>t0019; RepA1 from E.coli (plasmid), 340 a.a.
MAERYISQRHWSQLPPEEQIRVWEDYEAGRATTFLVEPERKRTKRRRGEHSTKPKCENPTWYRPARYKALSGQLGHRYNRLVKKDPVTGEQSLRMHMSRHPFYVQKRTFAGRKYAFRPEKQRLLDAVWPVLVSFSDAGTHTVGMSVSRLAKEISPKDSKGKVIPELEVTVSRLSRLLAEQVRFGVLGMSEETMWDRETRQRLPRYVWITPAGWQMLGVDMVKLHEQQQKRLRESEIRQQLIREGVLREDEDISVHAARKRWYLQRSQDALKHRRAKAAARKRANLLKKLPADQQIYEMSQHILKRMPPDEAYWCTPERLQQLAIRELYQLELTLAAPPPH
>KPU273452
MNQKYLQLSDIESVELSPEFISWLESQSPKESLLLDEGTKRKTRRRRGTHSTACLCPEPSWYRPDNFKKLPGQLGHAYNRLVRRDRKTGALSLRMRISRHPYFVQLREQAGRKRDFRPEREKLLDAIVPLLVSTVDRATHIDTINLSKMAWQLSEKDSEGNVI..RKVTVPRVCRLLQHMMEFGLLALPEGVTWDPFNRKWFPKHVVLTERLWKMIGVDLDKLYAEQAEQVA.AEAAGWITRDEHG.QAEEISVKAARRRWYEKMMHATLVRRREAALKGKREKALAEQPYDDRAYAMSVHLIRTLPKDELHALSPEQFTQRVRSHLYQLDLGLEREPPH
>dsc prediction     
---HHHHH-----------HHHHHH-------EEE--HHHHHHHH---------------------HHH------HHHHHHHH---------EEEE------EEEHHH---HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE----------HHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHEEE---------HHHHH-----EEE--HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHEE--------

>nnssp prediction   
HHHHHHHHH--------HHHHHHHHH------EEEE---HHHHHHH--------------------HHHHHHHH-HHHHHHHH------HHHHHHHH----EEEEHHHHH--------HHHHHHHHHHHHEEE------------HHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EE-----------------EEEE-HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------

>pblock prediction  
HHHHHHH-----------HHHHHHH----HHHEEEHHH-H----------------------------------------H-H-------H-H----------EEHHH----------HHHHHHHHHE-EEEE--------------HHHHHH--------HE----EEEEH-HHHHHHHHHHH---------HH---------EEEEHH---HHHHHH-HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----HHHH-HHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH--------

>phd prediction     
-----E-------------EEEEE-------EEEEE------------------------------HHH------HHHHHHHE--------EEEE--------EEEHHH--------HHHHHHHHHH--EEEEEE-----E----HHHHHHH--------------EE---HHHHHHHHHHHHHHE-------------------EEE--HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------

>predator prediction
---HHHHHHHHH---------HHHHHH---EEEEEEE--HHHHHHHH--------------------------------EEEE------HHHHHHHHH----HHHHHHH----EEE--HHHHHHHHHHHHEEEEE----EEE--HHHHHHHHHHH------EEE---HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHH---EEEEE--HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHH------

>zpred prediction
HHHHHHE----------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-E----------------EE--------EEEEEEEEEEEEEE----HHHHHEEE-----EEEEHHH--------HHHHHHHHHEEEEEEEE--HHEEEEEEEHHHHHHHHHH------EEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHH--------EEEEEH--HHEHEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE-----HHH---HHHHHHH-EEEEEHHEEE-------

>jpred    
---HHHHH-----------HHHHHH------EEEEE---HHHHHH---------------------HHH------HHHHHHHE--------HEEEH------EEEHHHH--------HHHHHHHHHH-HEEEEEE-----E----HHHHHHH--------------EH--HHHHHHHHHHHHHHHE-------------------EEE--HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------

