Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 D -5 -5 4 8 -7 -3 1 -5 -4 -7 -7 -4 -6 -7 -5 -3 -4 -8 -6 -7 0 0 16 79 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.11 1.88 2 K -2 1 -3 -4 -6 -1 1 -5 -2 -3 -3 3 -3 -4 7 -2 -3 -4 -6 -3 2 9 1 0 0 2 9 0 1 2 2 15 1 1 49 2 1 0 0 2 1.23 1.99 3 E 0 -1 -1 3 -6 1 5 -3 -3 -4 -5 3 -4 -7 -2 -2 -2 -7 -6 -4 10 2 2 14 0 4 40 1 0 1 1 18 0 0 2 2 2 0 0 1 0.86 2.00 4 E 2 2 -2 -2 -4 -1 3 0 -2 -4 -2 3 -1 -4 -3 -2 0 -3 -5 -4 16 12 1 1 0 2 22 9 1 1 4 18 2 1 1 3 5 0 0 1 0.46 2.02 5 L -2 -5 -5 -7 -5 -6 -6 -7 -5 0 3 -6 1 6 -5 -5 -3 1 4 1 3 0 0 0 0 0 0 0 0 5 27 0 4 37 0 0 1 1 11 8 1.15 2.02 6 K -1 3 0 0 -6 1 -1 -4 -2 -1 -1 4 4 -1 -2 -1 -2 0 -2 -3 5 13 5 4 0 5 4 1 1 3 6 25 10 3 2 4 3 2 2 2 0.39 2.04 7 K 1 1 -2 0 -4 1 4 -2 -2 -3 -4 4 -3 -5 -2 -1 -1 -6 -5 -3 10 6 2 5 0 6 30 3 1 2 1 24 1 0 2 4 3 0 0 1 0.63 2.04 8 L 2 -4 -3 -5 -5 -3 -3 -3 -2 2 3 -3 1 0 -4 -3 -1 -5 0 2 20 1 1 0 0 1 2 2 1 9 32 1 3 3 1 2 4 0 4 14 0.49 2.04 9 S 2 1 0 -4 3 -1 -4 -1 0 1 -1 -2 0 0 -5 0 0 1 1 2 15 8 4 1 5 3 1 5 2 7 6 2 2 4 0 8 5 2 6 15 0.21 2.04 10 Q -1 3 0 1 -5 2 1 -4 -2 -2 -2 5 1 -4 -4 -1 -1 -6 -4 -3 6 14 3 7 0 8 10 1 1 2 4 30 3 1 1 3 3 0 1 2 0.53 2.02 11 E 0 2 -1 2 -6 1 4 -2 -2 -4 -4 3 -1 -4 -3 -2 -2 2 -4 -3 8 9 2 9 0 6 31 3 1 1 1 16 1 1 1 3 2 3 0 2 0.58 2.05 12 A 1 -3 -4 -1 -1 -3 -3 -4 1 3 1 -1 2 3 -5 -3 -2 2 2 1 13 1 1 4 1 1 1 1 4 16 12 4 5 11 0 2 2 3 7 11 0.36 2.05 13 Y 0 2 0 -3 -4 -1 -2 -3 3 1 0 -1 2 0 -5 -1 1 0 4 0 6 10 5 1 0 3 2 2 7 7 10 4 5 4 0 4 10 1 12 7 0.25 2.05 14 N 0 3 0 1 -3 2 3 -2 -2 -4 -4 4 -3 -6 -3 -1 -2 -4 -5 -3 8 14 5 8 1 9 17 3 1 1 2 22 0 0 1 3 2 0 0 1 0.54 2.05 15 E 0 2 0 -1 -6 0 3 -3 0 -2 -1 2 0 -1 -4 -1 -1 -1 2 -2 9 11 5 4 0 4 17 2 3 2 7 14 2 2 0 3 3 1 7 3 0.27 2.03 16 I 0 -3 -3 -5 -2 -5 -6 -3 -4 5 2 -5 0 2 -2 -2 -1 -2 1 1 7 2 1 0 1 0 0 3 0 31 20 0 2 9 2 2 3 1 4 10 0.62 2.02 17 L 1 3 0 -3 -4 0 -2 -3 1 -1 0 3 2 -1 -4 -2 0 -2 1 0 13 14 4 1 0 4 2 1 3 3 10 17 5 2 0 3 5 1 4 6 0.26 2.01 18 N 1 -1 2 2 -6 0 3 -1 -3 -4 -4 2 -4 -4 -3 1 2 -6 -2 -4 11 2 8 11 0 4 21 6 0 1 1 10 0 1 1 8 12 0 2 1 0.42 2.02 19 S -1 -2 4 2 -5 -2 -2 -1 4 -5 -4 0 -4 -5 -3 3 0 0 0 -5 4 2 20 12 0 1 2 4 10 0 2 4 0 0 1 23 6 2 4 1 0.58 1.98 20 P -1 -2 -1 2 -5 -2 1 -1 -3 -4 -3 0 -2 -2 6 -1 -2 -3 -3 -3 6 2 2 13 0 2 8 4 1 1 3 6 1 2 41 4 2 0 1 2 0.87 1.95 21 G 1 -1 0 -1 -3 -1 -1 1 -1 0 0 0 1 0 -2 -1 0 -1 0 2 10 3 5 3 1 2 4 12 1 4 9 6 4 5 2 4 6 1 3 14 0.08 1.85 22 Y -1 -2 0 -3 1 0 -2 0 -2 0 0 -1 3 0 -3 -1 3 1 3 0 5 2 4 2 3 4 3 7 1 5 8 4 7 4 1 5 16 2 10 7 0.20 1.89 23 P -1 1 0 0 -5 3 2 0 0 -3 -3 3 -2 -3 2 0 -1 0 -2 -3 5 9 4 5 0 11 11 8 2 1 2 15 1 1 8 7 3 1 1 1 0.29 1.96 24 F 1 0 -2 0 -3 -1 0 2 -1 0 -2 2 1 1 -1 -1 0 2 -2 -2 10 4 2 6 1 3 5 18 2 6 5 11 3 5 3 4 5 3 2 3 0.14 1.96 25 W -3 -2 -6 -3 -5 -2 -5 -3 -3 1 3 -5 4 3 -4 -4 -2 6 4 -1 2 2 0 2 0 2 1 2 1 6 29 0 10 12 1 1 3 9 12 4 0.74 1.97 26 K 1 4 0 -4 -3 1 -2 0 3 -3 -4 1 1 -3 1 1 0 -6 -2 -3 12 19 4 1 1 5 1 7 8 2 1 10 4 1 8 10 5 0 1 1 0.38 1.97 27 R 0 2 0 1 -3 0 2 -1 -1 -2 -2 2 -2 -2 -3 -1 2 -2 -3 -1 9 9 4 9 1 4 14 4 1 2 4 13 1 2 1 4 12 1 1 4 0.23 1.96 28 Q -2 -2 -2 -4 -2 1 -3 0 2 0 2 -3 -1 2 -6 -2 -2 4 6 -1 2 2 2 1 1 7 1 7 5 5 16 1 1 9 0 3 2 6 24 4 0.57 1.98 29 G -3 -5 -4 -2 -6 -5 -3 7 -2 -6 -6 -5 -6 -6 -5 -3 -3 -6 -6 -3 1 0 0 2 0 0 2 88 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 2 2.03 1.95 30 T -2 -4 -3 -2 -4 -4 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -2 -4 -4 1 7 -6 -5 -3 1 1 1 2 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 10 74 0 0 1 1.49 2.03 31 M 2 -4 1 -3 -3 -2 -3 -1 -3 -2 0 -2 3 0 3 0 1 1 -3 0 20 1 8 1 0 1 1 6 1 2 8 2 7 3 15 7 9 2 1 5 0.32 1.98 32 A 1 -2 -1 -2 -1 1 -1 3 0 -1 -2 -2 1 0 -4 0 -2 -5 0 1 13 3 3 2 1 6 5 25 2 3 3 2 4 5 1 7 2 0 3 12 0.29 2.00 33 A 0 -4 1 -3 -2 -4 -1 1 -2 0 2 -4 3 0 -4 -1 0 1 0 0 9 1 7 2 1 0 5 12 1 5 22 1 6 3 1 5 7 2 4 7 0.22 1.98 34 V -1 -5 -2 -3 -1 -3 -4 -4 -2 2 1 -4 5 -1 -3 -2 0 2 1 4 5 0 2 2 1 1 1 1 1 10 14 0 13 3 2 2 7 2 4 28 0.52 1.91 35 E -1 0 4 3 -3 -1 2 -2 1 -2 -2 1 0 -5 -1 0 -1 -2 -2 -2 5 5 19 15 1 2 14 4 3 3 4 7 2 0 3 6 4 1 1 3 0.36 2.00 36 W 0 -3 -2 -3 -5 -3 -3 -2 0 3 0 -3 1 0 1 -1 -1 6 3 1 8 1 2 1 0 1 1 4 2 15 9 1 3 4 8 5 4 10 10 10 0.38 2.03 37 C 1 -3 -1 -4 0 -2 -4 0 3 1 1 -2 3 0 0 1 1 -1 0 0 10 1 2 1 2 2 1 7 7 9 13 2 7 4 4 9 8 1 4 5 0.18 1.98 38 N 0 -2 6 2 -2 1 -1 -1 3 -2 -3 -2 -1 -3 -2 0 -2 1 0 -3 8 2 32 12 1 5 4 4 7 2 2 2 2 1 2 7 2 2 3 2 0.57 1.96 39 T 0 -1 0 2 -2 0 4 -2 0 -3 -1 0 1 -3 -2 0 -1 -1 1 -1 9 3 3 9 1 5 26 4 2 1 7 5 3 1 2 6 3 1 6 4 0.28 1.96 40 N 0 1 1 -2 -2 0 -2 -2 2 0 1 1 3 0 -3 -1 -1 2 1 0 8 8 8 2 1 4 2 3 4 5 12 9 6 4 1 4 4 3 5 7 0.13 1.94 41 Y -2 -2 -1 0 -1 -2 -1 5 0 -3 -5 -1 0 0 -3 0 -2 4 0 -3 3 3 2 6 2 2 4 46 2 2 1 3 2 4 2 6 2 5 3 2 0.70 1.83 42 A 2 -2 -1 0 1 -1 -1 0 3 -1 -1 -1 3 0 -2 0 0 2 0 -2 17 2 3 6 3 2 4 7 6 4 7 3 8 4 2 7 6 3 3 3 0.14 1.82 43 L -1 -3 -3 -5 -1 -2 -2 -4 0 1 4 -5 1 2 -2 -2 1 4 1 0 4 2 2 0 2 2 2 2 2 7 37 0 3 7 2 3 8 6 4 5 0.48 1.88 44 P -1 -2 -4 -2 0 -4 -2 0 1 -2 -3 -4 -5 -6 7 -1 -1 1 -5 -2 6 3 0 2 2 0 3 7 4 2 3 0 0 0 54 4 4 2 0 3 1.24 1.86 45 T -1 0 0 -4 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 0 0 4 1 0 6 6 5 0 5 5 6 6 5 6 6 6 5 5 0 6 6 5 5 6 0.17 1.89 46 R 0 4 1 -1 -2 -1 -1 -3 1 -3 -2 3 1 2 -1 -2 -4 2 2 -5 7 23 8 3 1 2 4 2 3 1 4 17 3 8 3 2 0 2 6 0 0.44 1.83 47 N -3 1 7 -1 0 -3 -1 0 1 -6 -5 -1 0 -5 -2 -1 -3 -5 2 -5 2 8 55 2 2 0 3 6 3 0 0 3 2 0 2 3 0 0 8 0 1.14 1.81 48 F -2 -5 -2 -2 -5 -5 -5 -2 1 -2 -1 -2 0 6 -2 -1 -2 7 3 -2 3 0 2 2 0 0 0 4 3 2 5 3 2 34 3 5 2 16 10 2 0.99 1.96 49 S -1 3 0 -1 1 4 -1 -2 1 -2 -2 1 1 -1 -5 1 1 2 0 -2 4 13 4 3 3 17 3 3 3 3 3 7 3 3 0 9 9 3 3 3 0.29 2.09 50 D -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 51 G -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 4 -1 -1 -3 0 -2 0 0 0 2 3 0 -1 5 3 4 2 2 2 4 26 1 4 2 5 1 4 5 7 13 4 3 4 0.28 2.10 52 Y -2 2 -1 -1 -1 1 0 0 2 -2 -3 -1 -1 0 -2 1 1 3 3 0 3 10 3 3 1 7 5 7 4 2 3 3 1 4 2 11 9 3 10 7 0.18 2.09 53 F -3 -2 -1 0 1 -2 -2 -3 2 0 -1 -2 1 6 -2 -1 0 5 1 -2 2 2 3 6 3 2 2 2 4 4 7 2 3 32 2 5 5 7 4 3 0.57 2.09 54 E 0 -1 0 2 -5 0 3 -1 1 -5 -3 0 0 -1 2 -1 -1 2 0 -2 7 3 4 13 0 4 21 5 3 0 3 5 3 3 9 4 3 3 3 3 0.30 2.01 55 F -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 56 A 4 -2 -3 -2 -1 -2 -1 -1 1 1 -2 -2 -1 -1 -1 0 0 4 -1 0 35 2 1 2 1 1 4 4 4 7 4 2 1 3 3 6 5 6 2 7 0.38 2.08 57 R -1 2 -1 3 -6 -1 4 -2 -1 -3 -3 1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -2 6 9 3 14 0 2 28 3 2 2 2 7 1 3 4 5 2 1 2 3 0.40 2.03 58 S -1 2 2 0 -6 1 1 -1 0 -2 -2 3 -1 -2 -2 0 0 3 -1 -3 5 9 8 5 0 5 10 5 2 2 4 20 2 2 2 6 5 3 2 2 0.25 2.04 59 I -1 -2 -1 -2 0 -1 -2 -6 0 5 2 -2 1 1 -2 -2 -1 2 -1 1 4 2 4 2 2 3 3 0 3 30 16 2 3 6 2 3 3 2 2 8 0.43 2.04 60 D -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 -4 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.13 2.01 61 G 1 -1 0 -1 -1 -2 -2 5 -1 -2 -3 -1 -1 -3 1 -1 -2 2 -2 -2 9 4 4 4 1 1 3 39 2 3 2 3 2 1 6 5 2 3 1 4 0.50 2.07 62 Y -2 -1 -1 2 -6 0 5 -3 0 -2 -4 0 -1 -1 0 -2 -2 3 1 -2 4 3 3 9 0 3 36 2 2 2 2 6 2 3 5 3 2 4 5 3 0.53 2.05 63 T 2 0 1 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0 -2 -1 -5 -3 -4 -3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 76 0 0 0 4 0 0 0 0 13 1.12 0.96 401 E -2 0 -1 1 -4 1 2 -3 -2 -5 -4 5 -3 -5 -3 3 -2 -5 -4 -4 0 0 0 9 0 5 14 0 0 0 0 50 0 0 0 23 0 0 0 0 0.79 0.70 K Lambda Standard Ungapped 0.1371 0.3177 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1053 0.3177 PSI Gapped 0.0322 0.2670