JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_XJp4RFo.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E||||||||||||||||||||E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|0|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|5|7|7|5|3|0|1|0|1|2|5|6|2|3|4|4|5|7|8|7|6|5|0|4|5|6|7|7|7|7|7|7|7|6|6|4|3|4|3|4|5|5|2|6|8|9|9|9|8|7|1|0|2|1|2|5|7|7|7|7|6|4|3|1|6|8|7|6|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|5|0|4|7|7|7|7|2|2|4|7|8|8|7|6|2|4|8|8|9|9|9|9|8|8|7|3|2|2|5|7|7|1|0|1|2|3|7|8|9|9|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|1|7|8|8|7|0|2|7|8|7|7|5|1|2|8|9|8|9|9|8|7|1|3|3|3|3|0|1|0|1|5|6|5|5|5|3|3|5|6|7|7|7|6|5|5|4|3|0|2|1|1|3|6|7|7|7|7|6|7|7|7|7|6|4|0|3|1|4|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|5|2|3|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|3|1|6|7|8|7|7|7|7|7|6|4|2|8|9|9|9|9|9|9|8|6|1|2|8|8|8|7|4|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|3|6|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|1|1|1|2|3|2|5|7|7|8|8|7|6|3|2|1|1|4|5|1|0|2|2|8|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|3|7|8|8|8|7|6|5|1|7|8|8|8|7|4|2|7|6|2|4|8|9|9|9|9|8|7|2|2|9|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E||||||||||||||||||E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||E|E|||||||||||||||E|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*|*| | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 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