Predictions for request ./t0016



t0016; peridinin-chlorophyll protein; 312a.a.   : DEIGDAAKKLGDASYAFAKEVDWNNGIFLQAPGKLQPLEALKAIDKMIVMGAAADPKLLKAAAEAHHKAIGSISGPNGVTSRADWDNVNAALGRVIASVPENMVMDVYDSVSKITDPKVPAYMKSLVNGADAEKAYEGFLAFKDVVKKSQVTSAAGPATVPSGDKIGVAAQQLSEASYPFLKEIDWLSDVYMKPLPGVSAQQSLKAIDKMIVMGAQADGNALKAAAEAHHKAIGSIDATGVTSAADYAAVNAALGRVIASVPKSTVMDVYNAMAGVTDTSIPLNMFSKVNPLDANAAAKAFYTFKDVVQAAQ : t0016; peridinin-chlorophyll protein; 312a.a.  
PCP_SYMSP                                       : DEIGDAAKKLGDASYSFAKEVDWNNGIFLQAPGKFQPLEALKAIDKMIEMGAAADPKLLKDAAEAHHKAIGSISGPNGVTSRADWDAVNAAIGRVVASVPKAKVMAVYDSVTAITDPGVPAYMKSLVNGPDAEKAYQGFLEFKDVVEKNQVATASAPAVVPSGDKIGEAAKALSDASYPFIKDIDWLSDIYLKPLPGKTAPETLKAIDKMIVMGAKMDGNLLKAAAEAHHKAIGSIDATGVTSAADYEAVNAAIGRLVASVPKTTVMDVYNSMAGVVDSSVPNNLFSKVNPLDAVAAAKGFYTFKDVVEASQ : PCP_SYMSP  
PCP2_AMPCA                                      : DEIGDAAKTLGDASYAFAKEVDWNNGIFLQAPGKLQPLAALKAIDKMIVMGAAADPQLLKAAAEAHHKAITTVSGANGVTSRADWDNVNAALGRVISAVPEKMVMDVYNSVAKITDPKVPAYMNSLVNGADAEKAYAGFLAFKDVVKKNQVTSAAGPATVPSGDTIGVAAQKLSDASYPFLKQIDWLSDVYLKPLPGVSAQQSLKAIDRMIVMGAQADGNALKAAAEAHHKAIGSIDAKGVTSAADYAEVNAAIGRVVASVPKSTVMDVYKAMASVTDTGIPLNMFSKVNPLDANAAAKAFYTFKDVVLAAQ : PCP2_AMPCA  
PCP3_AMPCA                                      : DGIADASKKFSDATYPIAEKFDWGGSKYIADASASNPRQAALAVEKLLETGLTMDPKLVRAAVAAHSKALDTAVSPKLVASKEDFAAVNEALARMIASADKQKFAALRTAFPES..RELQSSLFAGNNGYEAEKAYDSFKALTSAVRDASINGANAPVIAEAADPVGRAAKKFSEATYPIMEKLNWVKSKYLATASSKDPKMMAPGIDKTLEVALTMNQNLINNAVYAHVRAIKALNTPGFVARDDFARVNLALAKMIGSADPAKFKALLTAFPGNAD..LQMALF.AANPEQAKAAYETFVALTSAVV... : PCP3_AMPCA  
consv                                           : -3-9--7-677--7-57-666--6675895467438-43-65-88-8937-677--6-884-73--3--947657656-7-83-846--3-99-787775636674856765242342867583766--38-----37-537667-6567866-69-767479-38-2--637-8-7--786497-8464-846667456355639--87937965775-6956-75--38--479773-67734-832--6-998789-75366664865786766-1186568-247--46-3--567-577667-321- : consv

                                                : 1---------11--------21--------31--------41--------51--------61--------71--------81--------91--------101-------111-------121-------131-------141-------151-------161-------171-------181-------191-------201-------211-------221-------231-------241-------251-------261-------271-------281-------291-------301-------- :
OrigSeq                                         : DEIGDAAKKLGDASYAFAKEVDWNNGIFLQAPGKLQPLEALKAIDKMIVMGAAADPKLLKAAAEAHHKAIGSISGPNGVTSRADWDNVNAALGRVIASVPENMVMDVYDSVSKITDPKVPAYMKSLVNGADAEKAYEGFLAFKDVVKKSQVTSAAGPATVPSGDKIGVAAQQLSEASYPFLKEIDWLSDVYMKPLPGVSAQQSLKAIDKMIVMGAQADGNALKAAAEAHHKAIGSIDATGVTSAADYAAVNAALGRVIASVPKSTVMDVYNAMAGVTDTSIPLNMFSKVNPLDANAAAKAFYTFKDVVQAAQ : OrigSeq

cons                                            : -HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----EEEE------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- : cons

dsc                                             : -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH--------HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--- : dsc
mul                                             : --HHHHHHHH-----HHHH--------EEE-----------HHHHHHHHHHH-H----HHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHH-EH--HHHHHHHH--H--------------------HHHHHHHHHHHHHHHH--------------------HHHHHH--------H----H--------------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH--------EE-HHHHHHHHHHHHHEEE-H-----HHHHHHHH-E-------EEE-------HHHHHHHH----HHH---- : mul
nnssp                                           : HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----EEE-------HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHH---HHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH : nnssp
phd                                             : --HHHHHHHH---HHHHHHHHH----EEEE------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH--EE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH-EEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHEE---HHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH- : phd
pred                                            : ---HHHHHHHH--HHHHHHH------EEEE------HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHH--------- : pred
zpred                                           : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE-----EEEEHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHEE------EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE----EEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE---EEEHHHHHHHHHHHHHEEEE----EEEEEHHHHEEEE---EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH : zpred


You                                             :: You

access                                          : EEBEEBBEEBEEBB-BBBEEBE-EBBBBBEBEEEB-B-EBBEBBEEBBBBBBEBEEEBBEBBBEBBBEBBBEBBBEEBBBBEBEBEBBBBBBBEBBBBBEEEBBBBBBEBBBEB-EEEBEBBBEBBBEB-EBEEB-EBB-BBEEBBEEBEBBBBEBEBBBEEEEEBBEBBEEBBEBB-EBBEEBEBBBEBBBEEBEEEEBEEBBEBBEEBBBBBBEBEEEBBEBBBEBBBEBBEBBEBEBBBBBBEBBBBBBBBBEBBBEBEEBEBBBBBBBBBEBBEBBBBBBBBBEB-EEEBEBBBEBBBBBEEBBEBBE : access

PHD Rel                                         : 917899997144329998763115754887178787599999999999733225889999999999631115318787634553599999999999862256765555432113799645577785278499999999889999996531021279853468770599999976351789987515545322449997818889999777531124155899999999998652221786522689999999998987432831247999995323357643311156796999999999866878777329 : PHD Rel
Pred Rel                                        : 007777977867708857555099965660099977689800808799765600000099090999957557889900877709666786999989765778856798877767899976667065899666699986888777888776667899977879996680098998970065665556787606589998677876987587770067780000099999998867788996755777798880998877867776658778585776679977775858987688009999888876677000 : Predator Rel



  



Notes


- The Consensus (cons) has a real world sustained Q3 average accuracy of ca. 72.9%
- SRS links will only work for swissprot entries because OWL is not indexed @EBI


Key:
consv - Conservation number (-) = 0; (+) = 10
phd   - PHD prediction
dsc   - DSC prediction
pred  - PREDATOR prediction 
nnssp - NNSSP prediciton 
zpred - Zpred prediction 
mul   - Mulpred prediction

access - Solvent Accessibility

PHD Rel - PHD Reliability
PRED Rel - NNSSP Reliability