DAPA_PROMA        : PFGRLLTAMVTPFDTAGAVDFALAARLARYLVDQGSDGLIVCGTTGESPTLSWEEQYQLLETVRNAVNGSAKVLPGTGSNSTSEAIHATAKAAEAGADGALVVVPYYNKPPQAGLESHFRAVAQAAPDLPLMLYNIPGRTGCSISPITVQRLMNCSNIVSFKAASG.TNEVTDLRIRCGSLAIYSGDDGLPLPMLSVGAVGVVSVASHIVGMRLKAMIEAYFAGENSLALSHHEQLQPLFKALFATTNPIPVKAALELIGWPVG.APRSPLLPLENQMKNELMKTISALLQ : RPRBFA7
RPRBFA7           : IFKGLITALITPFKDNK.LDLYALENILNQQIKHKIDAVLIAGSTGEANSLSFEEYKLLLKTSVDIVNNRMPIISGCSSNNTAYAIELAIESKKIGVDCFMASPPSYVKPTQHGIYKHFEALHEACN.LPIMLYSAPTRSGVDFSDETILRLSKLPRILALKDCGV.LERPMRIRAIVKGFNILTGNDEVVLAFHAQGVVGWISVTSNIAPKLCKELLEKWYNNDTQGALEIHQKLLPLYKALFLESNPIPVKYAAYYLGLCEN.EIRLPLTEASDSAKKQIKKIITSLSI : E64646
E64646            : MQFHSSSALITPFKKDLSVDEAAYETLIKRQIFQGMDACVPVGTTGESATLTHKEHMRCIEIAIETCKSRMKVLAGVGSNATSESLSLAKFAQKIGADAILCVSPYYNRPTQQGLFEHYKTIAQSV.EIPVMLYDVPSRTGVSIEVPTALKLFRVPNIKAIKEASG.LKRVTELHYYEKDFKIFSGEDSLNHSIMFSGGCGVISVTGNLMPNLISQMVNCALKQKYQQALEIQNKLFCLHQALFVETNPIPIKMAMHLAGLIENPSYRLPLVAPSKETIQLLEKTLQQYEV : A69207
A69207            : KIEGTVVAMVTPFTEDDVVDEAGLRENINYLIENGVDGLLVAGTTGESATITHEEQRRMIDILVDEVNGRVRTVAGAGSNSSREAMGLVEYAEDAGADAALVITPYYNKPQPHGLIEHYTMLEEAA.DIPLIIYNVPSRTGTDIDVDTVAELAKDG.IIGIKEASP.LDKVSMLRSRLMDFTVLSGNDNLTLPMISMGAEGVISVVANVDPARMSRLVNEALSGDFESAMKTHYELYSLMKVLFIESNPVPVKEALNMMGKARG.SCEDAPGTPAGCKP............ : MOSA_RHIME
MOSA_RHIME        : MFEGSITALVTPFADDR.IDEVALHDLVEWQIEEGSFGLVPCGTTGESPTLSKSEHEQVVEITIKTANGRVPVIAGAGSNSTAEAIAFVRHAQNAGADGVLIVSPYYNKPTQEGIYQHFKAIDAAS.TIPIIVYNIPGRSAIEIHVETLARIFECPNVKGVKDATG.LLRPSLERMACGEFNLLTGEDGTALGYMAHGGHGCISVTANVAPALCADFQQACLNGDFAAALKLQDRLMPLHRALFLETNPAGAKYALQRLGRMRG.DLRLPLVTISPSFQEEIDDAMRHAGD : DAPA_HAEIN
DAPA_HAEIN        : LFSGSIVALVTPMNHYGEVDFSCLEKLVEHHIEAGSNALVSVGTTGESATLSIEENVKVIEKTVEFAKGRIPIIAGAGANATSEAITMTKLLRDSGVAGCLSVVPYYNKPTQEGMYQHFKAIAECT.DLPQILYNVPSRTGSDMKPETVARLAEIENIVGIKEATR.VSRIVKIKQLAGKFIVLSGDDATGLEAIKLGAEGVISVTNNIAAKDMADMCRYALAGDFDKAEEINARLMRLHHDLFIESNPIPVKWAAYRLGLIKSPHLRLPLTTLSEEIQPKVGDALKIAGL : DAPA_METJA
DAPA_METJA        : MFKGVYPAIITPFKNKE.VDFDGLEENINFLIENGVSGIVAVGTTGESPTLSHEEHKKVIEKVVDVVNGRVQVIAGAGSNCTEEAIELSVFAEDVGADAVLSITPYYNKPTQEGLRKHFGKVAESI.NLPIVLYNVPSRTAVNLEPKTVKLLAEYSNISAVKEANP.LSQVSEL...IHDITVLSGNDELTLPIIALGGKGVISVVANIVPKEFVEMVNYALEGDFEKAREIHYKLFPLMKAMFIETNPIPVKTALNMMGRPAG.ELRLPLCEMSEEHKKILENVLKDLGL : F69363
F69363            : MFEGVIPAMVTPFKEDFSVDYEGIAKNLDYLEKH.VNALVPAGTTGEAATLSYEEHIDVVRYVAETS..KLPVIGGAGSNSTREAIWLAKEVEKAGAEAAMLVTPYYNKPNAEGLYQHYKAVASEV.SIPIIVYNVPSRTGINTTPELVRRLAEDN.IFGIKEASG.LKQISEIIRTTPDFVLLSGDDFLTLPILCLGGKGVISVAANVAPHLMKEMYEAFVEGNIERAREMHHRLTPLFDVLFIDTNPIPVKKALQLMGLAAG.KPRLPLVELSEEKTQKVKEVLKSLEL : CTSIALIDA1
CTSIALIDA1        : KYKGIIPAFYACYDDEGKISPERTQMFTQYLIDKGVKGLYVCGSSGECIYQSKEERKITLENVMKVAKGKITIIAHVGCNNTRDSEELAEHAESIGVDAIASIPPIYFHLPDYSIAEYWNDISNAAPNTDFIIYNIPQLAGVGLGINLYKQMLKNPRVIGVKNSSM.VQDIQMFKDISGDSVVFNGPDEQFVAGRIMGADGGIGGTYAVMPELFLAADKA....................................................................... : CPNANA1
CPNANA1           : .MKGIYSALLVSFDKDGNINEKGLREIIRHNIDVCIDGLYVGGSTGENFMLSTDEKKRIFEIAMDEAKGQVKLIAQVGSVNLKEAVELAKFTTDLGYDAISAVTPFYYKFDFNEIKHYYETIINSVD.NKLIIYSIPFLTGVNMSIEQFAELFENDKIIGVKFTAADFYLLERMRKAFPDKLIFAGFDEMMLPATVLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFEAAQKGDIETALEVQHVTNDLITDILNNGLYQTIKLILQ.EQGVDAGYCRQPM....KEATEEMIAKAKEINK : KDGD_BACSU
KDGD_BACSU        : APAGILGFPVAPFNTQGTLEEEALFQNIEFLLNEGLEAIFIACGSGEFQSLSQKEYEQMVEVAVSAAGGKVPVYTGVGG.NLSTALDWAQLSEKKGADGYLILPPYLVHGEQEGLYQYAKTIIEST.DLNAILYQR...DNAVLSVEQIKRLTECEQLVGVKDGVG.MDLNINLVYTIGDLGWLNGAEVTMPAYLPIGFHSYSSAISNYIPHISRMFYDALKNGNDELVELYRHVILPIDIRKQRKGYVSLIKAGMEIMGLNVRNTARPPVGPVEKDHYQQLEAILKQPAD : KDGD_PSEPU
KDGD_PSEPU        : LSEGLLSFPLTDFDVAGDFRADTYAKRLEWLAPYGASALFAAGGTGEFFSLQASEYSEIIKVAVDTCRGEVPILAGTGG.PTRQAIAYAQEAERLGAAGVLLLPHYLTEASQEGLVSHVEQVCKSV.DFGVVVYNR...NVCRLNADSLEKLADCPNLIGFKDGVG.IESMVSIRRRLGELTYLGGAEVYAAAYKAMGVPVYSSAVFNFIPKTAMDFYRAVASEDHETVKLIDDFFLPYDIRNRCEGYVSIVKAGARLVGHDAG.PVRAPLTDLLPNEMEQLDALIKKLGA : S28399

                  : 4---------14--------24--------34--------44--------54--------64--------74--------84--------94--------104-------114-------124-------134-------144-------154-------164-------174-------184-------194-------204-------214-------224-------234-------244-------254-------264-------274-------284-------2 :
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mul               : ----HEEEEEE-------HHHHHHHHHHHHH------EEEEE------------HHHHHHHHHHHH-----EEEE---------HHHHHHHHH------EEEEE----------HHHHHHHHHH------EEEEEE------------HHHHHH---HEH-H------HHHHHHH-----EEEE------HHHHHH-----EEEEE----HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHH-- :mul
nnssp             : -------EE-----------HHHHHHHHHHHHH----EEEEE----------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE---------HHHHHHHHHHHHH-----EEEE-----------HHHHHHHHH---EE--------HHHHHHHHHH---EEEE-----------------EEEE-----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHH-- :nnssp
phd               : ----EEEEEE----------HHHHHHHHHHHHHH----EEEE----------HHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE----------HHHHHHHHH---EEEEE-----HHHHHHHHH----EEEEE--------EEE-----EEEEE----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHH-- :phd
pred              : ---EEEEEE----------HHHHHHHHHHHHHH----EEEE---------HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE------HHHHHHHHHHHHH----EEEEE----------HHHHHHHHHHHH-----EEEE-----------HHHHHHHHH---EEE-------HHHHHHHHHH---EEEE------------------EEEE---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHH--- :pred
zpred             : ----EEEEEEEE------HHHHHHHHHHHHEE----EEEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE--------HHHHHHHHHH------EEEEEEE----EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHEEE-----HHHHHHE-----EEEEE---HHEHHHEEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHEE---------HHHHEE-----------------HHHHHHHHHHHHHH-- :zpred


access            : EBEEBBBBBBBBBEEEEEBE-EBBEEBBEBBBEEBBEBBBBBBEEEEBBE-B-EE--EBBEBBBEBBEEEBEBBBBBBBEBBEEBBEBBEEBEEBBBEBBBBBBEB-BEB-EEEBBEBBEBBBEBBEEBBBBBBBBEE-BBBEBBBEBBEEBBEBEEBBBBEEBBEEBEBBBEBEEBBEEBBBBBB-EBBBBBBBBBBBEBBBBBBBEBBBEBBEEBBEBBBEEEBEEBBEBBBEBBEBBBBBBEEBB-BBBEBBBEBBBBBBBEEB-BEBBEBEEE-EEEBEEBBEEBEE : access

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dssp              : ----EEEE----E-----E-HHHHHHHHHHHHH----EEEE------HHH--HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE--------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE-HHHH-----HHHHHHHH----EEEEEE----HHHHHHHHHH----EEEE--HHHHHHHHHH---EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHH-- :dssp
define            : ----EEEEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEE---------HHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEE----EEEEEHHHHHHHHHH-EEEEEEE---HHHHHHHHHHHHH--EEEEE---HHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE---HHHHHHHHHHHHH- :define
stride            : ----EEEE----E-----E-HHHHHHHH---HHH---EEEE--HHH-HHH--HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE--------HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-HHHH-----HHHHHHHHH---EEEEEE----HHHHHHHHHH----EEEE--HHHHHHHHHH---EEEEHHHH--HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHH----------------HHHHHH---HHHHH-- :stride


Q3 values for 1nal4-1-AUTO.1  View SS in Rasmol

	dssp	define	stride
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dsc	82.82	74.91	78.35
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nnssp	84.19	72.16	81.44
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cons	83.51	74.23	81.79